MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF MA0924.1 pal-1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 1000 E= 0 0.091000 0.001000 0.907000 0.001000 0.000999 0.307692 0.000999 0.690310 0.921000 0.077000 0.001000 0.001000 0.997003 0.000999 0.000999 0.000999 0.000999 0.000999 0.000999 0.997003 0.537463 0.000999 0.000999 0.460539 0.997003 0.000999 0.000999 0.000999 0.886000 0.112000 0.001000 0.001000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0924.1 MOTIF MA0237.1 pan letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 25 E= 0 0.160000 0.400000 0.120000 0.320000 0.080000 0.120000 0.000000 0.800000 0.080000 0.000000 0.040000 0.880000 0.080000 0.000000 0.000000 0.920000 0.000000 0.080000 0.800000 0.120000 0.680000 0.000000 0.200000 0.120000 0.320000 0.000000 0.000000 0.680000 0.280000 0.440000 0.120000 0.160000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0237.1 MOTIF MA0237.2 pan letter-probability matrix: alength= 4 w= 14 nsites= 71 E= 0 0.000000 0.000000 0.478873 0.521127 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.281690 0.563380 0.154930 0.098592 0.605634 0.042254 0.253521 0.154930 0.140845 0.267606 0.436620 0.098592 0.563380 0.000000 0.338028 0.000000 0.422535 0.211268 0.366197 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.154930 0.845070 0.154930 0.126761 0.577465 0.140845 0.478873 0.000000 0.295775 0.225352 0.309859 0.000000 0.000000 0.690141 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0237.2 MOTIF MA0238.1 pb letter-probability matrix: alength= 4 w= 7 nsites= 24 E= 0 0.166667 0.375000 0.000000 0.458333 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.458333 0.541667 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0238.1 MOTIF MA0546.1 pha-4 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 1010 E= 0 0.579208 0.070297 0.000000 0.350495 0.528713 0.000000 0.466337 0.004950 0.531683 0.000000 0.078218 0.390099 0.040594 0.000000 0.959406 0.000000 0.000000 0.402970 0.000000 0.597030 0.853465 0.146535 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.616832 0.000000 0.383168 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0546.1 MOTIF MA1460.1 pho letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 6951 E= 0 0.329881 0.250036 0.183571 0.236513 0.324558 0.170047 0.294922 0.210473 0.890663 0.042728 0.038556 0.028054 0.014962 0.022155 0.017839 0.945044 0.020573 0.045749 0.906776 0.026903 0.016688 0.021580 0.937419 0.024313 0.043015 0.874694 0.039419 0.042872 0.048914 0.753273 0.132787 0.065027 0.071644 0.025752 0.862466 0.040138 0.268451 0.346137 0.177672 0.207740 0.190620 0.361243 0.215796 0.232341 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1460.1 MOTIF MA0536.1 pnr letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 869 E= 0 0.094361 0.207135 0.005754 0.692750 0.922900 0.000000 0.000000 0.077100 0.000000 0.036824 0.001151 0.962025 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.667434 0.000000 0.100115 0.232451 0.141542 0.000000 0.609896 0.248562 0.066743 0.319908 0.223245 0.390104 0.104718 0.314154 0.126582 0.454545 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0536.1 MOTIF MA1703.1 pqm-1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 2657 E= 0 0.363944 0.183289 0.130598 0.322168 0.570945 0.070380 0.209635 0.149040 0.068875 0.789236 0.096349 0.045540 0.030486 0.042153 0.001882 0.925480 0.015055 0.004516 0.961987 0.018442 0.974031 0.007151 0.006775 0.012044 0.003764 0.001129 0.000753 0.994355 0.957094 0.004893 0.006398 0.031615 0.894618 0.013549 0.056455 0.035378 0.164095 0.252540 0.402333 0.181031 0.482123 0.152428 0.233722 0.131728 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1703.1 MOTIF MA0239.1 prd letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 21 E= 0 0.476190 0.190476 0.000000 0.333333 0.047619 0.190476 0.666667 0.095238 0.190476 0.095238 0.095238 0.619048 0.952381 0.000000 0.000000 0.047619 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.333333 0.238095 0.142857 0.285714 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.238095 0.190476 0.095238 0.476190 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0239.1 MOTIF MA0240.1 repo letter-probability matrix: alength= 4 w= 7 nsites= 28 E= 0 0.035714 0.142857 0.142857 0.678571 0.035714 0.000000 0.000000 0.964286 0.964286 0.000000 0.000000 0.035714 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.750000 0.000000 0.250000 0.000000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0240.1