MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF MA0614.1 Foxj2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 999 E= 0 0.461461 0.000000 0.538539 0.000000 0.050050 0.025025 0.000000 0.924925 0.795000 0.205000 0.000000 0.000000 0.977978 0.000000 0.000000 0.022022 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.954000 0.000000 0.046000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.593594 0.125125 0.125125 0.156156 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0614.1 MOTIF MA0851.1 Foxj3 letter-probability matrix: alength= 4 w= 17 nsites= 100 E= 0 0.270000 0.260000 0.210000 0.260000 0.340000 0.130000 0.310000 0.220000 0.480000 0.190000 0.160000 0.170000 0.510000 0.130000 0.170000 0.190000 0.346535 0.128713 0.326733 0.198020 0.303030 0.010101 0.686869 0.000000 0.010000 0.020000 0.000000 0.970000 0.919192 0.080808 0.000000 0.000000 0.950495 0.019802 0.000000 0.029703 0.990000 0.000000 0.000000 0.010000 0.000000 0.818182 0.000000 0.181818 0.990000 0.000000 0.000000 0.010000 0.782178 0.069307 0.059406 0.089109 0.570000 0.090000 0.070000 0.270000 0.220000 0.340000 0.260000 0.180000 0.270000 0.270000 0.240000 0.220000 0.242424 0.393939 0.171717 0.191919 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0851.1 MOTIF MA0852.1 Foxk1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 17 nsites= 100 E= 0 0.340000 0.190000 0.210000 0.260000 0.405941 0.118812 0.277228 0.198020 0.600000 0.070000 0.120000 0.210000 0.710000 0.040000 0.050000 0.200000 0.120000 0.120000 0.180000 0.580000 0.200000 0.010000 0.790000 0.000000 0.020202 0.000000 0.000000 0.979798 0.920000 0.080000 0.000000 0.000000 0.970000 0.010000 0.000000 0.020000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.890000 0.000000 0.110000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.808081 0.060606 0.020202 0.111111 0.565657 0.090909 0.101010 0.242424 0.270000 0.300000 0.290000 0.140000 0.340000 0.220000 0.250000 0.190000 0.151515 0.272727 0.323232 0.252525 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0852.1 MOTIF MA1607.1 Foxl2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 14 nsites= 18101 E= 0 0.344456 0.167449 0.255290 0.232805 0.326667 0.160875 0.194520 0.317938 0.355395 0.087067 0.088338 0.469201 0.616430 0.113309 0.116402 0.153859 0.164908 0.049500 0.075742 0.709850 0.144025 0.020275 0.809237 0.026463 0.060604 0.016629 0.023148 0.899619 0.951715 0.030827 0.006188 0.011270 0.950887 0.018563 0.010331 0.020220 0.947240 0.011933 0.022706 0.018121 0.015579 0.867245 0.008342 0.108834 0.863101 0.044583 0.022153 0.070162 0.288879 0.234573 0.212364 0.264184 0.284128 0.239158 0.250207 0.226507 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1607.1 MOTIF MA1684.1 Foxn1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 6 nsites= 5235 E= 0 0.279656 0.000000 0.488634 0.231710 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.436867 0.563133 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1684.1 MOTIF MA0480.1 Foxo1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 2490 E= 0 0.187952 0.111245 0.191968 0.508835 0.051004 0.513655 0.302008 0.133333 0.034940 0.564659 0.083936 0.316466 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.115261 0.884739 0.751406 0.063052 0.000000 0.185542 0.000000 0.806024 0.000000 0.193976 0.430522 0.230120 0.028514 0.310843 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0480.1 MOTIF MA0480.2 Foxo1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 14116 E= 0 0.304831 0.225985 0.252834 0.216350 0.301998 0.118801 0.238949 0.340252 0.099957 0.034075 0.826721 0.039246 0.066945 0.039317 0.072613 0.821125 0.879003 0.066166 0.033862 0.020969 0.897067 0.060145 0.027203 0.015585 0.918957 0.027416 0.035988 0.017640 0.020757 0.900397 0.025220 0.053627 0.944460 0.019623 0.010839 0.025078 0.256517 0.260768 0.286979 0.195735 0.287688 0.242774 0.247521 0.222018 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0480.2 MOTIF MA0157.3 Foxo3 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 23912 E= 0 0.282285 0.221144 0.240423 0.256148 0.321763 0.105135 0.227375 0.345726 0.145115 0.024674 0.803028 0.027183 0.064654 0.018192 0.050142 0.867012 0.930077 0.040482 0.013717 0.015724 0.932084 0.033581 0.013926 0.020408 0.943083 0.020199 0.019404 0.017313 0.016853 0.888131 0.015097 0.079918 0.925937 0.024548 0.015097 0.034418 0.431750 0.193418 0.216000 0.158832 0.294789 0.238081 0.274256 0.192874 0.274005 0.246822 0.238039 0.241134 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0157.3 MOTIF MA0040.1 Foxq1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 18 E= 0 0.222222 0.222222 0.166667 0.388889 0.722222 0.055556 0.166667 0.055556 0.277778 0.111111 0.000000 0.611111 0.166667 0.000000 0.000000 0.833333 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.944444 0.000000 0.055556 0.000000 0.000000 0.055556 0.222222 0.722222 0.333333 0.000000 0.166667 0.500000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0040.1 MOTIF MA0062.1 GABPA letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 7 E= 0 0.714286 0.142857 0.142857 0.000000 0.142857 0.714286 0.142857 0.000000 0.142857 0.857143 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.428571 0.142857 0.142857 0.285714 0.000000 0.285714 0.571429 0.142857 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0062.1