MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF MA1573.2 Thap11 letter-probability matrix: alength= 4 w= 14 nsites= 660 E= 0 0.890909 0.057576 0.030303 0.021212 0.030303 0.913636 0.027273 0.028788 0.007576 0.059091 0.009091 0.924242 0.950000 0.025758 0.015152 0.009091 0.006061 0.968182 0.013636 0.012121 0.922727 0.019697 0.043939 0.013636 0.627273 0.069697 0.084848 0.218182 0.106061 0.316667 0.250000 0.327273 0.027273 0.030303 0.028788 0.913636 0.007576 0.956061 0.003030 0.033333 0.012121 0.972727 0.007576 0.007576 0.013636 0.942424 0.015152 0.028788 0.719697 0.024242 0.222727 0.033333 0.112121 0.103030 0.637879 0.146970 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1573.2 MOTIF MA1924.1 Tlx letter-probability matrix: alength= 4 w= 20 nsites= 1000 E= 0 0.284000 0.223000 0.205000 0.288000 0.286713 0.229770 0.203796 0.279720 0.302000 0.218000 0.203000 0.277000 0.312687 0.202797 0.202797 0.281718 0.300699 0.194805 0.203796 0.300699 0.256000 0.235000 0.198000 0.311000 0.239760 0.288711 0.135864 0.335664 0.800000 0.068000 0.047000 0.085000 0.806194 0.051948 0.043956 0.097902 0.051948 0.028971 0.021978 0.897103 0.061000 0.035000 0.028000 0.876000 0.884000 0.022000 0.043000 0.051000 0.851000 0.046000 0.042000 0.061000 0.323000 0.200000 0.158000 0.319000 0.285000 0.205000 0.197000 0.313000 0.306000 0.194000 0.243000 0.257000 0.294000 0.221000 0.227000 0.258000 0.319000 0.219000 0.191000 0.271000 0.308000 0.215000 0.187000 0.290000 0.299000 0.217000 0.194000 0.290000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1924.1 MOTIF MA0205.1 Trl letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 71 E= 0 0.056338 0.309859 0.126761 0.507042 0.084507 0.323944 0.154930 0.436620 0.169014 0.084507 0.422535 0.323944 0.000000 0.901408 0.042254 0.056338 0.042254 0.000000 0.197183 0.760563 0.014085 0.985915 0.000000 0.000000 0.183099 0.000000 0.028169 0.788732 0.070423 0.760563 0.098592 0.070423 0.098592 0.183099 0.154930 0.563380 0.126761 0.464789 0.140845 0.267606 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0205.1 MOTIF MA0205.2 Trl letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 6858 E= 0 0.322251 0.193934 0.391805 0.092009 0.381744 0.196559 0.287547 0.134150 0.598863 0.087052 0.277340 0.036745 0.964275 0.006853 0.006416 0.022456 0.013269 0.007874 0.952902 0.025955 0.983231 0.003062 0.006416 0.007291 0.001458 0.005541 0.989064 0.003937 0.962817 0.026538 0.006562 0.004083 0.020560 0.004229 0.967921 0.007291 0.744386 0.123214 0.072178 0.060222 0.275299 0.090551 0.554097 0.080052 0.435112 0.126859 0.317731 0.120297 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0205.2 MOTIF MA0633.1 Twist2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 1000 E= 0 0.302000 0.200000 0.298000 0.200000 0.282000 0.580000 0.069000 0.069000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.217000 0.000000 0.783000 0.789000 0.000000 0.211000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.050000 0.050000 0.155000 0.745000 0.181181 0.181181 0.272272 0.365365 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0633.1 MOTIF MA0633.2 Twist2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 49629 E= 0 0.261923 0.282174 0.258820 0.197082 0.277459 0.293679 0.318886 0.109976 0.000302 0.996857 0.001632 0.001209 0.985613 0.006952 0.007435 0.000000 0.000181 0.000322 0.999073 0.000423 0.000423 0.999073 0.000322 0.000181 0.000000 0.007435 0.006891 0.985674 0.001209 0.001632 0.996857 0.000302 0.109976 0.318886 0.293679 0.277459 0.198392 0.258820 0.280864 0.261923 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0633.2 MOTIF MA0410.1 UGA3 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 0 0.100000 0.440000 0.270000 0.190000 0.040404 0.282828 0.636364 0.040404 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.020000 0.270000 0.690000 0.020000 0.858586 0.020202 0.020202 0.101010 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0410.1 MOTIF MA0412.1 UME6 letter-probability matrix: alength= 4 w= 13 nsites= 18 E= 0 0.111111 0.000000 0.000000 0.888889 0.000000 0.555556 0.277778 0.166667 0.111111 0.000000 0.888889 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.944444 0.000000 0.055556 0.055556 0.000000 0.000000 0.944444 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.555556 0.055556 0.000000 0.388889 0.388889 0.111111 0.055556 0.444444 0.111111 0.000000 0.055556 0.833333 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0412.1 MOTIF MA0412.2 UME6 letter-probability matrix: alength= 4 w= 15 nsites= 218 E= 0 0.444954 0.137615 0.128440 0.288991 0.463303 0.077982 0.114679 0.344037 0.293578 0.041284 0.059633 0.605505 0.009174 0.036697 0.027523 0.926606 0.889908 0.004587 0.013761 0.091743 0.045872 0.041284 0.908257 0.004587 0.000000 0.990826 0.004587 0.004587 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.013761 0.000000 0.986239 0.000000 0.000000 0.995413 0.004587 0.000000 0.009174 0.848624 0.055046 0.087156 0.146789 0.376147 0.444954 0.032110 0.733945 0.073394 0.100917 0.091743 0.288991 0.215596 0.302752 0.192661 0.252294 0.256881 0.394495 0.096330 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0412.2 MOTIF MA0721.1 UNCX letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 36925 E= 0 0.134868 0.361896 0.154665 0.348571 0.092470 0.390816 0.048526 0.468188 0.791096 0.054417 0.098164 0.056323 0.933937 0.032930 0.010623 0.022510 0.012549 0.021028 0.003052 0.963371 0.067960 0.086463 0.038928 0.806650 0.843965 0.050534 0.016707 0.088794 0.374018 0.211910 0.283811 0.130261 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0721.1