MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF MA1868.1 FoxI-c letter-probability matrix: alength= 4 w= 20 nsites= 1000 E= 0 0.321000 0.189000 0.264000 0.226000 0.271271 0.271271 0.203203 0.254254 0.222000 0.302000 0.349000 0.127000 0.194000 0.164000 0.299000 0.343000 0.324324 0.197197 0.239239 0.239239 0.135000 0.257000 0.419000 0.189000 0.213213 0.213213 0.320320 0.253253 0.829000 0.049000 0.073000 0.049000 0.024000 0.049000 0.061000 0.866000 0.037000 0.024000 0.890000 0.049000 0.024024 0.073073 0.024024 0.878879 0.048951 0.048951 0.048951 0.853147 0.109890 0.036963 0.048951 0.804196 0.213000 0.200000 0.227000 0.360000 0.212000 0.167000 0.288000 0.333000 0.259000 0.172000 0.241000 0.328000 0.148000 0.259000 0.278000 0.315000 0.200000 0.200000 0.320000 0.280000 0.220000 0.122000 0.268000 0.390000 0.273000 0.242000 0.394000 0.091000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1868.1 MOTIF MA1869.1 FoxK letter-probability matrix: alength= 4 w= 20 nsites= 1000 E= 0 0.240000 0.167000 0.276000 0.317000 0.234000 0.162000 0.264000 0.340000 0.218218 0.163163 0.283283 0.335335 0.204000 0.155000 0.274000 0.367000 0.204000 0.159000 0.291000 0.346000 0.223000 0.138000 0.228000 0.411000 0.210789 0.112887 0.271728 0.404595 0.019019 0.017017 0.018018 0.945946 0.093906 0.008991 0.867133 0.029970 0.017017 0.017017 0.016016 0.949950 0.068000 0.012000 0.086000 0.834000 0.017982 0.013986 0.053946 0.914086 0.659660 0.023023 0.187187 0.130130 0.097097 0.254254 0.166166 0.482482 0.300699 0.123876 0.224775 0.350649 0.240000 0.142000 0.220000 0.398000 0.286000 0.136000 0.216000 0.362000 0.217000 0.211000 0.226000 0.346000 0.293000 0.155000 0.248000 0.304000 0.259740 0.169830 0.244755 0.325674 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1869.1 MOTIF MA1870.1 FoxL2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 20 nsites= 1000 E= 0 0.339000 0.228000 0.185000 0.248000 0.341658 0.223776 0.154845 0.279720 0.400000 0.162000 0.155000 0.283000 0.420000 0.147000 0.075000 0.358000 0.506507 0.141141 0.135135 0.217217 0.344655 0.247752 0.096903 0.310689 0.547000 0.091000 0.183000 0.179000 0.115000 0.168000 0.010000 0.707000 0.961000 0.017000 0.006000 0.016000 0.833000 0.106000 0.005000 0.056000 0.957000 0.008000 0.021000 0.014000 0.019000 0.867000 0.006000 0.108000 0.951000 0.013000 0.012000 0.024000 0.523000 0.176000 0.067000 0.234000 0.447552 0.195804 0.121878 0.234765 0.315000 0.339000 0.142000 0.204000 0.428428 0.220220 0.147147 0.204204 0.338000 0.282000 0.153000 0.227000 0.350000 0.247000 0.161000 0.242000 0.338000 0.262000 0.163000 0.237000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1870.1 MOTIF MA1871.1 FoxM letter-probability matrix: alength= 4 w= 20 nsites= 1000 E= 0 0.351000 0.329000 0.099000 0.221000 0.539461 0.158841 0.113886 0.187812 0.522523 0.148148 0.104104 0.225225 0.519000 0.177000 0.096000 0.208000 0.461538 0.246753 0.089910 0.201798 0.632000 0.163000 0.129000 0.076000 0.449000 0.265000 0.049000 0.237000 0.817818 0.082082 0.011011 0.089089 0.926000 0.034000 0.009000 0.031000 0.957958 0.012012 0.014014 0.016016 0.103000 0.785000 0.014000 0.098000 0.968000 0.012000 0.009000 0.011000 0.828000 0.051000 0.025000 0.096000 0.408408 0.247247 0.121121 0.223223 0.418000 0.235000 0.143000 0.204000 0.480000 0.219000 0.096000 0.205000 0.385000 0.280000 0.131000 0.204000 0.445554 0.210789 0.128871 0.214785 0.409409 0.224224 0.147147 0.219219 0.390000 0.252000 0.148000 0.210000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1871.1 MOTIF MA1872.1 FoxO letter-probability matrix: alength= 4 w= 20 nsites= 999 E= 0 0.258258 0.229229 0.237237 0.275275 0.327000 0.193000 0.305000 0.175000 0.334665 0.179820 0.133866 0.351648 0.390000 0.224000 0.172000 0.214000 0.560561 0.105105 0.103103 0.231231 0.584585 0.089089 0.121121 0.205205 0.213000 0.408000 0.130000 0.249000 0.720721 0.032032 0.072072 0.175175 0.014985 0.011988 0.004995 0.968032 0.179000 0.005000 0.787000 0.029000 0.008000 0.015000 0.007000 0.970000 0.023000 0.008000 0.031000 0.938000 0.070000 0.009000 0.114000 0.807000 0.353000 0.048000 0.238000 0.361000 0.047952 0.331668 0.192807 0.427572 0.216000 0.210000 0.294000 0.280000 0.238238 0.213213 0.185185 0.363363 0.230230 0.206206 0.242242 0.321321 0.237000 0.226000 0.227000 0.310000 0.257000 0.186000 0.227000 0.330000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1872.1 MOTIF MA1873.1 FoxQ letter-probability matrix: alength= 4 w= 20 nsites= 1000 E= 0 0.298000 0.188000 0.212000 0.302000 0.264735 0.195804 0.215784 0.323676 0.288000 0.192000 0.216000 0.304000 0.263736 0.190809 0.214785 0.330669 0.354000 0.146000 0.204000 0.296000 0.309000 0.191000 0.173000 0.327000 0.304000 0.145000 0.161000 0.390000 0.079079 0.066066 0.804805 0.050050 0.044000 0.040000 0.029000 0.887000 0.074000 0.015000 0.051000 0.860000 0.035000 0.016000 0.034000 0.915000 0.879121 0.017982 0.060939 0.041958 0.050000 0.098000 0.042000 0.810000 0.344344 0.153153 0.218218 0.284284 0.257742 0.194805 0.168831 0.378621 0.337000 0.159000 0.180000 0.324000 0.303696 0.183816 0.204795 0.307692 0.291291 0.191191 0.212212 0.305305 0.271271 0.205205 0.218218 0.305305 0.273726 0.191808 0.230769 0.303696 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1873.1 MOTIF MA0047.1 Foxa2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 17 E= 0 0.352941 0.411765 0.176471 0.058824 0.647059 0.176471 0.058824 0.117647 0.470588 0.176471 0.058824 0.294118 0.000000 0.058824 0.000000 0.941176 0.647059 0.000000 0.352941 0.000000 0.000000 0.058824 0.000000 0.941176 0.000000 0.058824 0.000000 0.941176 0.000000 0.000000 0.352941 0.647059 0.529412 0.000000 0.470588 0.000000 0.000000 0.529412 0.000000 0.470588 0.058824 0.058824 0.058824 0.823529 0.000000 0.294118 0.000000 0.705882 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0047.1 MOTIF MA0047.2 Foxa2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 808 E= 0 0.001238 0.001238 0.001238 0.996287 0.273177 0.003708 0.719407 0.003708 0.001236 0.001236 0.001236 0.996292 0.001236 0.003708 0.044499 0.950556 0.001233 0.001233 0.215783 0.781751 0.908642 0.004938 0.082716 0.003704 0.002469 0.895062 0.002469 0.100000 0.417800 0.095179 0.003708 0.483313 0.061805 0.327565 0.071693 0.538937 0.516729 0.007435 0.029740 0.446097 0.162531 0.065757 0.598015 0.173697 0.160648 0.242839 0.361146 0.235367 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0047.2 MOTIF MA0041.1 Foxd3 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 47 E= 0 0.234043 0.063830 0.553191 0.148936 0.638298 0.042553 0.000000 0.319149 0.510638 0.021277 0.000000 0.468085 0.021277 0.085106 0.000000 0.893617 0.255319 0.000000 0.723404 0.021277 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.021277 0.000000 0.000000 0.978723 0.106383 0.000000 0.212766 0.680851 0.297872 0.000000 0.446809 0.255319 0.127660 0.148936 0.000000 0.723404 0.021277 0.042553 0.085106 0.851064 0.000000 0.255319 0.000000 0.744681 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0041.1 MOTIF MA1606.1 Foxf1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 59540 E= 0 0.388965 0.180601 0.209305 0.221129 0.290141 0.126973 0.139184 0.443702 0.311287 0.063050 0.564310 0.061354 0.009540 0.007491 0.019449 0.963520 0.962261 0.015099 0.007474 0.015166 0.905979 0.037773 0.013621 0.042627 0.960144 0.007978 0.017921 0.013957 0.007340 0.913571 0.008767 0.070322 0.947867 0.012513 0.007440 0.032180 0.313621 0.212345 0.240074 0.233960 0.341334 0.196758 0.215721 0.246187 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1606.1