MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF MA0197.1 nub letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 22 E= 0 0.090909 0.181818 0.318182 0.409091 0.363636 0.136364 0.000000 0.500000 0.045455 0.000000 0.000000 0.954545 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.090909 0.136364 0.272727 0.500000 0.681818 0.045455 0.045455 0.227273 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0197.1 MOTIF MA0197.2 nub letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 29 E= 0 0.068966 0.034483 0.034483 0.862069 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.862069 0.137931 0.000000 0.655172 0.034483 0.310345 0.827586 0.000000 0.000000 0.172414 0.965517 0.000000 0.034483 0.000000 0.965517 0.000000 0.000000 0.034483 0.137931 0.034483 0.000000 0.827586 0.206897 0.172414 0.275862 0.344828 0.655172 0.172414 0.034483 0.137931 0.137931 0.103448 0.517241 0.241379 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0197.2 MOTIF MA1436.1 nuc-1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 999 E= 0 0.250250 0.549550 0.050050 0.150150 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.935872 0.064128 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.272545 0.454910 0.045090 0.227455 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1436.1 MOTIF MA0234.1 oc letter-probability matrix: alength= 4 w= 6 nsites= 19 E= 0 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.105263 0.894737 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.894737 0.052632 0.052632 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0234.1 MOTIF MA0454.1 odd letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 15 E= 0 0.466667 0.333333 0.000000 0.200000 0.666667 0.333333 0.000000 0.000000 0.000000 0.933333 0.066667 0.000000 0.800000 0.000000 0.200000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.733333 0.200000 0.066667 0.000000 0.333333 0.266667 0.400000 0.000000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0454.1 MOTIF MA0235.1 onecut letter-probability matrix: alength= 4 w= 7 nsites= 15 E= 0 0.066667 0.133333 0.000000 0.800000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.333333 0.000000 0.266667 0.400000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0235.1 MOTIF MA0456.1 opa letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 18 E= 0 0.000000 0.055556 0.833333 0.111111 0.555556 0.388889 0.055556 0.000000 0.055556 0.888889 0.000000 0.055556 0.055556 0.833333 0.055556 0.055556 0.000000 0.888889 0.055556 0.055556 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.777778 0.000000 0.222222 0.222222 0.000000 0.722222 0.055556 0.000000 0.777778 0.111111 0.111111 0.166667 0.055556 0.222222 0.555556 0.111111 0.000000 0.888889 0.000000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0456.1 MOTIF MA0236.1 otp letter-probability matrix: alength= 4 w= 7 nsites= 20 E= 0 0.050000 0.300000 0.100000 0.550000 0.000000 0.050000 0.000000 0.950000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.050000 0.200000 0.750000 0.750000 0.000000 0.150000 0.100000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0236.1 MOTIF MA0126.1 ovo letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 21 E= 0 0.476190 0.190476 0.000000 0.333333 0.047619 0.190476 0.666667 0.095238 0.190476 0.095238 0.095238 0.619048 0.952381 0.000000 0.000000 0.047619 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.333333 0.238095 0.142857 0.285714 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.238095 0.190476 0.095238 0.476190 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0126.1 MOTIF UN0461.1 p53-a letter-probability matrix: alength= 4 w= 22 nsites= 1001 E= 0 0.281718 0.268731 0.209790 0.239760 0.227227 0.268268 0.224224 0.280280 0.174000 0.221000 0.434000 0.171000 0.168831 0.378621 0.164835 0.287712 0.203203 0.400400 0.152152 0.244244 0.155155 0.333333 0.094094 0.417417 0.399600 0.040959 0.511489 0.047952 0.082000 0.011000 0.892000 0.015000 0.685000 0.013000 0.288000 0.014000 0.006000 0.984000 0.004000 0.006000 0.502498 0.107892 0.064935 0.324675 0.030000 0.074000 0.015000 0.881000 0.004000 0.007000 0.986000 0.003000 0.009990 0.866134 0.008991 0.114885 0.007992 0.972028 0.005994 0.013986 0.048000 0.717000 0.024000 0.211000 0.410000 0.129000 0.321000 0.140000 0.281000 0.206000 0.322000 0.191000 0.312000 0.203000 0.311000 0.174000 0.215000 0.392000 0.208000 0.185000 0.282000 0.273000 0.229000 0.216000 0.240000 0.266000 0.231000 0.263000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/UN0461.1