MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF MA0030.1 FOXF2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 14 nsites= 27 E= 0 0.037037 0.370370 0.259259 0.333333 0.370370 0.259259 0.185185 0.185185 0.629630 0.148148 0.074074 0.148148 0.464286 0.178571 0.178571 0.178571 0.136364 0.500000 0.363636 0.000000 0.259259 0.000000 0.740741 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.925926 0.000000 0.074074 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.592593 0.148148 0.074074 0.185185 0.259259 0.148148 0.222222 0.370370 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0030.1 MOTIF MA0613.1 FOXG1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 999 E= 0 0.374374 0.001001 0.623624 0.001001 0.001000 0.001000 0.001000 0.997000 0.997000 0.001000 0.001000 0.001000 0.997000 0.001000 0.001000 0.001000 0.997000 0.001000 0.001000 0.001000 0.001000 0.997000 0.001000 0.001000 0.997000 0.001000 0.001000 0.001000 0.498000 0.167000 0.002000 0.333000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0613.1 MOTIF MA0479.1 FOXH1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 8211 E= 0 0.114359 0.345877 0.181464 0.358300 0.192181 0.284131 0.260261 0.263427 0.118500 0.397150 0.384362 0.099988 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.919133 0.000000 0.027889 0.052978 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.289124 0.703081 0.000000 0.007794 0.172208 0.827792 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.869322 0.000000 0.000000 0.130678 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0479.1 MOTIF MA0042.1 FOXI1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 31 E= 0 0.193548 0.032258 0.451613 0.322581 0.129032 0.258065 0.387097 0.225806 0.354839 0.129032 0.258065 0.258065 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.419355 0.000000 0.580645 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.483871 0.000000 0.516129 0.000000 0.000000 0.000000 0.225806 0.774194 0.258065 0.032258 0.129032 0.580645 0.064516 0.032258 0.129032 0.774194 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0042.1 MOTIF MA0042.2 FOXI1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 7 nsites= 5832 E= 0 0.105967 0.006687 0.887346 0.000000 0.013847 0.011228 0.006549 0.968376 0.899687 0.093880 0.006433 0.000000 0.995575 0.004425 0.000000 0.000000 0.977706 0.004345 0.005479 0.012469 0.025363 0.836026 0.007754 0.130856 0.992901 0.002302 0.004797 0.000000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0042.2 MOTIF MA1952.1 FOXJ2::ELF1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 14 nsites= 1514 E= 0 0.379789 0.157199 0.301189 0.161823 0.236616 0.158222 0.118547 0.486616 0.655979 0.175910 0.043328 0.124783 0.651743 0.140766 0.049935 0.157555 0.796423 0.103630 0.082588 0.017359 0.051379 0.818821 0.045430 0.084370 0.576762 0.391619 0.018286 0.013333 0.115919 0.063568 0.808761 0.011752 0.014964 0.000000 0.985036 0.000000 0.991487 0.000000 0.002620 0.005894 0.946250 0.000000 0.000000 0.053750 0.234439 0.056338 0.687869 0.021354 0.257596 0.147292 0.011229 0.583884 0.395641 0.101057 0.320343 0.182959 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1952.1 MOTIF UN0533.1 FOXJ2::HOXB13 letter-probability matrix: alength= 4 w= 14 nsites= 903 E= 0 0.344408 0.078627 0.501661 0.075305 0.000000 0.135214 0.122568 0.742218 0.769153 0.185484 0.033266 0.012097 0.759204 0.131343 0.045771 0.063682 0.810840 0.035069 0.154091 0.000000 0.019488 0.929354 0.051157 0.000000 0.415625 0.135417 0.069792 0.379167 0.385919 0.228162 0.000000 0.385919 0.733654 0.012500 0.235577 0.018269 0.000000 0.026059 0.145494 0.828447 0.719745 0.028025 0.000000 0.252229 0.997386 0.002614 0.000000 0.000000 0.943140 0.034611 0.000000 0.022250 0.582888 0.171123 0.116883 0.129106 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/UN0533.1 MOTIF UN0534.1 FOXJ2::PITX1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 260 E= 0 0.184615 0.088462 0.000000 0.726923 0.756000 0.012000 0.000000 0.232000 0.840000 0.000000 0.035556 0.124444 0.814655 0.012931 0.051724 0.120690 0.081851 0.672598 0.021352 0.224199 0.642857 0.098639 0.054422 0.204082 0.099237 0.000000 0.721374 0.179389 0.172996 0.029536 0.797468 0.000000 0.851351 0.108108 0.040541 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.018692 0.088785 0.009346 0.883178 0.828947 0.070175 0.052632 0.048246 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/UN0534.1 MOTIF MA0852.2 FOXK1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 14 nsites= 1056 E= 0 0.311553 0.174242 0.244318 0.269886 0.393939 0.165720 0.255682 0.184659 0.233902 0.134470 0.257576 0.374053 0.135417 0.026515 0.821970 0.016098 0.056818 0.004735 0.041667 0.896780 0.949811 0.035038 0.009470 0.005682 0.946023 0.035038 0.010417 0.008523 0.967803 0.012311 0.009470 0.010417 0.009470 0.907197 0.011364 0.071970 0.961174 0.015152 0.011364 0.012311 0.484848 0.188447 0.193182 0.133523 0.175189 0.190341 0.537879 0.096591 0.229167 0.254735 0.342803 0.173295 0.267992 0.272727 0.255682 0.203598 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0852.2 MOTIF MA1103.1 FOXK2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 7977 E= 0 0.419832 0.169613 0.196314 0.214241 0.254482 0.164849 0.194183 0.386486 0.227529 0.046258 0.677824 0.048389 0.014542 0.006644 0.017550 0.961264 0.969036 0.014918 0.007772 0.008274 0.881660 0.050144 0.014166 0.054030 0.965024 0.009402 0.007146 0.018428 0.011408 0.873010 0.009903 0.105679 0.962768 0.008399 0.014166 0.014667 0.304751 0.235051 0.222389 0.237809 0.277924 0.235928 0.336467 0.149680 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1103.1