MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF MA0399.1 SUT1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 7 nsites= 230 E= 0 0.100000 0.617391 0.156522 0.126087 0.201681 0.021008 0.777311 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.031008 0.236434 0.728682 0.003876 0.000000 0.169118 0.830882 0.000000 0.208511 0.148936 0.642553 0.000000 0.189655 0.060345 0.732759 0.017241 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0399.1 MOTIF MA0400.1 SUT2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 20 nsites= 998 E= 0 0.333667 0.232465 0.112224 0.321643 0.225451 0.206413 0.264529 0.303607 0.269809 0.218656 0.277834 0.233701 0.354354 0.200200 0.100100 0.345345 0.248497 0.216433 0.153307 0.381764 0.523046 0.085170 0.287575 0.104208 0.941884 0.006012 0.012024 0.040080 0.972946 0.000000 0.011022 0.016032 0.000000 0.710421 0.287575 0.002004 0.001002 0.016032 0.000000 0.982966 0.002006 0.994985 0.001003 0.002006 0.001002 0.985972 0.012024 0.001002 0.002004 0.001002 0.994990 0.002004 0.791374 0.016048 0.168506 0.024072 0.524574 0.080241 0.257773 0.137412 0.375752 0.252505 0.154309 0.217435 0.338338 0.214214 0.168168 0.279279 0.279559 0.204409 0.209419 0.306613 0.163327 0.253507 0.252505 0.330661 0.281281 0.136136 0.244244 0.338338 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0400.1 MOTIF MA0555.1 SVP letter-probability matrix: alength= 4 w= 20 nsites= 92 E= 0 0.304348 0.260870 0.228261 0.206522 0.304348 0.119565 0.086957 0.489130 0.304348 0.010870 0.108696 0.576087 0.358696 0.173913 0.119565 0.347826 0.076087 0.923913 0.000000 0.000000 0.032609 0.858696 0.010870 0.097826 0.630435 0.173913 0.076087 0.119565 0.728261 0.054348 0.086957 0.130435 0.934783 0.000000 0.000000 0.065217 0.836957 0.010870 0.021739 0.130435 0.847826 0.086957 0.032609 0.032609 0.369565 0.108696 0.152174 0.369565 0.173913 0.000000 0.804348 0.021739 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.771739 0.108696 0.000000 0.119565 0.913043 0.021739 0.021739 0.043478 0.836957 0.076087 0.021739 0.065217 0.369565 0.086957 0.423913 0.119565 0.543478 0.173913 0.054348 0.228261 0.413043 0.228261 0.032609 0.326087 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0555.1 MOTIF MA0401.1 SWI4 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 0 0.620000 0.080000 0.150000 0.150000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.150000 0.000000 0.850000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.940000 0.020000 0.020000 0.020000 0.613861 0.079208 0.079208 0.227723 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0401.1 MOTIF MA0402.1 SWI5 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 101 E= 0 0.079208 0.079208 0.227723 0.613861 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.040000 0.040000 0.270000 0.650000 0.250000 0.250000 0.100000 0.400000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0402.1 MOTIF UN0468.1 Sall-b letter-probability matrix: alength= 4 w= 20 nsites= 1000 E= 0 0.309000 0.197000 0.193000 0.301000 0.318318 0.169169 0.209209 0.303303 0.320679 0.163836 0.194805 0.320679 0.311000 0.185000 0.212000 0.292000 0.284000 0.213000 0.194000 0.309000 0.280000 0.178000 0.308000 0.234000 0.299000 0.260000 0.176000 0.265000 0.826174 0.026973 0.074925 0.071928 0.015015 0.058058 0.008008 0.918919 0.952000 0.007000 0.027000 0.014000 0.097000 0.028000 0.019000 0.856000 0.051948 0.049950 0.059940 0.838162 0.770771 0.098098 0.070070 0.061061 0.380380 0.160160 0.127127 0.332332 0.292000 0.164000 0.179000 0.365000 0.352000 0.179000 0.168000 0.301000 0.313000 0.195000 0.180000 0.312000 0.274000 0.211000 0.189000 0.326000 0.297702 0.216783 0.195804 0.289710 0.291291 0.209209 0.201201 0.298298 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/UN0468.1 MOTIF UN0262.1 Sall4 letter-probability matrix: alength= 4 w= 13 nsites= 9248 E= 0 0.148789 0.061311 0.639922 0.149978 0.427660 0.200476 0.066933 0.304931 0.183607 0.048875 0.030601 0.736916 0.979779 0.004109 0.006055 0.010056 0.014814 0.944853 0.013625 0.026708 0.929931 0.009840 0.008218 0.052011 0.802119 0.033196 0.029736 0.134948 0.599373 0.014165 0.016652 0.369810 0.042063 0.019896 0.913603 0.024438 0.030385 0.012868 0.013300 0.943447 0.614619 0.059905 0.111592 0.213884 0.333910 0.074503 0.189879 0.401708 0.157980 0.637219 0.074719 0.130082 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/UN0262.1 MOTIF MA0203.1 Scr letter-probability matrix: alength= 4 w= 7 nsites= 25 E= 0 0.120000 0.280000 0.000000 0.600000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.720000 0.280000 0.920000 0.000000 0.080000 0.000000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0203.1 MOTIF MA0720.1 Shox2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 18179 E= 0 0.131470 0.423291 0.181088 0.264151 0.050500 0.465645 0.011761 0.472093 0.909086 0.031305 0.021303 0.038306 0.988043 0.007500 0.000163 0.004294 0.001592 0.000659 0.000000 0.997750 0.029568 0.026992 0.043089 0.900352 0.941771 0.009998 0.001865 0.046366 0.359886 0.166190 0.348608 0.125316 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0720.1 MOTIF UN0469.1 Six1-2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 20 nsites= 1000 E= 0 0.250000 0.262000 0.237000 0.251000 0.244000 0.223000 0.314000 0.219000 0.274000 0.228000 0.221000 0.277000 0.338000 0.248000 0.186000 0.228000 0.416000 0.195000 0.173000 0.216000 0.262262 0.290290 0.180180 0.267267 0.309000 0.240000 0.220000 0.231000 0.052947 0.074925 0.049950 0.822178 0.083000 0.034000 0.826000 0.057000 0.884000 0.023000 0.022000 0.071000 0.066000 0.072000 0.025000 0.837000 0.900000 0.050000 0.026000 0.024000 0.035035 0.846847 0.041041 0.077077 0.238000 0.340000 0.235000 0.187000 0.239000 0.298000 0.224000 0.239000 0.263000 0.235000 0.243000 0.259000 0.351000 0.211000 0.192000 0.246000 0.261000 0.271000 0.198000 0.270000 0.285000 0.297000 0.190000 0.228000 0.245000 0.331000 0.198000 0.226000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/UN0469.1