MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF MA0413.1 USV1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 20 nsites= 997 E= 0 0.269809 0.223671 0.250752 0.255767 0.306613 0.182365 0.216433 0.294589 0.342342 0.168168 0.206206 0.283283 0.131263 0.193387 0.146293 0.529058 0.133400 0.055165 0.157472 0.653962 0.318637 0.552104 0.101202 0.028056 0.001003 0.969910 0.026078 0.003009 0.000000 0.979940 0.000000 0.020060 0.003006 0.994990 0.001002 0.001002 0.001002 0.982966 0.000000 0.016032 0.000000 0.006012 0.003006 0.990982 0.000000 0.002006 0.871615 0.126379 0.958877 0.000000 0.036108 0.005015 0.851703 0.092184 0.021042 0.035070 0.174349 0.257515 0.162325 0.405812 0.233233 0.235235 0.093093 0.438438 0.212212 0.191191 0.197197 0.399399 0.181363 0.185371 0.321643 0.311623 0.205411 0.100200 0.265531 0.428858 0.219659 0.297894 0.366098 0.116349 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0413.1 MOTIF MA0094.1 Ubx letter-probability matrix: alength= 4 w= 4 nsites= 88 E= 0 0.034091 0.000000 0.000000 0.965909 0.818182 0.045455 0.034091 0.102273 0.897727 0.011364 0.068182 0.022727 0.011364 0.056818 0.045455 0.886364 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0094.1 MOTIF MA0094.2 Ubx letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 20 E= 0 0.150000 0.250000 0.150000 0.450000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.850000 0.000000 0.000000 0.150000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.300000 0.700000 0.700000 0.000000 0.300000 0.000000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0094.2 MOTIF MA1925.1 Uncx-b letter-probability matrix: alength= 4 w= 20 nsites= 1000 E= 0 0.322000 0.178000 0.183000 0.317000 0.327327 0.182182 0.186186 0.304304 0.305000 0.190000 0.190000 0.315000 0.266000 0.198000 0.181000 0.355000 0.284284 0.189189 0.188188 0.338338 0.375000 0.184000 0.196000 0.245000 0.364000 0.176000 0.200000 0.260000 0.104000 0.088000 0.075000 0.733000 0.051000 0.049000 0.025000 0.875000 0.875000 0.030000 0.051000 0.044000 0.905000 0.023000 0.028000 0.044000 0.044000 0.030000 0.027000 0.899000 0.048951 0.053946 0.040959 0.856144 0.419000 0.129000 0.200000 0.252000 0.325000 0.182000 0.233000 0.260000 0.269000 0.212000 0.198000 0.321000 0.241000 0.192000 0.187000 0.380000 0.279720 0.194805 0.186813 0.338661 0.318000 0.177000 0.187000 0.318000 0.283000 0.183000 0.191000 0.343000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1925.1 MOTIF MA1926.1 Usf letter-probability matrix: alength= 4 w= 20 nsites= 1000 E= 0 0.274000 0.246000 0.238000 0.242000 0.258258 0.259259 0.229229 0.253253 0.303696 0.198801 0.230769 0.266733 0.321321 0.163163 0.270270 0.245245 0.397000 0.121000 0.399000 0.083000 0.144000 0.212000 0.110000 0.534000 0.043000 0.878000 0.042000 0.037000 0.980000 0.006000 0.007000 0.007000 0.007992 0.954046 0.007992 0.029970 0.024024 0.009009 0.958959 0.008008 0.008008 0.008008 0.006006 0.977978 0.009990 0.017982 0.963037 0.008991 0.668332 0.072927 0.165834 0.092907 0.080000 0.424000 0.110000 0.386000 0.268731 0.271728 0.159840 0.299700 0.291000 0.234000 0.196000 0.279000 0.281000 0.232000 0.253000 0.234000 0.271271 0.238238 0.244244 0.246246 0.267000 0.243000 0.239000 0.251000 0.268000 0.245000 0.241000 0.246000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1926.1 MOTIF MA0722.1 VAX1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 6156 E= 0 0.072612 0.450780 0.073912 0.402697 0.096614 0.141577 0.014371 0.747439 0.795066 0.130619 0.028606 0.045709 0.940555 0.027395 0.008236 0.023814 0.050778 0.014703 0.036416 0.898102 0.063239 0.039960 0.242873 0.653928 0.742999 0.012306 0.188402 0.056294 0.185954 0.363723 0.177579 0.272745 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0722.1 MOTIF MA0723.1 VAX2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 16603 E= 0 0.055472 0.470758 0.083358 0.390411 0.075196 0.150552 0.011786 0.762466 0.791771 0.154012 0.022927 0.031290 0.964580 0.014371 0.006342 0.014708 0.036928 0.010322 0.036158 0.916592 0.060140 0.044264 0.254417 0.641179 0.758220 0.009493 0.202482 0.029805 0.189620 0.395048 0.200671 0.214660 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0723.1 MOTIF MA0723.2 VAX2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 13498 E= 0 0.144466 0.299081 0.315306 0.241147 0.059218 0.393242 0.008085 0.539456 0.593606 0.247460 0.042306 0.116628 0.855929 0.026760 0.000000 0.117311 0.025767 0.000000 0.000000 0.974233 0.075695 0.007397 0.166185 0.750723 0.925789 0.000000 0.000000 0.074211 0.287820 0.237294 0.349311 0.125574 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0723.2 MOTIF MA0693.2 VDR letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 1000 E= 0 0.222000 0.280000 0.043000 0.455000 0.356000 0.045000 0.567000 0.032000 0.555556 0.024024 0.386386 0.034034 0.024000 0.025000 0.919000 0.032000 0.017000 0.023000 0.070000 0.890000 0.060939 0.030969 0.081918 0.826174 0.055000 0.743000 0.028000 0.174000 0.886000 0.019000 0.076000 0.019000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0693.2 MOTIF MA0724.1 VENTX letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 23923 E= 0 0.724993 0.041090 0.080843 0.153074 0.271400 0.379106 0.188737 0.160757 0.019755 0.840908 0.000000 0.139337 0.258121 0.187092 0.534057 0.020729 0.988554 0.008388 0.000000 0.003058 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.328884 0.026326 0.563167 0.081624 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0724.1