MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF MA1578.1 VEZF1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 998 E= 0 0.071142 0.791583 0.137275 0.000000 0.001002 0.998998 0.000000 0.000000 0.004004 0.995996 0.000000 0.000000 0.002002 0.997998 0.000000 0.000000 0.006006 0.989990 0.000000 0.004004 0.010020 0.978958 0.003006 0.008016 0.406814 0.357715 0.110220 0.125251 0.044088 0.551102 0.070140 0.334669 0.240240 0.171171 0.211211 0.377377 0.334002 0.173521 0.152457 0.340020 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1578.1 MOTIF UN0412.1 VFP5 letter-probability matrix: alength= 4 w= 15 nsites= 1000 E= 0 0.302013 0.208054 0.102349 0.387584 0.130872 0.434564 0.125839 0.308725 0.362416 0.119128 0.357383 0.161074 0.100671 0.192953 0.045302 0.661074 0.001678 0.911074 0.028523 0.058725 0.167785 0.000000 0.832215 0.000000 0.041946 0.756712 0.114094 0.087248 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.998322 0.001678 0.634228 0.206376 0.015101 0.144295 0.387584 0.005034 0.595637 0.011745 0.614094 0.075503 0.104027 0.206376 0.377517 0.164430 0.135906 0.322148 0.322148 0.119128 0.255034 0.303691 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/UN0412.1 MOTIF MA1803.1 VIP1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 14 nsites= 1000 E= 0 0.341404 0.101695 0.210654 0.346247 0.099274 0.108959 0.048426 0.743341 0.016949 0.000000 0.849879 0.133172 0.508475 0.481840 0.009685 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.019370 0.000000 0.980630 0.000000 0.000000 0.978208 0.009685 0.012107 0.000000 0.033898 0.000000 0.966102 0.101695 0.096852 0.753027 0.048426 0.162228 0.000000 0.276029 0.561743 0.341404 0.261501 0.169492 0.227603 0.268765 0.346247 0.101695 0.283293 0.404358 0.220339 0.121065 0.254237 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1803.1 MOTIF MA0725.1 VSX1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 14889 E= 0 0.050776 0.567735 0.037679 0.343811 0.096070 0.163832 0.029930 0.710167 0.886769 0.040902 0.036132 0.036197 0.970260 0.011009 0.012296 0.006434 0.012245 0.014168 0.007333 0.966254 0.055381 0.046932 0.060685 0.837003 0.722030 0.027451 0.177528 0.072990 0.193501 0.261956 0.269545 0.274998 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0725.1 MOTIF MA0726.1 VSX2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 14681 E= 0 0.029085 0.650773 0.030311 0.289830 0.060077 0.151583 0.020192 0.768148 0.923617 0.026553 0.022942 0.026888 0.978044 0.008782 0.008712 0.004462 0.008307 0.013094 0.006477 0.972122 0.040520 0.036701 0.028934 0.893844 0.800383 0.018605 0.122240 0.058772 0.209356 0.234847 0.310522 0.245275 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0726.1 MOTIF MA0693.1 Vdr letter-probability matrix: alength= 4 w= 16 nsites= 31267 E= 0 0.182685 0.047046 0.764736 0.005533 0.621105 0.000331 0.378534 0.000030 0.000282 0.000176 0.999153 0.000388 0.000150 0.000389 0.115783 0.883678 0.008410 0.014332 0.028947 0.948312 0.000897 0.979369 0.001293 0.018441 0.899443 0.003277 0.091986 0.005294 0.108200 0.260626 0.048650 0.582524 0.171072 0.360522 0.074511 0.393895 0.187325 0.069370 0.728580 0.014725 0.621060 0.000420 0.378429 0.000090 0.000211 0.000070 0.999542 0.000176 0.000063 0.000221 0.079208 0.920508 0.008522 0.012670 0.040214 0.938594 0.000147 0.963162 0.001536 0.035155 0.897135 0.003258 0.096065 0.003543 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0693.1 MOTIF MA0693.3 Vdr letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 38542 E= 0 0.235587 0.287738 0.218463 0.258212 0.298895 0.195942 0.193737 0.311426 0.164885 0.121374 0.657958 0.055783 0.932697 0.016709 0.029500 0.021094 0.020886 0.015541 0.934772 0.028800 0.025375 0.013492 0.040346 0.920788 0.043719 0.016994 0.014893 0.924394 0.041565 0.894531 0.010534 0.053370 0.941959 0.017150 0.021431 0.019459 0.234835 0.216128 0.244435 0.304603 0.289943 0.196928 0.233953 0.279176 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0693.3 MOTIF MA0181.1 Vsx1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 7 nsites= 22 E= 0 0.045455 0.363636 0.045455 0.545455 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.090909 0.000000 0.136364 0.772727 0.681818 0.000000 0.272727 0.045455 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0181.1 MOTIF MA0180.1 Vsx2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 13 E= 0 0.076923 0.076923 0.384615 0.461538 0.153846 0.153846 0.000000 0.692308 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.769231 0.000000 0.230769 0.000000 0.076923 0.153846 0.769231 0.000000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0180.1 MOTIF MA1804.1 WIN1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 999 E= 0 0.248762 0.390137 0.266799 0.094302 0.136992 0.720483 0.132943 0.009582 0.384131 0.000678 0.614608 0.000583 0.001029 0.795182 0.186526 0.017263 0.001119 0.955576 0.000685 0.042620 0.201865 0.009185 0.711657 0.077292 0.164166 0.679174 0.079113 0.077547 0.348470 0.351972 0.155019 0.144539 0.253096 0.163003 0.425715 0.158186 0.184070 0.238726 0.171626 0.405579 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1804.1