MEME version 4

ALPHABET= ACGT

strands: + -

Background letter frequencies
A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25

MOTIF MA0449.1 h
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 34 E= 0
 0.029412  0.058824  0.882353  0.029412
 0.088235  0.205882  0.500000  0.205882
 0.029412  0.911765  0.029412  0.029412
 0.647059  0.029412  0.294118  0.029412
 0.029412  0.882353  0.029412  0.058824
 0.058824  0.029412  0.882353  0.029412
 0.029412  0.294118  0.029412  0.647059
 0.029412  0.029412  0.911765  0.029412
 0.205882  0.500000  0.205882  0.088235
 0.029412  0.882353  0.058824  0.029412
URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0449.1

MOTIF MA0049.1 hb
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 16 E= 0
 0.062500  0.312500  0.500000  0.125000
 0.375000  0.500000  0.125000  0.000000
 0.562500  0.187500  0.250000  0.000000
 0.250000  0.187500  0.062500  0.500000
 0.812500  0.062500  0.000000  0.125000
 1.000000  0.000000  0.000000  0.000000
 1.000000  0.000000  0.000000  0.000000
 0.875000  0.000000  0.125000  0.000000
 0.937500  0.062500  0.000000  0.000000
 0.562500  0.125000  0.125000  0.187500
URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0049.1

MOTIF MA0226.1 hbn
letter-probability matrix: alength= 4 w= 7 nsites= 17 E= 0
 0.117647  0.117647  0.117647  0.647059
 0.000000  0.000000  0.000000  1.000000
 1.000000  0.000000  0.000000  0.000000
 1.000000  0.000000  0.000000  0.000000
 0.000000  0.000000  0.000000  1.000000
 0.000000  0.000000  0.000000  1.000000
 0.529412  0.000000  0.411765  0.058824
URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0226.1

MOTIF MA0450.1 hkb
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 32 E= 0
 0.093750  0.000000  0.562500  0.343750
 0.250000  0.000000  0.750000  0.000000
 0.000000  0.000000  1.000000  0.000000
 0.000000  0.000000  1.000000  0.000000
 0.000000  1.000000  0.000000  0.000000
 0.000000  0.000000  1.000000  0.000000
 0.000000  0.000000  0.093750  0.906250
 0.000000  0.000000  0.968750  0.031250
 0.750000  0.093750  0.062500  0.093750
URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0450.1

MOTIF MA0545.1 hlh-1
letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 381 E= 0
 0.186352  0.364829  0.388451  0.060367
 0.803150  0.057743  0.139108  0.000000
 0.758530  0.039370  0.188976  0.013123
 0.000000  1.000000  0.000000  0.000000
 1.000000  0.000000  0.000000  0.000000
 0.178478  0.034121  0.779528  0.007874
 0.060367  0.692913  0.031496  0.215223
 0.000000  0.007874  0.000000  0.992126
 0.000000  0.000000  1.000000  0.000000
 0.254593  0.196850  0.202100  0.346457
 0.000000  0.685039  0.057743  0.257218
URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0545.1

MOTIF MA1449.1 hlh-30
letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 1762 E= 0
 0.291146  0.210556  0.229285  0.269012
 0.394438  0.089671  0.376844  0.139047
 0.070942  0.102724  0.059024  0.767310
 0.003405  0.986947  0.006243  0.003405
 0.946084  0.009081  0.006810  0.038025
 0.007946  0.886493  0.017594  0.087968
 0.087968  0.017594  0.886493  0.007946
 0.038025  0.006810  0.009081  0.946084
 0.003405  0.006243  0.986947  0.003405
 0.767310  0.059024  0.102724  0.070942
 0.139047  0.376844  0.089671  0.394438
 0.269012  0.229285  0.210556  0.291146
URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1449.1

MOTIF MA0227.1 hth
letter-probability matrix: alength= 4 w= 6 nsites= 17 E= 0
 0.000000  0.000000  0.000000  1.000000
 0.000000  0.000000  1.000000  0.000000
 1.000000  0.000000  0.000000  0.000000
 0.000000  1.000000  0.000000  0.000000
 0.823529  0.000000  0.176471  0.000000
 0.000000  0.000000  0.666667  0.333333
URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0227.1

MOTIF MA0228.1 ind
letter-probability matrix: alength= 4 w= 7 nsites= 21 E= 0
 0.000000  0.571429  0.000000  0.428571
 0.000000  0.000000  0.000000  1.000000
 1.000000  0.000000  0.000000  0.000000
 1.000000  0.000000  0.000000  0.000000
 0.000000  0.000000  0.047619  0.952381
 0.000000  0.000000  0.380952  0.619048
 0.904762  0.000000  0.095238  0.000000
URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0228.1

MOTIF MA0229.1 inv
letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 16 E= 0
 0.250000  0.000000  0.187500  0.562500
 0.062500  0.562500  0.000000  0.375000
 0.000000  0.000000  0.000000  1.000000
 1.000000  0.000000  0.000000  0.000000
 1.000000  0.000000  0.000000  0.000000
 0.000000  0.000000  0.000000  1.000000
 0.000000  0.000000  0.000000  1.000000
 0.687500  0.000000  0.312500  0.000000
URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0229.1

MOTIF MA1841.1 kn
letter-probability matrix: alength= 4 w= 18 nsites= 281 E= 0
 0.160142  0.295374  0.266904  0.277580
 0.231317  0.220641  0.295374  0.252669
 0.334520  0.106762  0.323843  0.234875
 0.128114  0.177936  0.483986  0.209964
 0.056940  0.064057  0.039146  0.839858
 0.003559  0.985765  0.003559  0.007117
 0.021352  0.896797  0.017794  0.064057
 0.014235  0.921708  0.032028  0.032028
 0.167260  0.619217  0.078292  0.135231
 0.544484  0.088968  0.192171  0.174377
 0.042705  0.021352  0.918149  0.017794
 0.096085  0.024911  0.864769  0.014235
 0.007117  0.017794  0.967972  0.007117
 0.807829  0.028470  0.096085  0.067616
 0.227758  0.462633  0.163701  0.145907
 0.185053  0.359431  0.131673  0.323843
 0.266904  0.256228  0.202847  0.274021
 0.224199  0.277580  0.284698  0.213523
URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1841.1

