MEME version 4

ALPHABET= ACGT

strands: + -

Background letter frequencies
A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25

MOTIF MA0385.1 SOK2
letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 101 E= 0
 0.495050  0.188119  0.158416  0.158416
 0.150000  0.490000  0.180000  0.180000
 0.410000  0.470000  0.090000  0.030000
 0.040000  0.010000  0.040000  0.910000
 0.040000  0.010000  0.940000  0.010000
 0.040000  0.910000  0.010000  0.040000
 0.970000  0.010000  0.010000  0.010000
 0.050000  0.050000  0.500000  0.400000
 0.170000  0.210000  0.520000  0.100000
 0.280000  0.320000  0.220000  0.180000
 0.303030  0.232323  0.232323  0.232323
URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0385.1

MOTIF MA1379.1 SOL1
letter-probability matrix: alength= 4 w= 15 nsites= 600 E= 0
 0.320000  0.028333  0.045000  0.606667
 0.158333  0.026667  0.010000  0.805000
 0.278333  0.061667  0.011667  0.648333
 0.365000  0.115000  0.076667  0.443333
 0.735000  0.090000  0.116667  0.058333
 0.905000  0.000000  0.071667  0.023333
 0.776667  0.005000  0.110000  0.108333
 0.806667  0.000000  0.038333  0.155000
 0.000000  0.000000  0.000000  1.000000
 0.000000  0.000000  0.000000  1.000000
 0.000000  0.281667  0.000000  0.718333
 0.803333  0.000000  0.196667  0.000000
 0.925000  0.075000  0.000000  0.000000
 0.998333  0.000000  0.001667  0.000000
 0.446667  0.026667  0.000000  0.526667
URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1379.1

MOTIF MA0442.1 SOX10
letter-probability matrix: alength= 4 w= 6 nsites= 22 E= 0
 0.000000  0.863636  0.000000  0.136364
 0.363636  0.090909  0.090909  0.454545
 0.000000  0.045455  0.181818  0.772727
 0.000000  0.000000  0.000000  1.000000
 0.000000  0.136364  0.863636  0.000000
 0.000000  0.000000  0.045455  0.954545
URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0442.1

MOTIF MA0442.2 SOX10
letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 2055 E= 0
 0.332360  0.193187  0.256448  0.218005
 0.351825  0.137713  0.277859  0.232603
 0.544039  0.181022  0.154258  0.120681
 0.984428  0.001946  0.001460  0.012165
 0.001460  0.967883  0.005353  0.025304
 0.987348  0.003406  0.003406  0.005839
 0.957664  0.013625  0.009732  0.018978
 0.953285  0.011192  0.005839  0.029684
 0.004866  0.006326  0.979075  0.009732
 0.324088  0.268613  0.301217  0.106083
 0.310462  0.270073  0.245742  0.173723
URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0442.2

MOTIF MA1561.1 SOX12
letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 1368 E= 0
 0.624269  0.195175  0.079678  0.100877
 0.133858  0.747157  0.050744  0.068241
 0.048387  0.860887  0.034274  0.056452
 0.048205  0.026667  0.875897  0.049231
 0.967157  0.029445  0.002265  0.001133
 0.993023  0.002326  0.004651  0.000000
 0.000000  0.996499  0.000000  0.003501
 1.000000  0.000000  0.000000  0.000000
 0.846383  0.090188  0.043608  0.019822
 0.103118  0.168665  0.045564  0.682654
 0.231850  0.245902  0.357143  0.165105
URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1561.1

MOTIF MA1120.1 SOX13
letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 4552 E= 0
 0.338093  0.145650  0.306459  0.209798
 0.394332  0.210457  0.230448  0.164763
 0.977812  0.004833  0.008787  0.008568
 0.012083  0.939367  0.013181  0.035369
 0.951011  0.012083  0.010984  0.025923
 0.964411  0.010545  0.013840  0.011204
 0.034271  0.016916  0.006151  0.942663
 0.128515  0.012522  0.842926  0.016037
 0.170914  0.142135  0.585677  0.101274
 0.269772  0.276142  0.235940  0.218146
 0.269772  0.247364  0.229789  0.253076
URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1120.1

MOTIF MA1562.1 SOX14
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 1255 E= 0
 0.211155  0.473307  0.170518  0.145020
 0.084472  0.737888  0.054658  0.122981
 0.060606  0.024793  0.818182  0.096419
 0.891892  0.012012  0.040541  0.055556
 0.948882  0.020767  0.000000  0.030351
 0.006400  0.950400  0.016000  0.027200
 1.000000  0.000000  0.000000  0.000000
 0.964286  0.027597  0.000000  0.008117
 0.000000  0.003268  0.026144  0.970588
 0.126263  0.112795  0.626263  0.134680
URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1562.1

MOTIF MA1152.1 SOX15
letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 1000 E= 0
 0.032000  0.554000  0.147000  0.267000
 0.061938  0.411588  0.025974  0.500500
 0.630370  0.002997  0.004995  0.361638
 0.003000  0.003000  0.006000  0.988000
 0.002997  0.001998  0.001998  0.993007
 0.083083  0.021021  0.890891  0.005005
 0.024000  0.002000  0.003000  0.971000
 0.180180  0.188188  0.125125  0.506507
 0.215000  0.253000  0.114000  0.418000
 0.240759  0.187812  0.164835  0.406593
URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1152.1

MOTIF MA1563.1 SOX18
letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 589 E= 0
 0.259762  0.366723  0.285229  0.088285
 0.688084  0.038551  0.163551  0.109813
 0.000000  1.000000  0.000000  0.000000
 0.606591  0.143151  0.222451  0.027806
 0.760982  0.134367  0.086563  0.018088
 0.000000  0.388370  0.000000  0.611630
 0.241956  0.000000  0.758044  0.000000
 0.195616  0.483980  0.320405  0.000000
URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1563.1

MOTIF MA1563.2 SOX18
letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 709 E= 0
 0.598025  0.114245  0.239774  0.047955
 1.000000  0.000000  0.000000  0.000000
 0.000000  0.820116  0.176015  0.003868
 1.000000  0.000000  0.000000  0.000000
 0.890756  0.073529  0.035714  0.000000
 0.000000  0.000000  0.000000  1.000000
 0.311350  0.000000  0.338957  0.349693
 0.281503  0.406043  0.312454  0.000000
URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1563.2

