MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF UN0451.1 Gli1-2-3 letter-probability matrix: alength= 4 w= 22 nsites= 1000 E= 0 0.268000 0.304000 0.234000 0.194000 0.266266 0.289289 0.246246 0.198198 0.278000 0.271000 0.253000 0.198000 0.273000 0.282000 0.242000 0.203000 0.275000 0.263000 0.261000 0.201000 0.258000 0.281000 0.249000 0.212000 0.281281 0.302302 0.232232 0.184184 0.087000 0.118000 0.684000 0.111000 0.665335 0.183816 0.124875 0.025974 0.048000 0.901000 0.022000 0.029000 0.022000 0.925000 0.031000 0.022000 0.724000 0.153000 0.058000 0.065000 0.036000 0.934000 0.015000 0.015000 0.134865 0.832168 0.019980 0.012987 0.094094 0.782783 0.050050 0.073073 0.468000 0.241000 0.168000 0.123000 0.197197 0.457457 0.191191 0.154154 0.282000 0.314000 0.251000 0.153000 0.290000 0.283000 0.208000 0.219000 0.267000 0.315000 0.204000 0.214000 0.209000 0.292000 0.317000 0.182000 0.267000 0.335000 0.181000 0.217000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/UN0451.1 MOTIF MA0734.3 Gli2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 13 nsites= 2492 E= 0 0.262440 0.284109 0.287319 0.166132 0.392456 0.134430 0.365971 0.107143 0.024077 0.038523 0.903291 0.034109 0.770465 0.091091 0.135233 0.003210 0.017657 0.964687 0.010835 0.006822 0.003210 0.988764 0.005217 0.002809 0.889246 0.016051 0.032905 0.061798 0.003612 0.983547 0.004815 0.008026 0.125602 0.860754 0.008026 0.005618 0.023676 0.918138 0.030899 0.027287 0.843098 0.034109 0.077448 0.045345 0.119984 0.375201 0.414125 0.090690 0.297352 0.224318 0.367576 0.110754 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0734.3 MOTIF UN0452.1 Glis letter-probability matrix: alength= 4 w= 22 nsites= 1001 E= 0 0.271728 0.335664 0.192807 0.199800 0.273000 0.338000 0.189000 0.200000 0.289000 0.325000 0.187000 0.199000 0.295000 0.318000 0.184000 0.203000 0.296000 0.307000 0.183000 0.214000 0.290290 0.301301 0.186186 0.222222 0.269000 0.295000 0.207000 0.229000 0.161000 0.210000 0.463000 0.166000 0.561439 0.260739 0.122877 0.054945 0.092000 0.834000 0.043000 0.031000 0.042042 0.923924 0.020020 0.014014 0.050050 0.906907 0.009009 0.034034 0.020000 0.965000 0.007000 0.008000 0.044955 0.936064 0.007992 0.010989 0.072000 0.821000 0.036000 0.071000 0.223000 0.464000 0.197000 0.116000 0.179820 0.467532 0.208791 0.143856 0.268731 0.325674 0.269730 0.135864 0.289000 0.288000 0.262000 0.161000 0.284715 0.297702 0.246753 0.170829 0.237000 0.301000 0.294000 0.168000 0.258000 0.327000 0.221000 0.194000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/UN0452.1 MOTIF MA1019.1 Glyma19g26560.1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 1001 E= 0 0.103896 0.198801 0.479520 0.217782 0.019000 0.014000 0.908000 0.059000 0.086086 0.019019 0.861862 0.033033 0.109000 0.307000 0.440000 0.144000 0.042000 0.882000 0.027000 0.049000 0.003000 0.996000 0.001000 0.000000 0.004000 0.976000 0.000000 0.020000 0.896000 0.017000 0.076000 0.011000 0.017000 0.844000 0.050000 0.089000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1019.1 MOTIF MA0615.1 Gmeb1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 17 nsites= 100 E= 0 0.170000 0.260000 0.350000 0.220000 0.340000 0.310000 0.150000 0.200000 0.110000 0.230000 0.350000 0.310000 0.130000 0.220000 0.290000 0.360000 0.130000 0.070000 0.400000 0.400000 0.049505 0.039604 0.326733 0.584158 0.710000 0.010000 0.280000 0.000000 0.000000 0.990000 0.000000 0.010000 0.010000 0.000000 0.990000 0.000000 0.000000 0.280000 0.010000 0.710000 0.584158 0.326733 0.039604 0.049505 0.400000 0.400000 0.070000 0.130000 0.210000 0.230000 0.370000 0.190000 0.435644 0.148515 0.178218 0.237624 0.180000 0.260000 0.230000 0.330000 0.272727 0.212121 0.313131 0.202020 0.240000 0.250000 0.270000 0.240000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0615.1 MOTIF MA0190.1 Gsc letter-probability matrix: alength= 4 w= 6 nsites= 22 E= 0 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.636364 0.090909 0.272727 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0190.1 MOTIF MA1876.1 Gsx letter-probability matrix: alength= 4 w= 20 nsites= 1000 E= 0 0.852000 0.032000 0.039000 0.077000 0.152000 0.126000 0.054000 0.668000 0.202000 0.090000 0.270000 0.438000 0.436000 0.121000 0.274000 0.169000 0.193000 0.277000 0.313000 0.217000 0.380000 0.195000 0.152000 0.273000 0.416000 0.154000 0.165000 0.265000 0.215000 0.048000 0.070000 0.667000 0.063936 0.041958 0.043956 0.850150 0.114000 0.015000 0.013000 0.858000 0.951000 0.009000 0.027000 0.013000 0.943000 0.010000 0.011000 0.036000 0.052000 0.030000 0.014000 0.904000 0.231000 0.118000 0.200000 0.451000 0.365634 0.169830 0.259740 0.204795 0.204000 0.295000 0.252000 0.249000 0.307000 0.256000 0.142000 0.295000 0.423423 0.174174 0.146146 0.256256 0.311000 0.081000 0.106000 0.502000 0.137000 0.093000 0.067000 0.703000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1876.1 MOTIF MA0448.1 H2.0 letter-probability matrix: alength= 4 w= 7 nsites= 32 E= 0 0.187500 0.093750 0.125000 0.593750 0.062500 0.031250 0.000000 0.906250 0.500000 0.031250 0.031250 0.437500 0.968750 0.000000 0.000000 0.031250 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.250000 0.000000 0.281250 0.468750 0.750000 0.000000 0.218750 0.031250 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0448.1 MOTIF MA0310.1 HAC1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 101 E= 0 0.237624 0.059406 0.554455 0.148515 0.680000 0.320000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.270000 0.180000 0.410000 0.140000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0310.1 MOTIF MA0311.1 HAL9 letter-probability matrix: alength= 4 w= 5 nsites= 99 E= 0 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.626263 0.000000 0.373737 0.000000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0311.1