MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF MA0279.2 CAD1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 16 nsites= 87 E= 0 0.333333 0.206897 0.172414 0.287356 0.172414 0.195402 0.229885 0.402299 0.137931 0.160920 0.126437 0.574713 0.057471 0.057471 0.781609 0.103448 0.298851 0.666667 0.034483 0.000000 0.011494 0.011494 0.000000 0.977011 0.011494 0.000000 0.206897 0.781609 0.977011 0.000000 0.011494 0.011494 0.068966 0.735632 0.126437 0.068966 0.114943 0.000000 0.034483 0.850575 0.942529 0.034483 0.000000 0.022989 0.977011 0.000000 0.011494 0.011494 0.057471 0.011494 0.160920 0.770115 0.287356 0.356322 0.160920 0.195402 0.333333 0.264368 0.218391 0.183908 0.321839 0.149425 0.264368 0.264368 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0279.2 MOTIF MA1197.1 CAMTA1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 598 E= 0 0.503344 0.093645 0.195652 0.207358 0.719064 0.076923 0.075251 0.128763 0.677258 0.010033 0.220736 0.091973 0.287625 0.234114 0.476589 0.001672 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.966555 0.000000 0.033445 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.005017 0.994983 0.105351 0.096990 0.545151 0.252508 0.392977 0.055184 0.260870 0.290970 0.396321 0.096990 0.284281 0.222408 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1197.1 MOTIF MA0969.1 CAMTA2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 1000 E= 0 0.313000 0.203000 0.220000 0.264000 0.327000 0.237000 0.176000 0.260000 0.393000 0.121000 0.243000 0.243000 0.220000 0.438000 0.306000 0.036000 0.026000 0.955000 0.008000 0.011000 0.018000 0.011000 0.970000 0.001000 0.031000 0.682000 0.007000 0.280000 0.008000 0.007000 0.970000 0.015000 0.007000 0.011000 0.054000 0.928000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0969.1 MOTIF MA0970.1 CAMTA3 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 1000 E= 0 0.233000 0.540000 0.184000 0.043000 0.013986 0.973027 0.004995 0.007992 0.032000 0.000000 0.962000 0.006000 0.068000 0.664000 0.001000 0.267000 0.037000 0.000000 0.963000 0.000000 0.001000 0.001000 0.000000 0.998000 0.230769 0.273726 0.210789 0.284715 0.290000 0.247000 0.250000 0.213000 0.240759 0.257742 0.250749 0.250749 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0970.1 MOTIF MA0280.1 CAT8 letter-probability matrix: alength= 4 w= 6 nsites= 100 E= 0 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.660000 0.130000 0.210000 0.000000 0.320000 0.180000 0.280000 0.220000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0280.1 MOTIF MA0281.1 CBF1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 99 E= 0 0.191919 0.080808 0.535354 0.191919 0.029703 0.910891 0.029703 0.029703 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.712871 0.168317 0.059406 0.059406 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0281.1 MOTIF MA0281.2 CBF1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 15 nsites= 256 E= 0 0.285156 0.171875 0.179688 0.363281 0.292969 0.128906 0.332031 0.246094 0.535156 0.054688 0.285156 0.125000 0.046875 0.078125 0.214844 0.660156 0.003906 0.992188 0.003906 0.000000 0.988281 0.000000 0.007812 0.003906 0.003906 0.949219 0.007812 0.039062 0.027344 0.000000 0.972656 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.003906 0.996094 0.000000 0.839844 0.093750 0.042969 0.023438 0.066406 0.570312 0.035156 0.328125 0.261719 0.363281 0.082031 0.292969 0.324219 0.195312 0.183594 0.296875 0.308594 0.128906 0.257812 0.304688 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0281.2 MOTIF MA0972.1 CCA1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 999 E= 0 0.934935 0.001001 0.010010 0.054054 0.960000 0.001000 0.037000 0.002000 0.985000 0.004000 0.010000 0.001000 0.035000 0.000000 0.005000 0.960000 0.992000 0.005000 0.001000 0.002000 0.001000 0.012000 0.001000 0.986000 0.005000 0.991000 0.000000 0.004000 0.021000 0.091000 0.014000 0.874000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0972.1 MOTIF MA0579.1 CDC5 letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 99 E= 0 0.282828 0.242424 0.323232 0.151515 0.170000 0.260000 0.550000 0.020000 0.000000 0.920000 0.040000 0.040000 0.020000 0.020000 0.000000 0.960000 0.060606 0.858586 0.000000 0.080808 0.919192 0.020202 0.020202 0.040404 0.020202 0.000000 0.939394 0.040404 0.020000 0.930000 0.050000 0.000000 0.040404 0.040404 0.919192 0.000000 0.020000 0.550000 0.270000 0.160000 0.180000 0.230000 0.450000 0.140000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0579.1 MOTIF MA0973.1 CDF2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 1001 E= 0 0.333666 0.283716 0.234765 0.147852 0.608000 0.092000 0.150000 0.150000 0.693000 0.016000 0.041000 0.250000 0.980981 0.010010 0.004004 0.005005 0.979000 0.010000 0.002000 0.009000 0.868000 0.029000 0.081000 0.022000 0.017017 0.007007 0.969970 0.006006 0.053000 0.295000 0.154000 0.498000 0.328000 0.077000 0.395000 0.200000 0.299000 0.282000 0.155000 0.264000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0973.1