MEME version 4

ALPHABET= ACGT

strands: + -

Background letter frequencies
A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25

MOTIF MA1035.1 TCP4
letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 1000 E= 0
 0.112000  0.001000  0.775000  0.112000
 0.000999  0.000999  0.997003  0.000999
 0.000999  0.000999  0.997003  0.000999
 0.831000  0.167000  0.001000  0.001000
 0.000999  0.997003  0.000999  0.000999
 0.000999  0.997003  0.000999  0.000999
 0.997000  0.001000  0.001000  0.001000
 0.001001  0.996997  0.001001  0.001001
URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1035.1

MOTIF MA1067.1 TCP5
letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 999 E= 0
 0.002002  0.002002  0.993994  0.002002
 0.001998  0.001998  0.994006  0.001998
 0.001998  0.001998  0.994006  0.001998
 0.994006  0.001998  0.001998  0.001998
 0.001998  0.994006  0.001998  0.001998
 0.001998  0.994006  0.001998  0.001998
 0.994006  0.001998  0.001998  0.001998
 0.002002  0.745746  0.002002  0.250250
URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1067.1

MOTIF MA1291.1 TCP7
letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 588 E= 0
 0.001701  0.000000  0.998299  0.000000
 0.000000  0.025510  0.000000  0.974490
 0.115646  0.000000  0.884354  0.000000
 0.000000  0.000000  1.000000  0.000000
 0.006803  0.001701  0.991497  0.000000
 0.387755  0.156463  0.275510  0.180272
 0.037415  0.874150  0.000000  0.088435
 0.003401  0.996599  0.000000  0.000000
 0.042517  0.945578  0.006803  0.005102
 0.767007  0.051020  0.127551  0.054422
 0.071429  0.545918  0.112245  0.270408
URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1291.1

MOTIF MA1428.1 TCP8
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 998 E= 0
 0.172345  0.240481  0.373747  0.213427
 0.041123  0.015045  0.803410  0.140421
 0.143287  0.029058  0.726453  0.101202
 0.150150  0.255255  0.433433  0.161161
 0.160481  0.653962  0.063190  0.122367
 0.032096  0.965898  0.002006  0.000000
 0.020040  0.903808  0.000000  0.076152
 0.865731  0.001002  0.113226  0.020040
 0.032032  0.725726  0.097097  0.145145
URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1428.1

MOTIF MA1285.1 TCP9
letter-probability matrix: alength= 4 w= 21 nsites= 395 E= 0
 0.194937  0.486076  0.151899  0.167089
 0.215190  0.518987  0.144304  0.121519
 0.493671  0.200000  0.129114  0.177215
 0.164557  0.225316  0.124051  0.486076
 0.126582  0.139241  0.197468  0.536709
 0.260759  0.146835  0.106329  0.486076
 0.164557  0.232911  0.382278  0.220253
 0.232911  0.430380  0.075949  0.260759
 0.225316  0.420253  0.086076  0.268354
 0.116456  0.032911  0.840506  0.010127
 0.002532  0.048101  0.002532  0.946835
 0.040506  0.000000  0.959494  0.000000
 0.002532  0.000000  0.997468  0.000000
 0.060759  0.000000  0.936709  0.002532
 0.134177  0.245570  0.058228  0.562025
 0.000000  0.982278  0.000000  0.017722
 0.005063  0.994937  0.000000  0.000000
 0.002532  0.939241  0.002532  0.055696
 0.901266  0.002532  0.096203  0.000000
 0.005063  0.875949  0.027848  0.091139
 0.263291  0.450633  0.091139  0.194937
URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1285.1

MOTIF MA1162.1 TCX2
letter-probability matrix: alength= 4 w= 15 nsites= 599 E= 0
 0.429048  0.081803  0.101836  0.387312
 0.225376  0.038397  0.046745  0.689482
 0.100167  0.068447  0.001669  0.829716
 0.090150  0.288815  0.068447  0.552588
 0.487479  0.220367  0.178631  0.113523
 0.933222  0.010017  0.043406  0.013356
 0.924875  0.023372  0.001669  0.050083
 0.858097  0.000000  0.023372  0.118531
 0.016694  0.001669  0.011686  0.969950
 0.000000  0.000000  0.000000  1.000000
 0.000000  0.530885  0.000000  0.469115
 0.726210  0.001669  0.272120  0.000000
 1.000000  0.000000  0.000000  0.000000
 1.000000  0.000000  0.000000  0.000000
 0.297162  0.155259  0.016694  0.530885
URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1162.1

MOTIF MA1682.1 TCX3
letter-probability matrix: alength= 4 w= 14 nsites= 971 E= 0
 0.323378  0.158599  0.092688  0.425335
 0.470649  0.130793  0.093718  0.304840
 0.721936  0.049434  0.064882  0.163749
 0.773429  0.038105  0.047374  0.141092
 0.805355  0.010299  0.037075  0.147271
 0.022657  0.006179  0.011329  0.959835
 0.024717  0.001030  0.002060  0.972194
 0.000000  1.000000  0.000000  0.000000
 0.968074  0.002060  0.011329  0.018538
 0.971164  0.000000  0.003090  0.025747
 0.983522  0.002060  0.003090  0.011329
 0.187436  0.061792  0.016478  0.734295
 0.325438  0.099897  0.063852  0.510814
 0.251287  0.158599  0.061792  0.528321
URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1682.1

MOTIF UN0411.1 TCX5
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 1000 E= 0
 0.324236  0.225255  0.225255  0.225255
 0.637246  0.022008  0.225389  0.115357
 0.000097  0.000097  0.000097  0.999710
 0.000097  0.000097  0.000097  0.999710
 0.000097  0.775533  0.000097  0.224274
 0.905686  0.000097  0.094218  0.000000
 0.999807  0.000097  0.000097  0.000000
 0.999807  0.000097  0.000097  0.000000
 0.130179  0.251034  0.024842  0.593945
 0.228089  0.228089  0.228089  0.315734
URL http://jaspar.genereg.net/matrix/UN0411.1

MOTIF MA1380.1 TCX6
letter-probability matrix: alength= 4 w= 15 nsites= 597 E= 0
 0.395310  0.000000  0.055276  0.549414
 0.000000  0.000000  0.000000  1.000000
 0.000000  0.000000  0.142379  0.857621
 0.000000  0.137353  0.000000  0.862647
 0.675042  0.000000  0.324958  0.000000
 1.000000  0.000000  0.000000  0.000000
 1.000000  0.000000  0.000000  0.000000
 0.152429  0.026801  0.000000  0.820771
 0.254606  0.160804  0.021776  0.562814
 0.013400  0.050251  0.000000  0.936348
 0.085427  0.030151  0.108878  0.775544
 0.232831  0.075377  0.082077  0.609715
 0.388610  0.026801  0.187605  0.396985
 0.711893  0.013400  0.033501  0.241206
 0.685092  0.031826  0.020101  0.262982
URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1380.1

MOTIF MA0431.1 TDA9
letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 0
 0.320000  0.240000  0.230000  0.210000
 0.000000  1.000000  0.000000  0.000000
 0.000000  1.000000  0.000000  0.000000
 0.000000  1.000000  0.000000  0.000000
 0.000000  1.000000  0.000000  0.000000
 0.300000  0.000000  0.360000  0.340000
 0.000000  1.000000  0.000000  0.000000
 0.435644  0.158416  0.029703  0.376238
 0.190000  0.350000  0.150000  0.310000
URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0431.1

