MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF MA0166.1 Antp letter-probability matrix: alength= 4 w= 7 nsites= 16 E= 0 0.062500 0.062500 0.000000 0.875000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.562500 0.437500 0.937500 0.000000 0.062500 0.000000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0166.1 MOTIF MA0007.1 Ar letter-probability matrix: alength= 4 w= 22 nsites= 24 E= 0 0.375000 0.291667 0.083333 0.250000 0.375000 0.083333 0.125000 0.416667 0.458333 0.125000 0.125000 0.291667 0.666667 0.041667 0.291667 0.000000 0.000000 0.000000 0.916667 0.083333 0.500000 0.250000 0.041667 0.208333 0.875000 0.083333 0.000000 0.041667 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.625000 0.000000 0.333333 0.041667 0.166667 0.375000 0.083333 0.375000 0.208333 0.458333 0.083333 0.250000 0.250000 0.375000 0.375000 0.000000 0.125000 0.208333 0.041667 0.625000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.166667 0.000000 0.000000 0.833333 0.458333 0.208333 0.041667 0.291667 0.041667 0.916667 0.041667 0.000000 0.125000 0.666667 0.041667 0.166667 0.250000 0.291667 0.208333 0.250000 0.250000 0.208333 0.375000 0.166667 0.416667 0.458333 0.000000 0.125000 0.208333 0.458333 0.250000 0.083333 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0007.1 MOTIF MA0007.3 Ar letter-probability matrix: alength= 4 w= 17 nsites= 3102 E= 0 0.352676 0.053836 0.501289 0.092199 0.293805 0.005319 0.694931 0.005945 0.002077 0.000000 0.996365 0.001558 0.443498 0.107818 0.068173 0.380511 0.994949 0.002296 0.001377 0.001377 0.001818 0.995000 0.002273 0.000909 0.867884 0.008692 0.118644 0.004781 0.080665 0.497771 0.132955 0.288610 0.209955 0.228668 0.370883 0.190494 0.261698 0.086655 0.579896 0.071750 0.011591 0.097295 0.002810 0.888303 0.000000 0.001104 0.998620 0.000276 0.007874 0.001432 0.000000 0.990694 0.454200 0.042569 0.087419 0.415811 0.003210 0.993122 0.000000 0.003668 0.013306 0.641164 0.000832 0.344699 0.154788 0.393089 0.123470 0.328654 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0007.3 MOTIF UN0670.1 Arid1A letter-probability matrix: alength= 4 w= 13 nsites= 2104 E= 0 0.195342 0.318441 0.214354 0.271863 0.281369 0.211027 0.352662 0.154943 0.240970 0.194867 0.160171 0.403992 0.133080 0.070817 0.770913 0.025190 0.011407 0.954373 0.009506 0.024715 0.906369 0.009030 0.077947 0.006654 0.007129 0.965304 0.009506 0.018061 0.867871 0.018061 0.107890 0.006179 0.003802 0.033270 0.007129 0.955798 0.029943 0.016160 0.943916 0.009981 0.017586 0.645913 0.171103 0.165399 0.249525 0.196293 0.326046 0.228137 0.155418 0.385932 0.182510 0.276141 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/UN0670.1 MOTIF UN0440.1 Arid3 letter-probability matrix: alength= 4 w= 20 nsites= 999 E= 0 0.295295 0.202202 0.216216 0.286286 0.285714 0.206793 0.218781 0.288711 0.276000 0.212000 0.219000 0.293000 0.269000 0.215000 0.224000 0.292000 0.280000 0.208000 0.216000 0.296000 0.308691 0.194805 0.217782 0.278721 0.361638 0.163836 0.163836 0.310689 0.063063 0.043043 0.047047 0.846847 0.053000 0.044000 0.034000 0.869000 0.823177 0.038961 0.064935 0.072927 0.904905 0.020020 0.020020 0.055055 0.058941 0.020979 0.023976 0.896104 0.082000 0.073000 0.067000 0.778000 0.336000 0.182000 0.217000 0.265000 0.315000 0.218000 0.212000 0.255000 0.279000 0.206000 0.210000 0.305000 0.260260 0.219219 0.200200 0.320320 0.260000 0.218000 0.206000 0.316000 0.258258 0.221221 0.213213 0.307307 0.264000 0.219000 0.213000 0.304000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/UN0440.1 MOTIF MA0151.1 Arid3a letter-probability matrix: alength= 4 w= 6 nsites= 27 E= 0 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.037037 0.333333 0.000000 0.629630 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.740741 0.000000 0.037037 0.222222 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0151.1 MOTIF MA0601.1 Arid3b letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 999 E= 0 0.468468 0.177177 0.177177 0.177177 0.273273 0.080080 0.080080 0.566567 0.609000 0.119000 0.034000 0.238000 0.104104 0.000000 0.000000 0.895896 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.911000 0.000000 0.000000 0.089000 0.089000 0.000000 0.000000 0.911000 0.261738 0.167832 0.072927 0.497502 0.490000 0.170000 0.170000 0.170000 0.351351 0.216216 0.216216 0.216216 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0601.1 MOTIF MA0602.1 Arid5a letter-probability matrix: alength= 4 w= 14 nsites= 101 E= 0 0.178218 0.425743 0.227723 0.168317 0.161616 0.323232 0.030303 0.484848 0.850000 0.030000 0.070000 0.050000 0.969697 0.000000 0.010101 0.020202 0.060000 0.000000 0.010000 0.930000 0.920792 0.009901 0.009901 0.059406 0.020000 0.010000 0.010000 0.960000 0.040000 0.090000 0.040000 0.830000 0.230000 0.030000 0.520000 0.220000 0.343434 0.353535 0.181818 0.121212 0.290000 0.130000 0.270000 0.310000 0.570000 0.080000 0.190000 0.160000 0.290000 0.180000 0.260000 0.270000 0.343434 0.232323 0.151515 0.272727 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0602.1 MOTIF MA0004.1 Arnt letter-probability matrix: alength= 4 w= 6 nsites= 20 E= 0 0.200000 0.800000 0.000000 0.000000 0.950000 0.000000 0.050000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0004.1 MOTIF MA0603.1 Arntl letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 1000 E= 0 0.251000 0.229000 0.261000 0.259000 0.246000 0.125000 0.558000 0.071000 0.061938 0.043956 0.142857 0.751249 0.003000 0.997000 0.000000 0.000000 0.953000 0.016000 0.010000 0.021000 0.002000 0.965000 0.009000 0.024000 0.048000 0.003000 0.946000 0.003000 0.054000 0.058000 0.051000 0.837000 0.009009 0.004004 0.938939 0.048048 0.255000 0.331000 0.146000 0.268000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0603.1