MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF MA0463.1 Bcl6 letter-probability matrix: alength= 4 w= 14 nsites= 956 E= 0 0.199791 0.178870 0.256276 0.365063 0.036611 0.023013 0.029289 0.911088 0.005230 0.083682 0.031381 0.879707 0.031381 0.916318 0.025105 0.027197 0.000000 0.856695 0.000000 0.143305 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.466527 0.089958 0.422594 0.020921 0.148536 0.000000 0.851464 0.000000 0.984310 0.000000 0.011506 0.004184 0.671548 0.105649 0.183054 0.039749 0.643305 0.007322 0.222803 0.126569 0.105649 0.096234 0.658996 0.139121 0.197699 0.516736 0.121339 0.164226 0.385983 0.196653 0.173640 0.243724 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0463.1 MOTIF UN0443.1 Bcl6 letter-probability matrix: alength= 4 w= 22 nsites= 999 E= 0 0.261261 0.345345 0.198198 0.195195 0.284000 0.294000 0.213000 0.209000 0.282000 0.328000 0.209000 0.181000 0.280000 0.305000 0.210000 0.205000 0.255000 0.310000 0.236000 0.199000 0.183000 0.360000 0.188000 0.269000 0.239000 0.051000 0.612000 0.098000 0.051000 0.882000 0.020000 0.047000 0.241000 0.099000 0.016000 0.644000 0.092000 0.131000 0.041000 0.736000 0.006000 0.015000 0.009000 0.970000 0.004004 0.971972 0.006006 0.018018 0.014985 0.164835 0.587413 0.232767 0.945055 0.016983 0.015984 0.021978 0.103000 0.008000 0.880000 0.009000 0.060000 0.069000 0.802000 0.069000 0.789000 0.042000 0.091000 0.078000 0.797000 0.048000 0.057000 0.098000 0.229000 0.198000 0.078000 0.495000 0.191000 0.259000 0.225000 0.325000 0.191000 0.283000 0.231000 0.295000 0.211211 0.276276 0.218218 0.294294 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/UN0443.1 MOTIF MA0242.1 Bgb::run letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 29 E= 0 0.413793 0.068966 0.000000 0.517241 0.931034 0.000000 0.034483 0.034483 0.965517 0.000000 0.034483 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.965517 0.034483 0.000000 0.172414 0.034483 0.793103 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.965517 0.000000 0.000000 0.034483 0.689655 0.000000 0.310345 0.000000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0242.1 MOTIF MA0607.1 Bhlha15 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 1001 E= 0 0.142857 0.570430 0.285714 0.000999 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.200200 0.799800 0.799800 0.200200 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.001000 0.231000 0.154000 0.614000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0607.1 MOTIF MA1472.2 Bhlha15 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 21916 E= 0 0.239551 0.253377 0.288054 0.219018 0.324010 0.301652 0.247217 0.127122 0.692325 0.150484 0.131548 0.025643 0.012274 0.967147 0.016107 0.004472 0.969383 0.005795 0.007255 0.017567 0.005156 0.015012 0.953824 0.026008 0.026008 0.953824 0.015012 0.005156 0.017567 0.007255 0.005795 0.969383 0.004472 0.016107 0.967147 0.012274 0.025643 0.131548 0.150484 0.692325 0.127122 0.247125 0.301652 0.324101 0.219018 0.288054 0.253285 0.239642 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1472.2 MOTIF MA0464.1 Bhlhe40 letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 15804 E= 0 0.102885 0.434574 0.399329 0.063212 0.308087 0.033156 0.199064 0.459694 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.917046 0.000000 0.082954 0.181916 0.070046 0.748038 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.244179 0.754176 0.001645 0.000000 0.419451 0.269236 0.021830 0.289484 0.128322 0.398190 0.232916 0.240572 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0464.1 MOTIF MA1846.1 Brachyury letter-probability matrix: alength= 4 w= 22 nsites= 1000 E= 0 0.268000 0.280000 0.244000 0.208000 0.281281 0.156156 0.317317 0.245245 0.155000 0.544000 0.139000 0.162000 0.450000 0.119000 0.265000 0.166000 0.181181 0.348348 0.231231 0.239239 0.255744 0.224775 0.291708 0.227772 0.224000 0.199000 0.237000 0.340000 0.696000 0.044000 0.146000 0.114000 0.108000 0.104000 0.658000 0.130000 0.052000 0.028000 0.877000 0.043000 0.013000 0.041000 0.027000 0.919000 0.018000 0.007000 0.961000 0.014000 0.053000 0.178000 0.056000 0.713000 0.052947 0.106893 0.710290 0.129870 0.868000 0.023000 0.056000 0.053000 0.423000 0.160000 0.203000 0.214000 0.379000 0.153000 0.187000 0.281000 0.231000 0.154000 0.184000 0.431000 0.215215 0.195195 0.232232 0.357357 0.193806 0.191808 0.246753 0.367632 0.237000 0.251000 0.284000 0.228000 0.237762 0.213786 0.313686 0.234765 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1846.1 MOTIF MA1847.1 Bsx letter-probability matrix: alength= 4 w= 20 nsites= 1000 E= 0 0.315000 0.201000 0.229000 0.255000 0.328000 0.195000 0.232000 0.245000 0.241000 0.237000 0.251000 0.271000 0.234000 0.234000 0.286000 0.246000 0.251000 0.306000 0.233000 0.210000 0.222222 0.259259 0.367367 0.151151 0.255000 0.227000 0.244000 0.274000 0.020000 0.025000 0.008000 0.947000 0.925000 0.017000 0.025000 0.033000 0.967033 0.010989 0.011988 0.009990 0.036000 0.039000 0.053000 0.872000 0.033000 0.131000 0.116000 0.720000 0.189810 0.024975 0.749251 0.035964 0.218218 0.290290 0.286286 0.205205 0.171171 0.307307 0.211211 0.310310 0.221000 0.253000 0.262000 0.264000 0.276000 0.246000 0.223000 0.255000 0.287000 0.227000 0.224000 0.262000 0.259000 0.235000 0.203000 0.303000 0.258741 0.229770 0.218781 0.292707 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1847.1 MOTIF MA0170.1 C15 letter-probability matrix: alength= 4 w= 7 nsites= 19 E= 0 0.052632 0.052632 0.000000 0.894737 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.894737 0.000000 0.000000 0.105263 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.315789 0.105263 0.000000 0.578947 0.000000 0.157895 0.315789 0.526316 0.526316 0.000000 0.473684 0.000000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0170.1 MOTIF MA0279.1 CAD1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 2254 E= 0 0.912156 0.044366 0.043478 0.000000 0.044252 0.000000 0.000000 0.955748 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.874942 0.045391 0.000000 0.079667 0.264151 0.093462 0.642387 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.904320 0.095680 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.639566 0.360434 0.000000 0.955606 0.000000 0.044394 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0279.1