MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF MA1555.1 RXRB letter-probability matrix: alength= 4 w= 14 nsites= 1803 E= 0 0.340544 0.105380 0.471991 0.082085 0.497338 0.031416 0.463259 0.007987 0.029589 0.014544 0.904213 0.051655 0.012623 0.018233 0.842917 0.126227 0.016827 0.040865 0.075481 0.866827 0.011558 0.906030 0.020603 0.061809 0.661370 0.008219 0.326575 0.003836 0.005873 0.031500 0.000000 0.962627 0.047472 0.018060 0.930341 0.004128 0.943485 0.027734 0.021455 0.007326 0.143989 0.840168 0.005126 0.010718 0.029728 0.924141 0.016402 0.029728 0.009809 0.471935 0.007629 0.510627 0.068774 0.481420 0.107598 0.342207 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1555.1 MOTIF MA0856.1 RXRG letter-probability matrix: alength= 4 w= 14 nsites= 34936 E= 0 0.223952 0.108770 0.613293 0.053984 0.404125 0.001792 0.593514 0.000569 0.002069 0.000169 0.994511 0.003251 0.003868 0.000341 0.846145 0.149645 0.000127 0.000891 0.003207 0.995775 0.000454 0.923740 0.011899 0.063906 0.997895 0.000000 0.002000 0.000105 0.956753 0.000389 0.026925 0.015933 0.952687 0.000000 0.047168 0.000144 0.000304 0.000034 0.998985 0.000677 0.000377 0.000031 0.876653 0.122938 0.000053 0.000451 0.003553 0.995943 0.001445 0.925669 0.017323 0.055563 0.938751 0.001101 0.059457 0.000691 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0856.1 MOTIF MA1556.1 RXRG letter-probability matrix: alength= 4 w= 14 nsites= 2117 E= 0 0.379310 0.077468 0.505905 0.037317 0.595104 0.003296 0.401601 0.000000 0.000000 0.048112 0.951888 0.000000 0.003106 0.013753 0.939219 0.043922 0.005538 0.002307 0.015228 0.976927 0.000000 0.992034 0.000469 0.007498 0.992964 0.007036 0.000000 0.000000 0.000000 0.395843 0.000000 0.604157 0.028294 0.024315 0.935897 0.011494 0.837421 0.084652 0.030854 0.047073 0.060302 0.886516 0.026382 0.026801 0.058205 0.855699 0.071140 0.014956 0.010469 0.401457 0.025944 0.562130 0.063739 0.470255 0.106704 0.359301 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1556.1 MOTIF MA0857.1 Rarb letter-probability matrix: alength= 4 w= 16 nsites= 1949 E= 0 0.563366 0.131862 0.092868 0.211904 0.787843 0.019287 0.139684 0.053185 0.842342 0.001287 0.156371 0.000000 0.000000 0.000000 0.999491 0.000509 0.000000 0.000507 0.983781 0.015712 0.003330 0.002220 0.008324 0.986127 0.000750 0.986507 0.006747 0.005997 0.991422 0.000000 0.008578 0.000000 0.940857 0.006639 0.001811 0.050694 0.877737 0.002433 0.105231 0.014599 0.980904 0.000000 0.019096 0.000000 0.000507 0.000000 0.999493 0.000000 0.000000 0.000489 0.866634 0.132877 0.000578 0.004624 0.002312 0.992486 0.000704 0.992254 0.001408 0.005634 0.996811 0.000000 0.001913 0.001276 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0857.1 MOTIF MA0858.1 Rarb letter-probability matrix: alength= 4 w= 17 nsites= 652 E= 0 0.935583 0.004601 0.059816 0.000000 0.000000 0.001401 0.998599 0.000000 0.002907 0.001453 0.963663 0.031977 0.000000 0.002874 0.000000 0.997126 0.001449 0.994203 0.002899 0.001449 0.994536 0.000000 0.005464 0.000000 0.405817 0.290859 0.020776 0.282548 0.353191 0.357447 0.198582 0.090780 0.056380 0.354599 0.172107 0.416914 0.652757 0.050671 0.061103 0.235469 0.637821 0.006410 0.349359 0.006410 0.943870 0.000000 0.054653 0.001477 0.001462 0.001462 0.997076 0.000000 0.000000 0.002894 0.959479 0.037627 0.000000 0.004405 0.005874 0.989721 0.000000 0.994798 0.000000 0.005202 0.995690 0.000000 0.002874 0.001437 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0858.1 MOTIF MA0859.1 Rarg letter-probability matrix: alength= 4 w= 16 nsites= 26801 E= 0 0.468191 0.061751 0.421216 0.048841 0.691174 0.014072 0.294275 0.000479 0.000235 0.000000 0.999765 0.000000 0.000000 0.000217 0.867445 0.132338 0.001971 0.003449 0.006306 0.988275 0.000235 0.990605 0.002975 0.006185 0.998081 0.000226 0.001693 0.000000 0.956200 0.005110 0.011889 0.026802 0.900081 0.001320 0.062754 0.035845 0.958580 0.000416 0.041003 0.000000 0.000075 0.000075 0.999623 0.000226 0.000000 0.000168 0.779510 0.220322 0.000608 0.004052 0.005167 0.990173 0.000000 0.985549 0.005629 0.008822 0.990578 0.000433 0.008880 0.000108 0.461783 0.202208 0.103278 0.232731 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0859.1 MOTIF MA0860.1 Rarg letter-probability matrix: alength= 4 w= 17 nsites= 4921 E= 0 0.827881 0.002032 0.163788 0.006300 0.943118 0.001453 0.055429 0.000000 0.000000 0.000679 0.998982 0.000339 0.000000 0.000000 0.965356 0.034644 0.000000 0.002539 0.002770 0.994691 0.000320 0.999680 0.000000 0.000000 0.996305 0.000739 0.002956 0.000000 0.266183 0.511171 0.073706 0.148940 0.061221 0.346656 0.476116 0.116007 0.681351 0.101112 0.117055 0.100482 0.549770 0.011616 0.427198 0.011416 0.805140 0.007151 0.187263 0.000447 0.000000 0.000000 0.999830 0.000170 0.000000 0.001491 0.939072 0.059437 0.003073 0.000439 0.000000 0.996488 0.001303 0.994228 0.000372 0.004096 0.997696 0.001047 0.001257 0.000000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0860.1 MOTIF MA1910.1 Rax letter-probability matrix: alength= 4 w= 20 nsites= 1000 E= 0 0.306000 0.183000 0.211000 0.300000 0.311688 0.186813 0.220779 0.280719 0.289710 0.196803 0.220779 0.292707 0.241241 0.215215 0.224224 0.319319 0.260739 0.210789 0.236763 0.291708 0.333000 0.203000 0.245000 0.219000 0.333000 0.190000 0.249000 0.228000 0.082082 0.095095 0.084084 0.738739 0.048000 0.050000 0.029000 0.873000 0.883000 0.028000 0.051000 0.038000 0.909910 0.020020 0.037037 0.033033 0.047047 0.037037 0.037037 0.878879 0.052000 0.056000 0.060000 0.832000 0.364364 0.153153 0.266266 0.216216 0.304304 0.200200 0.284284 0.211211 0.255000 0.221000 0.234000 0.290000 0.232767 0.207792 0.214785 0.344655 0.275000 0.202000 0.216000 0.307000 0.314685 0.190809 0.214785 0.279720 0.291708 0.190809 0.219780 0.297702 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1910.1 MOTIF MA1621.1 Rbpjl letter-probability matrix: alength= 4 w= 14 nsites= 9652 E= 0 0.207833 0.298487 0.256527 0.237153 0.255491 0.251450 0.264090 0.228968 0.349047 0.322938 0.186697 0.141318 0.622151 0.142250 0.154579 0.081019 0.014401 0.960734 0.010671 0.014194 0.972441 0.007252 0.011397 0.008910 0.008703 0.884065 0.069623 0.037609 0.024244 0.932967 0.032843 0.009946 0.006527 0.014919 0.013676 0.964878 0.010568 0.013572 0.963013 0.012847 0.058952 0.177994 0.163800 0.599254 0.159449 0.336407 0.278388 0.225756 0.235495 0.298798 0.202860 0.262847 0.215707 0.311127 0.236324 0.236842 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1621.1 MOTIF MA1911.1 Rel letter-probability matrix: alength= 4 w= 20 nsites= 1000 E= 0 0.242000 0.229000 0.266000 0.263000 0.247000 0.221000 0.275000 0.257000 0.247000 0.221000 0.269000 0.263000 0.226000 0.224000 0.272000 0.278000 0.219000 0.222000 0.270000 0.289000 0.161838 0.233766 0.320679 0.283716 0.071000 0.184000 0.556000 0.189000 0.008000 0.006000 0.977000 0.009000 0.114885 0.005994 0.844156 0.034965 0.832000 0.007000 0.118000 0.043000 0.859000 0.021000 0.022000 0.098000 0.185000 0.011000 0.015000 0.789000 0.014000 0.022000 0.008000 0.956000 0.092000 0.323000 0.038000 0.547000 0.068931 0.668332 0.045954 0.216783 0.102897 0.628372 0.138861 0.129870 0.219000 0.329000 0.280000 0.172000 0.248751 0.251748 0.248751 0.250749 0.250000 0.224000 0.256000 0.270000 0.238000 0.227000 0.260000 0.275000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1911.1