MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF MA0874.1 Arx letter-probability matrix: alength= 4 w= 17 nsites= 100 E= 0 0.240000 0.220000 0.400000 0.140000 0.130000 0.160000 0.190000 0.520000 0.158416 0.366337 0.287129 0.188119 0.217822 0.554455 0.128713 0.099010 0.495050 0.059406 0.376238 0.069307 0.010000 0.380000 0.010000 0.600000 0.010000 0.130000 0.000000 0.860000 0.989899 0.000000 0.000000 0.010101 0.980198 0.000000 0.009901 0.009901 0.009901 0.009901 0.000000 0.980198 0.010101 0.000000 0.000000 0.989899 0.860000 0.000000 0.130000 0.010000 0.600000 0.010000 0.380000 0.010000 0.160000 0.160000 0.140000 0.540000 0.180000 0.110000 0.440000 0.270000 0.090000 0.360000 0.370000 0.180000 0.530000 0.100000 0.070000 0.300000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0874.1 MOTIF MA0816.1 Ascl2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 352 E= 0 0.673295 0.102273 0.178977 0.045455 0.374269 0.119883 0.502924 0.002924 0.009868 0.986842 0.000000 0.003289 0.952381 0.000000 0.000000 0.047619 0.020115 0.066092 0.862069 0.051724 0.009804 0.980392 0.006536 0.003268 0.013158 0.000000 0.000000 0.986842 0.000000 0.003300 0.990099 0.006601 0.018692 0.641745 0.046729 0.292835 0.093923 0.279006 0.077348 0.549724 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0816.1 MOTIF MA1188.1 At3g11280 letter-probability matrix: alength= 4 w= 14 nsites= 582 E= 0 0.620275 0.079038 0.103093 0.197595 0.446735 0.027491 0.048110 0.477663 0.049828 0.560137 0.058419 0.331615 0.201031 0.618557 0.109966 0.070447 0.000000 0.029210 0.000000 0.970790 0.006873 0.159794 0.000000 0.833333 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.005155 0.010309 0.984536 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.206186 0.247423 0.037801 0.508591 0.209622 0.108247 0.089347 0.592784 0.324742 0.335052 0.087629 0.252577 0.498282 0.025773 0.048110 0.427835 0.192440 0.266323 0.051546 0.489691 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1188.1 MOTIF UN0394.1 AtPLATZ6 letter-probability matrix: alength= 4 w= 15 nsites= 1000 E= 0 0.580000 0.070000 0.308333 0.041667 0.005000 0.006667 0.988333 0.000000 0.968334 0.005000 0.003333 0.023333 0.921667 0.008333 0.016667 0.053333 0.075000 0.238333 0.550000 0.136667 0.288333 0.336667 0.188333 0.186667 0.098333 0.041667 0.011667 0.848333 0.013333 0.000000 0.006667 0.980000 0.003333 0.985000 0.005000 0.006667 0.000000 0.141667 0.046667 0.811666 0.778333 0.036667 0.183333 0.001667 0.001667 0.010000 0.988333 0.000000 0.960000 0.006667 0.008333 0.025000 0.700000 0.056667 0.110000 0.133333 0.248333 0.186667 0.378333 0.186667 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/UN0394.1 MOTIF MA1844.1 Atbf letter-probability matrix: alength= 4 w= 20 nsites= 1000 E= 0 0.381000 0.132000 0.153000 0.334000 0.312687 0.139860 0.163836 0.383616 0.282000 0.162000 0.196000 0.360000 0.287712 0.187812 0.217782 0.306693 0.268731 0.197802 0.200799 0.332667 0.350000 0.214000 0.195000 0.241000 0.374000 0.192000 0.232000 0.202000 0.099000 0.134000 0.113000 0.654000 0.038000 0.038000 0.014000 0.910000 0.913000 0.028000 0.030000 0.029000 0.930931 0.018018 0.024024 0.027027 0.031968 0.024975 0.026973 0.916084 0.043956 0.034965 0.059940 0.861139 0.481000 0.096000 0.245000 0.178000 0.283000 0.252000 0.241000 0.224000 0.258000 0.243000 0.199000 0.300000 0.290000 0.208000 0.184000 0.318000 0.291708 0.197802 0.164835 0.345654 0.303000 0.182000 0.152000 0.363000 0.356000 0.162000 0.141000 0.341000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1844.1 MOTIF MA0604.1 Atf1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 1000 E= 0 0.462000 0.086000 0.387000 0.065000 0.024000 0.016000 0.000000 0.960000 0.000000 0.022000 0.803000 0.175000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.007000 0.000000 0.993000 0.000000 0.090000 0.198000 0.000000 0.712000 0.599401 0.137862 0.162837 0.099900 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0604.1 MOTIF MA0605.1 Atf3 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 1000 E= 0 0.087000 0.131000 0.695000 0.087000 0.828000 0.000000 0.172000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.952000 0.048000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.108108 0.000000 0.810811 0.081081 0.096903 0.193806 0.032967 0.676324 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0605.1 MOTIF MA1988.1 Atf3 letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 54692 E= 0 0.258978 0.171963 0.288397 0.280663 0.404374 0.199298 0.295528 0.100801 0.010623 0.012232 0.006527 0.970617 0.028542 0.008100 0.891794 0.071564 0.974877 0.006509 0.008612 0.010001 0.041359 0.835040 0.082242 0.041359 0.042748 0.009215 0.024958 0.923078 0.099119 0.852227 0.010495 0.038159 0.951620 0.012305 0.019857 0.016218 0.150278 0.238444 0.239395 0.371883 0.290993 0.260422 0.187962 0.260623 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1988.1 MOTIF UN0441.1 Atf3-like letter-probability matrix: alength= 4 w= 20 nsites= 1000 E= 0 0.258000 0.263000 0.247000 0.232000 0.271271 0.254254 0.253253 0.221221 0.260000 0.246000 0.256000 0.238000 0.251251 0.240240 0.279279 0.229229 0.211000 0.255000 0.265000 0.269000 0.203796 0.189810 0.416583 0.189810 0.487000 0.140000 0.316000 0.057000 0.008008 0.014014 0.009009 0.968969 0.020979 0.033966 0.803197 0.141858 0.952953 0.010010 0.022022 0.015015 0.008000 0.877000 0.021000 0.094000 0.077000 0.016000 0.896000 0.011000 0.038038 0.071071 0.037037 0.853854 0.292000 0.461000 0.158000 0.089000 0.675325 0.066933 0.134865 0.122877 0.106000 0.281000 0.201000 0.412000 0.207000 0.359000 0.209000 0.225000 0.246000 0.252000 0.271000 0.231000 0.220000 0.249000 0.267000 0.264000 0.224000 0.238000 0.270000 0.268000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/UN0441.1 MOTIF UN0442.1 Atf4-5 letter-probability matrix: alength= 4 w= 22 nsites= 1000 E= 0 0.254000 0.239000 0.267000 0.240000 0.281000 0.220000 0.244000 0.255000 0.302302 0.203203 0.239239 0.255255 0.271271 0.227227 0.254254 0.247247 0.274725 0.221778 0.247752 0.255744 0.225000 0.143000 0.419000 0.213000 0.173000 0.180000 0.438000 0.209000 0.588000 0.220000 0.170000 0.022000 0.010000 0.018000 0.007000 0.965000 0.019000 0.037000 0.817000 0.127000 0.924925 0.011011 0.034034 0.030030 0.008991 0.831169 0.010989 0.148851 0.157000 0.012000 0.821000 0.010000 0.026026 0.043043 0.013013 0.917918 0.150000 0.763000 0.062000 0.025000 0.847000 0.035000 0.063000 0.055000 0.050000 0.215000 0.298000 0.437000 0.219000 0.437000 0.171000 0.173000 0.204000 0.416000 0.150000 0.230000 0.262000 0.244000 0.221000 0.273000 0.244755 0.256743 0.225774 0.272727 0.249000 0.254000 0.207000 0.290000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/UN0442.1