MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF MA1161.1 TSO1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 15 nsites= 264 E= 0 0.515152 0.056818 0.106061 0.321970 0.367424 0.034091 0.106061 0.492424 0.268939 0.041667 0.030303 0.659091 0.204545 0.022727 0.034091 0.738636 0.325758 0.143939 0.056818 0.473485 0.606061 0.098485 0.155303 0.140152 0.863636 0.000000 0.132576 0.003788 0.878788 0.003788 0.060606 0.056818 0.924242 0.000000 0.000000 0.075758 0.000000 0.030303 0.011364 0.958333 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.261364 0.000000 0.738636 0.810606 0.000000 0.170455 0.018939 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1161.1 MOTIF MA1123.1 TWIST1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 13 nsites= 18139 E= 0 0.297481 0.214565 0.247919 0.240035 0.284360 0.211864 0.211202 0.292574 0.281824 0.155190 0.203594 0.359391 0.145653 0.730139 0.093886 0.030321 0.011577 0.975963 0.005513 0.006946 0.978499 0.004466 0.007994 0.009041 0.013066 0.050389 0.889906 0.046640 0.904129 0.058052 0.029991 0.007828 0.009758 0.015050 0.009152 0.966040 0.012570 0.013286 0.955510 0.018634 0.056729 0.099123 0.138707 0.705441 0.142731 0.258173 0.285628 0.313468 0.238271 0.260544 0.231215 0.269971 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1123.1 MOTIF MA1123.2 TWIST1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 13 nsites= 27333 E= 0 0.304723 0.210771 0.237259 0.247247 0.286174 0.202320 0.209344 0.302162 0.275711 0.168185 0.211173 0.344931 0.136575 0.746790 0.085464 0.031171 0.013793 0.975561 0.004281 0.006366 0.977317 0.004976 0.007683 0.010025 0.016098 0.048293 0.884133 0.051476 0.897230 0.061720 0.033220 0.007829 0.013061 0.016683 0.010537 0.959719 0.013903 0.014488 0.950316 0.021293 0.065891 0.106794 0.148868 0.678447 0.148904 0.270808 0.266089 0.314199 0.249625 0.240040 0.227308 0.283028 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1123.2 MOTIF MA0409.1 TYE7 letter-probability matrix: alength= 4 w= 7 nsites= 102 E= 0 0.029412 0.911765 0.029412 0.029412 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.100000 0.900000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.764706 0.078431 0.078431 0.078431 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0409.1 MOTIF MA1919.1 Tbox-a letter-probability matrix: alength= 4 w= 22 nsites= 1000 E= 0 0.230000 0.239000 0.305000 0.226000 0.226226 0.243243 0.283283 0.247247 0.209000 0.234000 0.321000 0.236000 0.211000 0.237000 0.283000 0.269000 0.239760 0.212787 0.311688 0.235764 0.286713 0.161838 0.315684 0.235764 0.508492 0.076923 0.273726 0.140859 0.091091 0.082082 0.770771 0.056056 0.013000 0.028000 0.936000 0.023000 0.015000 0.093000 0.028000 0.864000 0.009990 0.004995 0.975025 0.009990 0.068000 0.195000 0.054000 0.683000 0.051000 0.104000 0.703000 0.142000 0.905095 0.016983 0.053946 0.023976 0.657000 0.083000 0.136000 0.124000 0.298298 0.189189 0.242242 0.270270 0.244000 0.154000 0.259000 0.343000 0.198198 0.193193 0.257257 0.351351 0.193193 0.192192 0.320320 0.294294 0.228228 0.221221 0.279279 0.271271 0.224775 0.220779 0.317682 0.236763 0.224000 0.282000 0.278000 0.216000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1919.1 MOTIF MA1920.1 Tbox-b letter-probability matrix: alength= 4 w= 22 nsites= 1000 E= 0 0.148000 0.493000 0.122000 0.237000 0.157157 0.346346 0.127127 0.369369 0.199000 0.256000 0.184000 0.361000 0.236000 0.242000 0.213000 0.309000 0.253000 0.247000 0.246000 0.254000 0.302000 0.230000 0.256000 0.212000 0.361000 0.182000 0.263000 0.194000 0.834000 0.027000 0.081000 0.058000 0.150000 0.087000 0.715000 0.048000 0.028000 0.019000 0.935000 0.018000 0.020000 0.055000 0.050000 0.875000 0.015000 0.007000 0.968000 0.010000 0.113886 0.278721 0.044955 0.562438 0.071000 0.119000 0.672000 0.138000 0.920000 0.014000 0.044000 0.022000 0.487512 0.147852 0.136863 0.227772 0.335000 0.150000 0.138000 0.377000 0.294000 0.214000 0.143000 0.349000 0.314000 0.178000 0.210000 0.298000 0.147000 0.362000 0.134000 0.357000 0.407592 0.303696 0.152847 0.135864 0.259000 0.342000 0.208000 0.191000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1920.1 MOTIF MA1921.1 Tbx15/18/22 letter-probability matrix: alength= 4 w= 22 nsites= 1000 E= 0 0.238000 0.219000 0.263000 0.280000 0.232232 0.227227 0.278278 0.262262 0.258741 0.230769 0.261738 0.248751 0.233233 0.219219 0.290290 0.257257 0.236000 0.232000 0.286000 0.246000 0.277277 0.224224 0.257257 0.241241 0.278000 0.174000 0.316000 0.232000 0.777778 0.029029 0.122122 0.071071 0.113000 0.076000 0.742000 0.069000 0.027000 0.021000 0.928000 0.024000 0.011011 0.064064 0.031031 0.893894 0.009990 0.004995 0.978022 0.006993 0.087000 0.081000 0.031000 0.801000 0.056000 0.172000 0.563000 0.209000 0.837000 0.013000 0.068000 0.082000 0.211000 0.171000 0.068000 0.550000 0.317000 0.300000 0.263000 0.120000 0.499000 0.092000 0.152000 0.257000 0.064064 0.784785 0.068068 0.083083 0.657343 0.056943 0.200799 0.084915 0.094000 0.713000 0.120000 0.073000 0.154000 0.441000 0.190000 0.215000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1921.1 MOTIF MA1922.1 Tbx2/3 letter-probability matrix: alength= 4 w= 20 nsites= 1001 E= 0 0.290709 0.186813 0.279720 0.242757 0.368000 0.192000 0.223000 0.217000 0.275275 0.231231 0.244244 0.249249 0.278000 0.213000 0.267000 0.242000 0.308308 0.154154 0.293293 0.244244 0.702298 0.037962 0.168831 0.090909 0.164000 0.084000 0.639000 0.113000 0.010000 0.011000 0.971000 0.008000 0.007992 0.051948 0.009990 0.930070 0.006000 0.005000 0.982000 0.007000 0.056000 0.078000 0.015000 0.851000 0.057000 0.115000 0.658000 0.170000 0.944056 0.010989 0.024975 0.019980 0.426573 0.161838 0.123876 0.287712 0.294000 0.160000 0.153000 0.393000 0.241000 0.194000 0.124000 0.441000 0.351000 0.269000 0.132000 0.248000 0.348000 0.317000 0.108000 0.227000 0.333666 0.469530 0.140859 0.055944 0.401000 0.392000 0.098000 0.109000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1922.1 MOTIF MA1567.2 Tbx6 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 9652 E= 0 0.275591 0.197161 0.336407 0.190841 0.514712 0.066618 0.263262 0.155408 0.078533 0.019271 0.864795 0.037402 0.010671 0.035951 0.946022 0.007356 0.016370 0.023726 0.015748 0.944157 0.004041 0.012329 0.973166 0.010464 0.073560 0.023726 0.070037 0.832677 0.018960 0.080294 0.853398 0.047348 0.938976 0.017095 0.034397 0.009532 0.817344 0.050974 0.093038 0.038645 0.310506 0.190738 0.316204 0.182553 0.256734 0.198404 0.247306 0.297555 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1567.2 MOTIF MA0009.1 Tbxt letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 40 E= 0 0.050000 0.700000 0.200000 0.050000 0.025000 0.025000 0.000000 0.950000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.050000 0.000000 0.950000 0.025000 0.175000 0.700000 0.100000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.775000 0.125000 0.000000 0.100000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0009.1