MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF MA1913.1 small-Maf letter-probability matrix: alength= 4 w= 20 nsites= 1000 E= 0 0.236000 0.234000 0.260000 0.270000 0.265000 0.214000 0.262000 0.259000 0.318000 0.173000 0.265000 0.244000 0.359000 0.130000 0.233000 0.278000 0.365634 0.108891 0.170829 0.354645 0.303000 0.135000 0.153000 0.409000 0.272272 0.167167 0.224224 0.336336 0.059000 0.102000 0.020000 0.819000 0.009000 0.009000 0.975000 0.007000 0.062000 0.910000 0.009000 0.019000 0.028000 0.020000 0.011000 0.941000 0.032032 0.017017 0.848849 0.102102 0.903000 0.029000 0.025000 0.043000 0.106106 0.388388 0.246246 0.259259 0.188000 0.202000 0.259000 0.351000 0.213213 0.268268 0.173173 0.345345 0.335000 0.195000 0.241000 0.229000 0.251251 0.109109 0.445445 0.194194 0.151000 0.364000 0.326000 0.159000 0.306000 0.307000 0.213000 0.174000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1913.1 MOTIF MA0086.1 sna letter-probability matrix: alength= 4 w= 6 nsites= 40 E= 0 0.000000 0.975000 0.025000 0.000000 0.975000 0.000000 0.000000 0.025000 0.075000 0.000000 0.925000 0.000000 0.050000 0.000000 0.950000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.950000 0.050000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0086.1 MOTIF MA0086.2 sna letter-probability matrix: alength= 4 w= 13 nsites= 1000 E= 0 0.241000 0.200000 0.309000 0.250000 0.128000 0.324000 0.264000 0.284000 0.454000 0.057000 0.387000 0.102000 0.835000 0.007000 0.114000 0.044000 0.005000 0.984000 0.006000 0.005000 0.984000 0.004000 0.007000 0.005000 0.087000 0.004000 0.903000 0.006000 0.005000 0.004000 0.986000 0.005000 0.005000 0.004000 0.007000 0.984000 0.009990 0.004995 0.975025 0.009990 0.042000 0.455000 0.184000 0.319000 0.535000 0.139000 0.147000 0.179000 0.290000 0.244000 0.230000 0.236000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0086.2 MOTIF MA0544.1 snpc-4 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 310 E= 0 0.290323 0.022581 0.564516 0.122581 0.009677 0.109677 0.009677 0.870968 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.006452 0.006452 0.000000 0.987097 0.009677 0.983871 0.000000 0.006452 0.025806 0.038710 0.896774 0.038710 0.012903 0.006452 0.964516 0.016129 0.038710 0.825806 0.048387 0.087097 0.000000 0.577419 0.096774 0.325806 0.032258 0.000000 0.954839 0.012903 0.000000 0.945161 0.003226 0.051613 0.125806 0.209677 0.119355 0.545161 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0544.1 MOTIF MA0246.1 so letter-probability matrix: alength= 4 w= 6 nsites= 27 E= 0 0.000000 0.000000 0.037037 0.962963 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.037037 0.962963 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.769231 0.000000 0.230769 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0246.1 MOTIF MA0082.1 squamosa letter-probability matrix: alength= 4 w= 14 nsites= 30 E= 0 0.366667 0.466667 0.033333 0.133333 0.000000 0.733333 0.000000 0.266667 0.800000 0.000000 0.133333 0.066667 0.533333 0.066667 0.033333 0.366667 0.766667 0.000000 0.000000 0.233333 0.566667 0.000000 0.000000 0.433333 0.800000 0.033333 0.000000 0.166667 0.266667 0.000000 0.033333 0.700000 0.466667 0.033333 0.500000 0.000000 0.033333 0.033333 0.933333 0.000000 0.466667 0.166667 0.033333 0.333333 0.833333 0.166667 0.000000 0.000000 0.700000 0.066667 0.100000 0.133333 0.233333 0.166667 0.266667 0.333333 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0082.1 MOTIF UN0438.1 sqz letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 22984 E= 0 0.528455 0.140576 0.171163 0.159807 0.544944 0.160938 0.155674 0.138444 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.524278 0.150191 0.132788 0.192743 0.426819 0.172729 0.192090 0.208362 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/UN0438.1 MOTIF MA0533.1 su(Hw) letter-probability matrix: alength= 4 w= 21 nsites= 4737 E= 0 0.070931 0.239181 0.592780 0.097108 0.051298 0.868904 0.007389 0.072409 0.164239 0.633523 0.048765 0.153473 0.180494 0.312434 0.206249 0.300823 0.584125 0.123707 0.195271 0.096897 0.725776 0.043910 0.111674 0.118640 0.890226 0.019633 0.062276 0.027866 0.824150 0.004011 0.066709 0.105130 0.086553 0.049609 0.793540 0.070298 0.003589 0.093097 0.020266 0.883048 0.902681 0.004433 0.020055 0.072831 0.001478 0.002322 0.240659 0.755541 0.042010 0.001056 0.955457 0.001478 0.024488 0.969812 0.001267 0.004433 0.595525 0.086764 0.001689 0.316023 0.716065 0.062487 0.150517 0.070931 0.110407 0.512983 0.040321 0.336289 0.535149 0.074731 0.297446 0.092675 0.383154 0.271058 0.162550 0.183238 0.470973 0.094364 0.072831 0.361832 0.421364 0.080008 0.074098 0.424530 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0533.1 MOTIF UN0097.1 sub-1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 998 E= 0 0.224449 0.326653 0.224449 0.224449 0.203407 0.299599 0.391784 0.105210 0.225677 0.726179 0.024072 0.024072 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.897898 0.102102 0.347695 0.117234 0.510020 0.025050 0.144144 0.144144 0.144144 0.567568 0.225225 0.324324 0.225225 0.225225 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/UN0097.1 MOTIF MA1461.1 sv letter-probability matrix: alength= 4 w= 17 nsites= 998 E= 0 0.187375 0.314629 0.238477 0.259519 0.002004 0.273547 0.444890 0.279559 0.058116 0.735471 0.004008 0.202405 0.645938 0.015045 0.312939 0.026078 0.152305 0.284569 0.383768 0.179359 0.001002 0.323647 0.005010 0.670341 0.002002 0.640641 0.356356 0.001001 0.934935 0.002002 0.059059 0.004004 0.375752 0.029058 0.068136 0.527054 0.001001 0.129129 0.868869 0.001001 0.001002 0.983968 0.003006 0.012024 0.106212 0.001002 0.891784 0.001002 0.004012 0.002006 0.008024 0.985958 0.128257 0.001002 0.869739 0.001002 0.946894 0.002004 0.013026 0.038076 0.025025 0.971972 0.002002 0.001001 0.071142 0.213427 0.670341 0.045090 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1461.1