MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF UN0399.1 GEBP letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 1000 E= 0 0.143010 0.036020 0.606633 0.214337 0.027268 0.972192 0.000270 0.000270 0.000250 0.000250 0.999251 0.000250 0.000250 0.000250 0.949301 0.050200 0.000250 0.999251 0.000250 0.000250 0.000250 0.974276 0.000250 0.025225 0.054266 0.000270 0.810205 0.135259 0.160144 0.040335 0.559505 0.240016 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/UN0399.1 MOTIF MA0038.2 GFI1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 30146 E= 0 0.121675 0.383965 0.244676 0.249685 0.624095 0.331019 0.026468 0.018417 0.999934 0.000066 0.000000 0.000000 0.999967 0.000000 0.000000 0.000033 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000497 0.999171 0.000000 0.000332 0.948329 0.000000 0.000000 0.051671 0.025789 0.854562 0.119649 0.000000 0.257007 0.001791 0.276943 0.464258 0.074091 0.008591 0.888638 0.028680 0.009158 0.874737 0.000000 0.116105 0.554384 0.173185 0.135304 0.137128 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0038.2 MOTIF MA0306.1 GIS1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 0 0.410000 0.220000 0.120000 0.250000 0.000000 0.970000 0.000000 0.030000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.870000 0.000000 0.130000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.490000 0.040000 0.150000 0.320000 0.460000 0.110000 0.160000 0.270000 0.323232 0.191919 0.181818 0.303030 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0306.1 MOTIF MA0734.1 GLI2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 2172 E= 0 0.160221 0.084715 0.661602 0.093462 0.072562 0.814626 0.065760 0.047052 0.010674 0.006671 0.958639 0.024016 0.882136 0.090853 0.017802 0.009208 0.004118 0.986273 0.004118 0.005491 0.000000 0.991718 0.005521 0.002761 0.972260 0.014208 0.004060 0.009472 0.003434 0.986951 0.006181 0.003434 0.493389 0.268615 0.162143 0.075852 0.158586 0.725758 0.046465 0.069192 0.275000 0.047951 0.088115 0.588934 0.300107 0.078676 0.511570 0.109648 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0734.1 MOTIF MA0734.2 GLI2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 15 nsites= 16444 E= 0 0.318292 0.298042 0.285940 0.097726 0.005180 0.012656 0.939310 0.042854 0.752188 0.154002 0.093810 0.000000 0.000000 0.999513 0.000000 0.000487 0.000000 0.999939 0.000000 0.000061 0.936208 0.040093 0.005761 0.017938 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.180400 0.819600 0.000000 0.000000 0.010092 0.979937 0.000786 0.009185 0.965960 0.000418 0.032189 0.001433 0.066337 0.849299 0.038142 0.046221 0.153585 0.188341 0.605596 0.052477 0.374600 0.089062 0.160065 0.376273 0.212548 0.440757 0.065517 0.281178 0.027917 0.069764 0.859196 0.043124 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0734.2 MOTIF MA1491.1 GLI3 letter-probability matrix: alength= 4 w= 15 nsites= 27502 E= 0 0.336885 0.287725 0.280052 0.095339 0.008640 0.011325 0.915454 0.064581 0.718195 0.164438 0.117243 0.000124 0.003516 0.996122 0.000362 0.000000 0.000362 0.999586 0.000052 0.000000 0.854190 0.103861 0.009113 0.032835 0.000155 0.999586 0.000207 0.000052 0.216029 0.783841 0.000043 0.000087 0.026741 0.956141 0.000760 0.016359 0.926417 0.000000 0.073583 0.000000 0.095130 0.780147 0.059184 0.065538 0.190302 0.222108 0.521395 0.066194 0.321687 0.127418 0.203961 0.346933 0.242454 0.423455 0.088060 0.246031 0.041561 0.114479 0.768469 0.075491 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1491.1 MOTIF MA1491.2 GLI3 letter-probability matrix: alength= 4 w= 16 nsites= 10666 E= 0 0.379805 0.163885 0.418526 0.037784 0.001044 0.000348 0.987475 0.011133 0.919844 0.039430 0.040618 0.000108 0.000470 0.999530 0.000000 0.000000 0.000117 0.999648 0.000117 0.000117 0.962364 0.026673 0.001017 0.009946 0.000117 0.999765 0.000000 0.000117 0.085359 0.914406 0.000117 0.000117 0.003387 0.994511 0.000117 0.001986 0.993350 0.000233 0.006183 0.000233 0.063435 0.916878 0.010131 0.009556 0.067936 0.063427 0.853206 0.015431 0.388657 0.027315 0.038723 0.545305 0.264357 0.427951 0.038990 0.268702 0.004954 0.021394 0.958788 0.014863 0.311450 0.345038 0.072578 0.270934 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1491.2 MOTIF UN0556.1 GLI4 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 1000 E= 0 0.274573 0.266026 0.368590 0.090812 0.278846 0.261752 0.385684 0.073718 0.338675 0.125000 0.501068 0.035256 0.206197 0.001068 0.791666 0.001068 0.001068 0.077991 0.868590 0.052350 0.035256 0.872863 0.043803 0.048077 0.035256 0.783119 0.154915 0.026709 0.001068 0.257479 0.197650 0.543803 0.001068 0.107906 0.419872 0.471154 0.001068 0.001068 0.996795 0.001068 0.975427 0.022436 0.001068 0.001068 0.663461 0.001068 0.334402 0.001068 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/UN0556.1 MOTIF MA0735.1 GLIS1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 16 nsites= 6069 E= 0 0.533202 0.303510 0.016477 0.146812 0.000310 0.004545 0.890186 0.104959 0.997788 0.000000 0.000948 0.001264 0.000000 0.999584 0.000416 0.000000 0.000837 0.998116 0.000419 0.000628 0.000000 0.997712 0.002288 0.000000 0.000622 0.997928 0.001036 0.000414 0.000000 0.998513 0.000000 0.001487 0.001328 0.997123 0.001107 0.000443 0.975683 0.000432 0.023022 0.000863 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000690 0.000000 0.994280 0.005030 0.736539 0.000512 0.004093 0.258857 0.408204 0.192197 0.000000 0.399598 0.000729 0.000520 0.996253 0.002498 0.136378 0.485996 0.213877 0.163749 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0735.1 MOTIF MA0736.1 GLIS2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 14 nsites= 1621 E= 0 0.045651 0.110426 0.573103 0.270820 0.783237 0.090559 0.125241 0.000963 0.002770 0.989843 0.002770 0.004617 0.003707 0.995366 0.000000 0.000927 0.006393 0.980822 0.000000 0.012785 0.001837 0.998163 0.000000 0.000000 0.049955 0.946476 0.000000 0.003568 0.043046 0.874172 0.000828 0.081954 0.296616 0.008639 0.658747 0.035997 0.002542 0.915254 0.023729 0.058475 0.312670 0.024523 0.619210 0.043597 0.503119 0.016632 0.243243 0.237006 0.414883 0.270133 0.114169 0.200815 0.011398 0.142097 0.798632 0.047872 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0736.1