MEME version 4

ALPHABET= ACGT

strands: + -

Background letter frequencies
A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25

MOTIF MA0444.1 CG34031
letter-probability matrix: alength= 4 w= 7 nsites= 25 E= 0
 0.000000  0.040000  0.040000  0.920000
 0.000000  0.000000  0.000000  1.000000
 0.880000  0.000000  0.000000  0.120000
 1.000000  0.000000  0.000000  0.000000
 0.080000  0.000000  0.000000  0.920000
 0.280000  0.000000  0.040000  0.680000
 0.120000  0.000000  0.880000  0.000000
URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0444.1

MOTIF MA0182.1 CG4328-RA
letter-probability matrix: alength= 4 w= 7 nsites= 30 E= 0
 0.400000  0.066667  0.100000  0.433333
 0.233333  0.033333  0.000000  0.733333
 0.433333  0.000000  0.000000  0.566667
 1.000000  0.000000  0.000000  0.000000
 0.000000  0.000000  0.000000  1.000000
 0.000000  0.000000  0.200000  0.800000
 0.500000  0.000000  0.500000  0.000000
URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0182.1

MOTIF MA0184.1 CG9876
letter-probability matrix: alength= 4 w= 7 nsites= 20 E= 0
 0.100000  0.450000  0.150000  0.300000
 0.000000  0.000000  0.000000  1.000000
 0.900000  0.000000  0.000000  0.100000
 1.000000  0.000000  0.000000  0.000000
 0.000000  0.000000  0.000000  1.000000
 0.000000  0.000000  0.050000  0.950000
 0.700000  0.000000  0.300000  0.000000
URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0184.1

MOTIF MA0283.1 CHA4
letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 0
 0.220000  0.050000  0.680000  0.050000
 0.000000  0.000000  1.000000  0.000000
 0.000000  1.000000  0.000000  0.000000
 0.000000  0.000000  1.000000  0.000000
 0.000000  0.000000  1.000000  0.000000
 0.717172  0.000000  0.282828  0.000000
 0.220000  0.010000  0.760000  0.010000
 0.484848  0.101010  0.101010  0.313131
URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0283.1

MOTIF MA0284.1 CIN5
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 0
 0.000000  0.000000  0.090000  0.910000
 0.131313  0.070707  0.232323  0.565657
 1.000000  0.000000  0.000000  0.000000
 0.108911  0.534653  0.049505  0.306931
 0.200000  0.160000  0.570000  0.070000
 0.000000  0.000000  0.000000  1.000000
 0.910000  0.090000  0.000000  0.000000
 1.000000  0.000000  0.000000  0.000000
 0.019802  0.138614  0.376238  0.465347
 0.150000  0.700000  0.080000  0.070000
URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0284.1

MOTIF MA0284.2 CIN5
letter-probability matrix: alength= 4 w= 14 nsites= 345 E= 0
 0.318841  0.217391  0.136232  0.327536
 0.275362  0.092754  0.402899  0.228986
 0.695652  0.133333  0.072464  0.098551
 0.008696  0.014493  0.014493  0.962319
 0.008696  0.005797  0.037681  0.947826
 0.968116  0.002899  0.008696  0.020290
 0.011594  0.791304  0.028986  0.168116
 0.646377  0.049275  0.255072  0.049275
 0.002899  0.002899  0.002899  0.991304
 0.930435  0.055072  0.008696  0.005797
 0.953623  0.008696  0.002899  0.034783
 0.072464  0.052174  0.168116  0.707246
 0.220290  0.521739  0.095652  0.162319
 0.420290  0.110145  0.214493  0.255072
URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0284.2

MOTIF MA0819.1 CLOCK
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 429 E= 0
 0.526807  0.081585  0.216783  0.174825
 0.696429  0.137987  0.144481  0.021104
 0.024775  0.966216  0.004505  0.004505
 0.955457  0.011136  0.033408  0.000000
 0.033827  0.906977  0.000000  0.059197
 0.085288  0.000000  0.914712  0.000000
 0.006787  0.011312  0.011312  0.970588
 0.000000  0.006803  0.972789  0.020408
 0.001445  0.219653  0.158960  0.619942
 0.206977  0.297674  0.090698  0.404651
URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0819.1

MOTIF MA0819.2 CLOCK
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 5744 E= 0
 0.349756  0.222493  0.235202  0.192549
 0.420469  0.122855  0.269360  0.187317
 0.655465  0.190538  0.124959  0.029038
 0.067749  0.932251  0.000000  0.000000
 0.973353  0.001453  0.025194  0.000000
 0.000000  0.867819  0.001728  0.130454
 0.107774  0.004859  0.887367  0.000000
 0.003319  0.041252  0.002845  0.952584
 0.002419  0.000484  0.971940  0.025157
 0.042281  0.349066  0.299246  0.309407
URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0819.2

MOTIF UN0099.1 CNI01970
letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 998 E= 0
 0.107214  0.142285  0.154309  0.596192
 0.025050  0.577154  0.067134  0.330661
 0.000000  0.000000  1.000000  0.000000
 0.000000  0.993994  0.006006  0.000000
 0.000000  1.000000  0.000000  0.000000
 0.774775  0.000000  0.225225  0.000000
 0.007007  0.957958  0.000000  0.035035
 0.165165  0.446446  0.029029  0.359359
URL http://jaspar.genereg.net/matrix/UN0099.1

MOTIF UN0396.1 CRC
letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 1000 E= 0
 0.035000  0.143333  0.080000  0.741667
 0.586667  0.048333  0.001667  0.363333
 0.995000  0.000000  0.000000  0.005000
 0.028333  0.000000  0.000000  0.971667
 0.000000  0.988333  0.011667  0.000000
 1.000000  0.000000  0.000000  0.000000
 0.000000  0.000000  0.005000  0.995000
 0.598334  0.073333  0.060000  0.268333
URL http://jaspar.genereg.net/matrix/UN0396.1

