MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF MA1576.1 THRB letter-probability matrix: alength= 4 w= 19 nsites= 389 E= 0 0.305913 0.079692 0.403599 0.210797 0.000000 0.020566 0.000000 0.979434 0.050817 0.161525 0.705989 0.081670 0.784274 0.038306 0.034274 0.143145 0.000000 0.948780 0.009756 0.041463 0.000000 0.831197 0.126068 0.042735 0.025243 0.145631 0.073786 0.755340 0.028278 0.344473 0.239075 0.388175 0.676093 0.071979 0.228792 0.023136 0.108247 0.569588 0.182990 0.139175 0.259542 0.218830 0.521628 0.000000 0.000000 0.000000 0.015038 0.984962 0.000000 0.000000 0.992347 0.007653 0.800412 0.022634 0.000000 0.176955 0.000000 0.994885 0.000000 0.005115 0.017370 0.965261 0.007444 0.009926 0.000000 0.022613 0.000000 0.977387 0.000000 0.378788 0.158009 0.463203 0.797531 0.019753 0.182716 0.000000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1576.1 MOTIF MA1220.1 TINY letter-probability matrix: alength= 4 w= 15 nsites= 596 E= 0 0.244966 0.379195 0.110738 0.265101 0.248322 0.164430 0.236577 0.350671 0.092282 0.536913 0.088926 0.281879 0.068792 0.724832 0.038591 0.167785 0.684564 0.000000 0.312081 0.003356 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.895973 0.055369 0.000000 0.048658 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.813758 0.003356 0.159396 0.023490 0.355705 0.317114 0.137584 0.189597 0.340604 0.213087 0.107383 0.338926 0.327181 0.110738 0.276846 0.285235 0.258389 0.290268 0.159396 0.291946 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1220.1 MOTIF MA1577.1 TLX2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 7799 E= 0 0.127837 0.329786 0.237338 0.305039 0.077559 0.421522 0.060102 0.440817 0.989846 0.000000 0.010154 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.280072 0.169659 0.441011 0.109259 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1577.1 MOTIF MA0350.1 TOD6 letter-probability matrix: alength= 4 w= 21 nsites= 998 E= 0 0.362725 0.188377 0.218437 0.230461 0.144144 0.213213 0.369369 0.273273 0.101202 0.261523 0.370741 0.266533 0.239479 0.327655 0.206413 0.226453 0.369739 0.116232 0.235471 0.278557 0.212212 0.366366 0.133133 0.288288 0.650301 0.050100 0.096192 0.203407 0.067202 0.397192 0.437312 0.098295 0.020040 0.785571 0.193387 0.001002 0.002004 0.029058 0.046092 0.922846 0.002004 0.992986 0.002004 0.003006 0.977934 0.000000 0.001003 0.021063 0.001002 0.001002 0.018036 0.979960 0.000000 0.980943 0.001003 0.018054 0.052156 0.019057 0.871615 0.057172 0.135271 0.656313 0.186373 0.022044 0.181181 0.300300 0.383383 0.135135 0.232232 0.282282 0.109109 0.376376 0.187187 0.280280 0.111111 0.421421 0.306306 0.213213 0.172172 0.308308 0.201403 0.150301 0.320641 0.327655 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0350.1 MOTIF MA0408.1 TOS8 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 0 0.280000 0.470000 0.200000 0.050000 0.010000 0.160000 0.010000 0.820000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.640000 0.070000 0.070000 0.220000 0.505051 0.151515 0.151515 0.191919 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0408.1 MOTIF MA0106.1 TP53 letter-probability matrix: alength= 4 w= 20 nsites= 17 E= 0 0.294118 0.470588 0.117647 0.117647 0.176471 0.411765 0.352941 0.058824 0.235294 0.000000 0.764706 0.000000 0.294118 0.000000 0.705882 0.000000 0.764706 0.000000 0.235294 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.647059 0.000000 0.352941 0.000000 0.941176 0.000000 0.058824 0.000000 0.941176 0.000000 0.058824 0.058824 0.000000 0.882353 0.058824 0.058824 0.000000 0.823529 0.117647 0.235294 0.000000 0.764706 0.000000 0.058824 0.823529 0.117647 0.000000 0.882353 0.000000 0.000000 0.117647 0.117647 0.000000 0.000000 0.882353 0.058824 0.058824 0.823529 0.058824 0.058824 0.117647 0.058824 0.764706 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0106.1 MOTIF MA0106.2 TP53 letter-probability matrix: alength= 4 w= 15 nsites= 1231 E= 0 0.597888 0.000000 0.380991 0.021121 0.002437 0.967506 0.004062 0.025995 0.782291 0.036556 0.023558 0.157595 0.218522 0.008936 0.026807 0.745735 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.059301 0.484972 0.000000 0.455727 0.142161 0.664500 0.038180 0.155158 0.064988 0.746548 0.042242 0.146223 0.658002 0.131600 0.070674 0.139724 0.273761 0.036556 0.641755 0.047929 0.679935 0.000000 0.306255 0.013810 0.000000 0.995938 0.002437 0.001625 0.822908 0.021121 0.009748 0.146223 0.144598 0.034931 0.020309 0.800162 0.029245 0.004874 0.963444 0.002437 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0106.2 MOTIF MA0106.3 TP53 letter-probability matrix: alength= 4 w= 18 nsites= 17412 E= 0 0.433264 0.059557 0.376924 0.130255 0.761994 0.008407 0.176330 0.053269 0.002186 0.956520 0.000632 0.040663 0.882014 0.015081 0.048274 0.054631 0.080989 0.017713 0.006489 0.894809 0.000392 0.000098 0.999510 0.000000 0.012530 0.616957 0.005597 0.364916 0.056923 0.801279 0.019330 0.122468 0.060438 0.626814 0.113539 0.199208 0.221360 0.084727 0.572168 0.121745 0.151020 0.031856 0.751980 0.065144 0.440121 0.001611 0.546496 0.011771 0.000000 0.999742 0.000207 0.000052 0.892179 0.017257 0.010837 0.079727 0.091727 0.005931 0.004473 0.897869 0.015589 0.001573 0.979597 0.003242 0.039609 0.150415 0.005227 0.804749 0.071456 0.445777 0.040049 0.442718 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0106.3 MOTIF MA0525.1 TP63 letter-probability matrix: alength= 4 w= 20 nsites= 9632 E= 0 0.375104 0.181894 0.246262 0.196740 0.249377 0.138808 0.373650 0.238164 0.418086 0.056478 0.394726 0.130710 0.001973 0.950270 0.010590 0.037168 0.678571 0.170266 0.063953 0.087209 0.303779 0.026474 0.131125 0.538621 0.008513 0.000000 0.991487 0.000000 0.093023 0.456811 0.007683 0.442483 0.213663 0.427637 0.103613 0.255087 0.045370 0.726744 0.147114 0.080772 0.523775 0.212832 0.021595 0.241798 0.291944 0.102679 0.472903 0.132475 0.490656 0.020556 0.366487 0.122301 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.529589 0.192691 0.006852 0.270868 0.098941 0.084821 0.072155 0.744082 0.023360 0.000000 0.975291 0.001350 0.054817 0.566238 0.022114 0.356831 0.246989 0.424522 0.042359 0.286130 0.150125 0.391923 0.168293 0.289659 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0525.1 MOTIF MA0525.2 TP63 letter-probability matrix: alength= 4 w= 18 nsites= 2724 E= 0 0.582232 0.009545 0.366006 0.042217 0.916126 0.000405 0.074959 0.008509 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.965606 0.000000 0.032674 0.001720 0.224821 0.010721 0.000000 0.764457 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.004481 0.027209 0.000000 0.968310 0.031200 0.329688 0.008363 0.630749 0.202181 0.148910 0.644860 0.004050 0.034167 0.207749 0.505186 0.252898 0.312953 0.000315 0.671919 0.014812 0.959300 0.000000 0.021007 0.019694 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.917662 0.000000 0.000427 0.081911 0.021289 0.175135 0.002271 0.801306 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.014506 0.059799 0.000296 0.925400 0.194506 0.582408 0.054939 0.168147 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0525.2