MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF MA0817.1 BHLHE23 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 5006 E= 0 0.509389 0.137036 0.171394 0.182181 0.835002 0.009176 0.148482 0.007341 0.555245 0.256943 0.186214 0.001598 0.004178 0.995822 0.000000 0.000000 0.983494 0.000000 0.013166 0.003341 0.000000 0.000798 0.000200 0.999002 0.998404 0.000997 0.000598 0.000000 0.009087 0.022235 0.000967 0.967711 0.000000 0.000797 0.997807 0.001396 0.002597 0.240360 0.353846 0.403197 0.035693 0.215629 0.013514 0.735165 0.304357 0.182054 0.192646 0.320943 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0817.1 MOTIF MA0464.2 BHLHE40 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 11222 E= 0 0.340759 0.269560 0.260738 0.128943 0.106232 0.036734 0.381854 0.475179 0.005224 0.993537 0.000000 0.001239 0.975232 0.011297 0.006778 0.006692 0.002039 0.994946 0.000177 0.002837 0.005831 0.002651 0.991518 0.000000 0.014244 0.021153 0.007421 0.957182 0.000354 0.001061 0.992219 0.006366 0.500127 0.446798 0.010885 0.042191 0.137587 0.508466 0.123418 0.230529 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0464.2 MOTIF MA0636.1 BHLHE41 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 9573 E= 0 0.302309 0.109266 0.582263 0.006163 0.013032 0.002261 0.243484 0.741223 0.000358 0.998925 0.000538 0.000179 0.993583 0.002139 0.003743 0.000535 0.000179 0.998746 0.000179 0.000896 0.000359 0.000179 0.999462 0.000000 0.003378 0.002844 0.002844 0.990933 0.000179 0.000179 0.999641 0.000000 0.815747 0.179862 0.001024 0.003366 0.008609 0.648441 0.114588 0.228362 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0636.1 MOTIF MA0964.1 BIM1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 1000 E= 0 0.219000 0.250000 0.281000 0.250000 0.126000 0.655000 0.101000 0.118000 0.582583 0.101101 0.184184 0.132132 0.059000 0.766000 0.023000 0.152000 0.140000 0.062000 0.795000 0.003000 0.001000 0.023000 0.000000 0.976000 0.002997 0.001998 0.989011 0.005994 0.375000 0.301000 0.148000 0.176000 0.146853 0.343656 0.241758 0.267732 0.256743 0.261738 0.256743 0.224775 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0964.1 MOTIF MA0964.2 BIM1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 1388 E= 0 0.311960 0.183718 0.203890 0.300432 0.311960 0.195245 0.385447 0.107349 0.069164 0.065562 0.136888 0.728386 0.003602 0.992075 0.002161 0.002161 0.994236 0.000720 0.000000 0.005043 0.000720 0.991354 0.000000 0.007925 0.007925 0.000000 0.991354 0.000720 0.005043 0.000000 0.000720 0.994236 0.002161 0.002161 0.992075 0.003602 0.728386 0.136888 0.065562 0.069164 0.107349 0.385447 0.195245 0.311960 0.300432 0.203890 0.183718 0.311960 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0964.2 MOTIF MA0965.1 BIM2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 1000 E= 0 0.244000 0.261000 0.290000 0.205000 0.167000 0.143000 0.373000 0.317000 0.053000 0.897000 0.001000 0.049000 0.962000 0.000000 0.024000 0.014000 0.022022 0.885886 0.000000 0.092092 0.092092 0.000000 0.885886 0.022022 0.014000 0.024000 0.000000 0.962000 0.049000 0.001000 0.897000 0.053000 0.317000 0.373000 0.143000 0.167000 0.205000 0.290000 0.261000 0.244000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0965.1 MOTIF MA0965.2 BIM2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 16 nsites= 10378 E= 0 0.299094 0.209867 0.213047 0.277992 0.312006 0.193872 0.223839 0.270283 0.325978 0.188668 0.173347 0.312006 0.227597 0.180574 0.399692 0.192137 0.211698 0.183272 0.315282 0.289748 0.002698 0.991906 0.001927 0.003469 0.972345 0.003469 0.015995 0.008190 0.001542 0.980343 0.002216 0.015899 0.015610 0.002216 0.980825 0.001349 0.008094 0.015899 0.003469 0.972538 0.003469 0.001927 0.991906 0.002698 0.289362 0.315571 0.182983 0.212083 0.192330 0.399884 0.180574 0.227211 0.312006 0.173058 0.189246 0.325689 0.270572 0.223839 0.193679 0.311910 0.277703 0.213336 0.209482 0.299480 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0965.2 MOTIF MA0966.1 BIM3 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 1000 E= 0 0.294000 0.203000 0.270000 0.233000 0.159000 0.165000 0.433000 0.243000 0.074074 0.821822 0.008008 0.096096 0.942000 0.000000 0.025000 0.033000 0.015000 0.918000 0.000000 0.067000 0.067000 0.000000 0.918000 0.015000 0.033000 0.025000 0.000000 0.942000 0.096096 0.008008 0.821822 0.074074 0.243000 0.433000 0.165000 0.159000 0.233000 0.270000 0.203000 0.294000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0966.1 MOTIF MA1928.1 BNC2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 5672 E= 0 0.254584 0.249295 0.236072 0.260049 0.319464 0.128173 0.223378 0.328984 0.259344 0.155148 0.504937 0.080571 0.025917 0.011636 0.016925 0.945522 0.023625 0.012694 0.913963 0.049718 0.934944 0.020628 0.010755 0.033674 0.040021 0.147743 0.763752 0.048484 0.015162 0.018688 0.014104 0.952045 0.038082 0.923484 0.019746 0.018688 0.966678 0.009520 0.009873 0.013928 0.104372 0.288611 0.210155 0.396862 0.298307 0.237659 0.181241 0.282793 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1928.1 MOTIF MA1404.1 BPC1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 24 nsites= 539 E= 0 0.152134 0.033395 0.781076 0.033395 0.896104 0.007421 0.053803 0.042672 0.014842 0.027829 0.896104 0.061224 0.929499 0.000000 0.033395 0.037106 0.124304 0.016698 0.831169 0.027829 0.927644 0.000000 0.072356 0.000000 0.079777 0.031540 0.855288 0.033395 0.886827 0.005566 0.081633 0.025974 0.072356 0.000000 0.894249 0.033395 0.964750 0.011132 0.003711 0.020408 0.050093 0.003711 0.942486 0.003711 0.961039 0.020408 0.005566 0.012987 0.115028 0.016698 0.834879 0.033395 0.853432 0.000000 0.103896 0.042672 0.100186 0.000000 0.857143 0.042672 0.899814 0.000000 0.100186 0.000000 0.076067 0.018553 0.866419 0.038961 0.942486 0.000000 0.016698 0.040816 0.131725 0.003711 0.851577 0.012987 0.886827 0.022263 0.064935 0.025974 0.135436 0.035250 0.816327 0.012987 0.834879 0.027829 0.072356 0.064935 0.087199 0.037106 0.792208 0.083488 0.808905 0.040816 0.079777 0.070501 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1404.1