MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF MA0684.2 RUNX3 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 27377 E= 0 0.283742 0.222194 0.244183 0.249881 0.349125 0.182891 0.129561 0.338423 0.698981 0.097235 0.127845 0.075940 0.958578 0.011506 0.015743 0.014172 0.015597 0.960405 0.007232 0.016766 0.018081 0.957300 0.014063 0.010556 0.232202 0.015305 0.069803 0.682690 0.022318 0.950250 0.014246 0.013186 0.954122 0.015122 0.012346 0.018410 0.589436 0.112394 0.171531 0.126639 0.320634 0.218943 0.206085 0.254338 0.251269 0.252036 0.232750 0.263944 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0684.2 MOTIF MA1184.1 RVE1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 14 nsites= 600 E= 0 0.390000 0.195000 0.176667 0.238333 0.338333 0.245000 0.168333 0.248333 0.395000 0.206667 0.236667 0.161667 0.553333 0.070000 0.096667 0.280000 0.876667 0.000000 0.000000 0.123333 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.976667 0.008333 0.006667 0.008333 0.006667 0.000000 0.016667 0.976667 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.141667 0.070000 0.020000 0.768333 0.341667 0.171667 0.128333 0.358333 0.423333 0.216667 0.145000 0.215000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1184.1 MOTIF MA1187.1 RVE4 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 561 E= 0 0.937611 0.000000 0.042781 0.019608 0.000000 0.000000 0.994652 0.005348 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.001783 0.000000 0.998217 0.976827 0.001783 0.000000 0.021390 0.000000 0.001783 0.007130 0.991087 0.000000 0.001783 0.000000 0.998217 0.028520 0.000000 0.000000 0.971480 0.140820 0.044563 0.017825 0.796791 0.169340 0.178253 0.165775 0.486631 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1187.1 MOTIF MA1190.1 RVE5 letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 599 E= 0 0.889816 0.006678 0.060100 0.043406 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.919866 0.000000 0.000000 0.080134 0.000000 0.001669 0.000000 0.998331 0.001669 0.000000 0.000000 0.998331 0.045075 0.000000 0.000000 0.954925 0.193656 0.055092 0.043406 0.707846 0.163606 0.178631 0.138564 0.519199 0.255426 0.175292 0.200334 0.368948 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1190.1 MOTIF MA1183.1 RVE6 letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 596 E= 0 0.874161 0.003356 0.073826 0.048658 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.971477 0.001678 0.000000 0.026846 0.000000 0.003356 0.000000 0.996644 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.067114 0.000000 0.001678 0.931208 0.189597 0.060403 0.033557 0.716443 0.151007 0.182886 0.154362 0.511745 0.224832 0.152685 0.236577 0.385906 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1183.1 MOTIF MA1401.1 RVE7 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 597 E= 0 0.422111 0.155779 0.274707 0.147404 0.705193 0.015075 0.026801 0.252931 0.994975 0.000000 0.000000 0.005025 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.036851 0.077052 0.005025 0.881072 0.257956 0.167504 0.110553 0.463987 0.497487 0.170854 0.180905 0.150754 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1401.1 MOTIF MA1191.1 RVE7L letter-probability matrix: alength= 4 w= 15 nsites= 599 E= 0 0.282137 0.238731 0.158598 0.320534 0.390651 0.215359 0.155259 0.238731 0.345576 0.245409 0.155259 0.253756 0.377295 0.200334 0.245409 0.176962 0.557596 0.090150 0.085142 0.267112 0.901503 0.001669 0.008347 0.088481 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.994992 0.000000 0.005008 0.000000 0.000000 0.000000 0.005008 0.994992 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.180301 0.130217 0.025042 0.664441 0.332220 0.171953 0.131886 0.363940 0.479132 0.171953 0.151920 0.196995 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1191.1 MOTIF MA1182.1 RVE8 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 593 E= 0 0.826307 0.013491 0.064081 0.096121 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.994941 0.000000 0.000000 0.005059 0.000000 0.003373 0.000000 0.996627 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.084317 0.003373 0.000000 0.912310 0.193929 0.074199 0.059022 0.672850 0.222597 0.187184 0.155143 0.435076 0.281619 0.123103 0.224283 0.370995 0.244519 0.161889 0.207420 0.386172 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1182.1 MOTIF MA0074.1 RXRA::VDR letter-probability matrix: alength= 4 w= 15 nsites= 10 E= 0 0.300000 0.000000 0.700000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.900000 0.100000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.900000 0.000000 0.100000 0.900000 0.000000 0.100000 0.000000 0.400000 0.200000 0.000000 0.400000 0.200000 0.400000 0.200000 0.200000 0.200000 0.000000 0.800000 0.000000 0.500000 0.000000 0.500000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.100000 0.000000 0.000000 0.900000 0.000000 0.900000 0.000000 0.100000 0.700000 0.100000 0.200000 0.000000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0074.1 MOTIF MA0855.1 RXRB letter-probability matrix: alength= 4 w= 14 nsites= 5152 E= 0 0.277562 0.066382 0.612578 0.043478 0.306824 0.001480 0.691141 0.000555 0.003518 0.000251 0.993719 0.002513 0.000242 0.000000 0.880774 0.118984 0.000000 0.000445 0.002448 0.997107 0.004899 0.933925 0.014831 0.046345 0.997772 0.000000 0.002056 0.000171 0.974059 0.000837 0.019916 0.005188 0.962695 0.000168 0.037137 0.000000 0.000258 0.000000 0.997935 0.001806 0.000493 0.000000 0.922641 0.076866 0.000225 0.000449 0.004267 0.995060 0.002175 0.958939 0.013868 0.025017 0.947960 0.002148 0.049397 0.000496 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0855.1