MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF MA1915.1 SoxB1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 20 nsites= 1000 E= 0 0.475000 0.288000 0.075000 0.162000 0.366000 0.436000 0.077000 0.121000 0.711000 0.066000 0.071000 0.152000 0.517000 0.084000 0.099000 0.300000 0.183816 0.100899 0.169830 0.545455 0.282000 0.148000 0.297000 0.273000 0.301000 0.247000 0.198000 0.254000 0.131000 0.672000 0.037000 0.160000 0.973000 0.005000 0.008000 0.014000 0.124000 0.010000 0.011000 0.855000 0.008000 0.006000 0.007000 0.979000 0.042042 0.030030 0.913914 0.014014 0.077000 0.032000 0.030000 0.861000 0.218781 0.212787 0.216783 0.351648 0.316000 0.244000 0.169000 0.271000 0.246000 0.202000 0.190000 0.362000 0.213786 0.188811 0.198801 0.398601 0.206000 0.178000 0.336000 0.280000 0.249000 0.170000 0.251000 0.330000 0.253000 0.196000 0.226000 0.325000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1915.1 MOTIF MA1916.1 SoxB2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 20 nsites= 1000 E= 0 0.350000 0.173000 0.200000 0.277000 0.356000 0.149000 0.220000 0.275000 0.339339 0.160160 0.232232 0.268268 0.276000 0.183000 0.242000 0.299000 0.246000 0.209000 0.269000 0.276000 0.121000 0.402000 0.226000 0.251000 0.186000 0.374000 0.064000 0.376000 0.873127 0.006993 0.019980 0.099900 0.015984 0.007992 0.008991 0.967033 0.019000 0.007000 0.019000 0.955000 0.048000 0.023000 0.919000 0.010000 0.022000 0.018000 0.014000 0.946000 0.101000 0.103000 0.102000 0.694000 0.233233 0.240240 0.147147 0.379379 0.230000 0.206000 0.190000 0.374000 0.238761 0.250749 0.213786 0.296703 0.245245 0.239239 0.209209 0.306306 0.242000 0.230000 0.197000 0.331000 0.245000 0.232000 0.180000 0.343000 0.253746 0.221778 0.166833 0.357642 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1916.1 MOTIF MA1917.1 SoxC letter-probability matrix: alength= 4 w= 20 nsites= 1000 E= 0 0.305000 0.250000 0.203000 0.242000 0.364000 0.175000 0.207000 0.254000 0.316316 0.184184 0.220220 0.279279 0.256743 0.188811 0.228771 0.325674 0.268000 0.196000 0.247000 0.289000 0.240000 0.240000 0.231000 0.289000 0.256000 0.276000 0.170000 0.298000 0.805000 0.035000 0.063000 0.097000 0.051000 0.034000 0.042000 0.873000 0.033000 0.024000 0.034000 0.909000 0.060060 0.042042 0.849850 0.048048 0.050949 0.033966 0.037962 0.877123 0.065934 0.058941 0.071928 0.803197 0.246246 0.215215 0.234234 0.304304 0.241241 0.208208 0.229229 0.321321 0.243756 0.208791 0.235764 0.311688 0.242757 0.219780 0.237762 0.299700 0.254745 0.214785 0.234765 0.295704 0.256000 0.216000 0.232000 0.296000 0.257000 0.219000 0.232000 0.292000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1917.1 MOTIF MA1918.1 SoxF letter-probability matrix: alength= 4 w= 20 nsites= 1000 E= 0 0.418000 0.238000 0.133000 0.211000 0.472000 0.103000 0.159000 0.266000 0.374000 0.130000 0.191000 0.305000 0.262262 0.150150 0.220220 0.367367 0.293293 0.176176 0.246246 0.284284 0.188000 0.350000 0.204000 0.258000 0.285000 0.327000 0.094000 0.294000 0.958000 0.006000 0.013000 0.023000 0.035000 0.010000 0.009000 0.946000 0.015000 0.008000 0.015000 0.962000 0.063936 0.028971 0.887113 0.019980 0.043000 0.022000 0.020000 0.915000 0.116000 0.123000 0.099000 0.662000 0.254000 0.260000 0.157000 0.329000 0.235000 0.208000 0.179000 0.378000 0.243000 0.212000 0.195000 0.350000 0.242000 0.217000 0.226000 0.315000 0.277000 0.188000 0.216000 0.319000 0.290000 0.177000 0.203000 0.330000 0.303000 0.187000 0.198000 0.312000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1918.1 MOTIF UN0264.1 Sp7 letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 5622 E= 0 0.336535 0.243508 0.226788 0.193170 0.250267 0.300783 0.188367 0.260583 0.106546 0.775347 0.051405 0.066702 0.026147 0.067236 0.004803 0.901814 0.779616 0.040733 0.150836 0.028815 0.026681 0.030416 0.020100 0.922803 0.897190 0.039666 0.025969 0.037175 0.937567 0.019032 0.011562 0.031839 0.030060 0.014230 0.009072 0.946638 0.127535 0.165777 0.103166 0.603522 0.514052 0.095873 0.098897 0.291178 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/UN0264.1 MOTIF MA0080.3 Spi1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 15 nsites= 63715 E= 0 0.391697 0.164326 0.275555 0.168422 0.424876 0.123597 0.345617 0.105909 0.611567 0.051966 0.216370 0.120097 0.663125 0.048701 0.188841 0.099333 0.607110 0.008381 0.180224 0.204285 0.197395 0.127443 0.675163 0.000000 0.711857 0.050365 0.230448 0.007330 0.075351 0.000000 0.924649 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.999215 0.000000 0.000785 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.053928 0.159225 0.786848 0.000000 0.129483 0.050585 0.053127 0.766805 0.061100 0.188935 0.714133 0.035831 0.343891 0.188778 0.329640 0.137691 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0080.3 MOTIF MA0080.6 Spi1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 17 nsites= 105198 E= 0 0.394485 0.147037 0.262961 0.195517 0.356670 0.141647 0.348191 0.153492 0.632436 0.065239 0.216801 0.085524 0.782144 0.054735 0.100895 0.062226 0.774359 0.022149 0.097150 0.106342 0.082093 0.115981 0.760338 0.041588 0.855073 0.024658 0.091599 0.028670 0.038755 0.005228 0.944505 0.011512 0.019278 0.007899 0.963735 0.009088 0.969714 0.010409 0.010105 0.009772 0.946111 0.009107 0.017320 0.027462 0.072397 0.067178 0.847355 0.013071 0.161572 0.035324 0.048746 0.754358 0.094793 0.057748 0.792648 0.054811 0.220479 0.110050 0.548195 0.121276 0.373828 0.165716 0.264958 0.195498 0.355225 0.162199 0.249159 0.233417 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0080.6 MOTIF MA0111.1 Spz1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 12 E= 0 0.750000 0.000000 0.250000 0.000000 0.000000 0.166667 0.750000 0.083333 0.166667 0.000000 0.833333 0.000000 0.000000 0.000000 0.916667 0.083333 0.083333 0.000000 0.083333 0.833333 0.666667 0.000000 0.000000 0.333333 0.500000 0.000000 0.166667 0.333333 0.083333 0.750000 0.166667 0.000000 0.833333 0.000000 0.166667 0.000000 0.000000 0.083333 0.750000 0.166667 0.166667 0.666667 0.166667 0.000000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0111.1 MOTIF MA0829.1 Srebf1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 1875 E= 0 0.633600 0.071467 0.286400 0.008533 0.101355 0.026091 0.007025 0.865529 0.003466 0.996534 0.000000 0.000000 0.979001 0.000000 0.015323 0.005675 0.000000 0.959399 0.030033 0.010567 0.005084 0.117946 0.876970 0.000000 0.008767 0.043288 0.002740 0.945205 0.000577 0.004039 0.995384 0.000000 0.939031 0.011976 0.004355 0.044638 0.010532 0.488914 0.033259 0.467295 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0829.1 MOTIF UN0470.1 Srf letter-probability matrix: alength= 4 w= 20 nsites= 999 E= 0 0.244244 0.195195 0.239239 0.321321 0.232000 0.209000 0.304000 0.255000 0.232000 0.188000 0.292000 0.288000 0.156843 0.580420 0.129870 0.132867 0.067000 0.643000 0.068000 0.222000 0.366000 0.196000 0.190000 0.248000 0.256743 0.145854 0.100899 0.496503 0.819000 0.026000 0.062000 0.093000 0.066000 0.053000 0.031000 0.850000 0.880000 0.012000 0.024000 0.084000 0.098000 0.051000 0.041000 0.810000 0.063000 0.014000 0.899000 0.024000 0.025000 0.031000 0.905000 0.039000 0.239000 0.235000 0.253000 0.273000 0.254254 0.262262 0.271271 0.212212 0.313000 0.219000 0.207000 0.261000 0.216000 0.221000 0.251000 0.312000 0.271000 0.235000 0.254000 0.240000 0.249000 0.248000 0.229000 0.274000 0.261000 0.252000 0.233000 0.254000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/UN0470.1