MEME version 4

ALPHABET= ACGT

strands: + -

Background letter frequencies
A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25

MOTIF MA0467.1 Crx
letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 2097 E= 0
 0.575584  0.141631  0.218407  0.064378
 0.693371  0.020505  0.198856  0.087268
 0.165474  0.026228  0.701001  0.107296
 0.449690  0.105866  0.392465  0.051979
 0.245589  0.000000  0.750596  0.003815
 0.000000  0.000000  1.000000  0.000000
 0.778255  0.221745  0.000000  0.000000
 0.000000  0.000000  0.000000  1.000000
 0.000000  0.013829  0.000000  0.986171
 0.951359  0.000000  0.000000  0.048641
 0.259418  0.024797  0.632332  0.083453
URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0467.1

MOTIF MA0467.2 Crx
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 4333 E= 0
 0.241865  0.213016  0.313409  0.231710
 0.345488  0.154627  0.322871  0.177014
 0.004385  0.035772  0.952919  0.006924
 0.006000  0.008308  0.969305  0.016386
 0.975537  0.003923  0.009693  0.010847
 0.002539  0.007385  0.002077  0.987999
 0.011539  0.005770  0.004616  0.978075
 0.978768  0.005770  0.005308  0.010155
 0.311332  0.170552  0.312255  0.205862
 0.278098  0.265636  0.260097  0.196169
URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0467.2

MOTIF MA0445.1 D
letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 29 E= 0
 0.034483  0.275862  0.241379  0.448276
 0.000000  0.862069  0.000000  0.137931
 0.000000  0.586207  0.000000  0.413793
 0.689655  0.000000  0.000000  0.310345
 0.000000  0.000000  0.000000  1.000000
 0.000000  0.000000  0.103448  0.896552
 0.068966  0.000000  0.931034  0.000000
 0.000000  0.000000  0.000000  1.000000
 0.034483  0.068966  0.137931  0.758621
 0.137931  0.344828  0.206897  0.310345
 0.206897  0.034483  0.034483  0.724138
URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0445.1

MOTIF MA0289.1 DAL80
letter-probability matrix: alength= 4 w= 7 nsites= 101 E= 0
 0.108911  0.663366  0.059406  0.168317
 0.000000  0.000000  1.000000  0.000000
 1.000000  0.000000  0.000000  0.000000
 0.000000  0.000000  0.000000  1.000000
 1.000000  0.000000  0.000000  0.000000
 0.909091  0.010101  0.010101  0.070707
 0.030000  0.190000  0.750000  0.030000
URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0289.1

MOTIF MA0290.1 DAL81
letter-probability matrix: alength= 4 w= 19 nsites= 203 E= 0
 1.000000  0.000000  0.000000  0.000000
 1.000000  0.000000  0.000000  0.000000
 1.000000  0.000000  0.000000  0.000000
 1.000000  0.000000  0.000000  0.000000
 0.000000  0.000000  1.000000  0.000000
 0.000000  1.000000  0.000000  0.000000
 0.000000  1.000000  0.000000  0.000000
 0.000000  0.000000  1.000000  0.000000
 0.000000  1.000000  0.000000  0.000000
 0.000000  0.000000  1.000000  0.000000
 0.000000  0.000000  1.000000  0.000000
 0.000000  0.000000  1.000000  0.000000
 0.000000  1.000000  0.000000  0.000000
 0.000000  0.000000  1.000000  0.000000
 0.000000  0.000000  1.000000  0.000000
 0.000000  0.000000  1.000000  0.000000
 1.000000  0.000000  0.000000  0.000000
 0.000000  0.000000  0.000000  1.000000
 0.000000  0.000000  0.000000  1.000000
URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0290.1

MOTIF MA0291.1 DAL82
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 98 E= 0
 0.571429  0.142857  0.142857  0.142857
 0.524752  0.108911  0.049505  0.316832
 0.390000  0.030000  0.030000  0.550000
 0.260000  0.110000  0.420000  0.210000
 0.000000  0.260000  0.000000  0.740000
 0.000000  0.000000  1.000000  0.000000
 0.000000  1.000000  0.000000  0.000000
 0.000000  0.000000  1.000000  0.000000
 0.108911  0.673267  0.108911  0.108911
URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0291.1

MOTIF MA0639.1 DBP
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 7099 E= 0
 0.218622  0.241442  0.268066  0.271869
 0.445326  0.135785  0.407714  0.011175
 0.000703  0.000563  0.000281  0.998453
 0.000519  0.000778  0.078060  0.920643
 0.933965  0.000000  0.065509  0.000526
 0.000204  0.725452  0.002146  0.272198
 0.308798  0.001651  0.689454  0.000097
 0.000392  0.070710  0.000915  0.927983
 0.959330  0.038914  0.000946  0.000811
 0.999296  0.000141  0.000281  0.000281
 0.017953  0.421202  0.175321  0.385524
 0.362535  0.233380  0.246056  0.158028
URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0639.1

MOTIF MA1376.1 DEAR3
letter-probability matrix: alength= 4 w= 17 nsites= 597 E= 0
 0.321608  0.239531  0.150754  0.288107
 0.386935  0.102178  0.234506  0.276382
 0.373534  0.011725  0.187605  0.427136
 0.030151  0.010050  0.219430  0.740369
 0.000000  0.000000  1.000000  0.000000
 0.023451  0.001675  0.023451  0.951424
 0.000000  1.000000  0.000000  0.000000
 0.000000  0.000000  1.000000  0.000000
 0.000000  0.000000  0.998325  0.001675
 0.001675  0.118928  0.000000  0.879397
 0.003350  0.001675  0.991625  0.003350
 0.299832  0.167504  0.463987  0.068677
 0.261307  0.301508  0.130653  0.306533
 0.226131  0.140704  0.350084  0.283082
 0.262982  0.187605  0.299832  0.249581
 0.259631  0.268007  0.214405  0.257956
 0.319933  0.127303  0.313233  0.239531
URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1376.1

MOTIF MA1366.1 DF1
letter-probability matrix: alength= 4 w= 16 nsites= 480 E= 0
 0.608333  0.081250  0.231250  0.079167
 0.210417  0.468750  0.081250  0.239583
 0.310417  0.062500  0.608333  0.018750
 0.000000  0.000000  1.000000  0.000000
 0.000000  0.000000  0.000000  1.000000
 0.866667  0.000000  0.029167  0.104167
 1.000000  0.000000  0.000000  0.000000
 0.935417  0.006250  0.016667  0.041667
 0.791667  0.006250  0.000000  0.202083
 0.658333  0.064583  0.066667  0.210417
 0.397917  0.147917  0.152083  0.302083
 0.310417  0.085417  0.293750  0.310417
 0.341667  0.095833  0.195833  0.366667
 0.431250  0.097917  0.208333  0.262500
 0.516667  0.085417  0.110417  0.287500
 0.470833  0.106250  0.114583  0.308333
URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1366.1

MOTIF MA1192.1 DIV1
letter-probability matrix: alength= 4 w= 15 nsites= 580 E= 0
 0.424138  0.046552  0.043103  0.486207
 0.322414  0.112069  0.244828  0.320690
 0.375862  0.081034  0.098276  0.444828
 0.394828  0.012069  0.539655  0.053448
 0.000000  0.000000  0.991379  0.008621
 1.000000  0.000000  0.000000  0.000000
 0.000000  0.000000  0.000000  1.000000
 0.998276  0.000000  0.000000  0.001724
 0.996552  0.000000  0.001724  0.001724
 0.043103  0.091379  0.763793  0.101724
 0.389655  0.062069  0.446552  0.101724
 0.268966  0.106897  0.070690  0.553448
 0.263793  0.094828  0.112069  0.529310
 0.400000  0.091379  0.186207  0.322414
 0.324138  0.108621  0.225862  0.341379
URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1192.1

