MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF MA1814.1 RIN letter-probability matrix: alength= 4 w= 15 nsites= 4823 E= 0 0.261041 0.119428 0.141613 0.477918 0.268505 0.142857 0.149077 0.439560 0.141406 0.675513 0.051006 0.132075 0.048725 0.118806 0.017624 0.814846 0.814224 0.049554 0.018039 0.118184 0.051420 0.033796 0.020319 0.894464 0.097242 0.014514 0.011404 0.876840 0.042090 0.006842 0.010367 0.940701 0.074020 0.012026 0.020527 0.893427 0.059092 0.013477 0.029650 0.897781 0.068629 0.006635 0.885341 0.039395 0.054945 0.022807 0.813601 0.108646 0.225793 0.108853 0.420693 0.244661 0.390214 0.158615 0.138918 0.312254 0.403276 0.142857 0.140991 0.312876 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1814.1 MOTIF UN0409.1 RKD2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 19 nsites= 1000 E= 0 0.247019 0.209540 0.350937 0.192504 0.206133 0.286201 0.124361 0.383305 0.183986 0.001704 0.797274 0.017036 0.609880 0.134583 0.064736 0.190801 0.000000 0.994889 0.000000 0.005111 0.003407 0.194208 0.453152 0.349233 0.129472 0.264055 0.201022 0.405451 0.015332 0.017036 0.000000 0.967632 0.015332 0.051107 0.000000 0.933561 0.022147 0.763202 0.148211 0.066440 0.528109 0.068143 0.396934 0.006814 0.240204 0.110733 0.243612 0.405451 0.180579 0.686542 0.030664 0.102215 0.000000 0.000000 0.015332 0.984668 0.069847 0.165247 0.015332 0.749574 0.018739 0.952300 0.008518 0.020443 0.020443 0.725724 0.006814 0.247019 0.156729 0.369676 0.090290 0.383305 0.226576 0.357751 0.155026 0.260647 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/UN0409.1 MOTIF MA0369.1 RLM1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 18 nsites= 38 E= 0 0.263158 0.263158 0.263158 0.210526 0.333333 0.047619 0.380952 0.238095 0.261905 0.000000 0.023810 0.714286 0.000000 0.000000 0.119048 0.880952 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.380952 0.000000 0.000000 0.619048 0.523810 0.000000 0.000000 0.476190 0.547619 0.000000 0.000000 0.452381 0.761905 0.000000 0.000000 0.238095 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.642857 0.333333 0.000000 0.023810 0.097561 0.365854 0.048780 0.487805 0.166667 0.380952 0.071429 0.380952 0.250000 0.325000 0.250000 0.175000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0369.1 MOTIF MA0370.1 RME1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 183 E= 0 0.000000 0.284153 0.000000 0.715847 0.074766 0.448598 0.154206 0.322430 0.071749 0.448430 0.219731 0.260090 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.708333 0.000000 0.160714 0.130952 0.817647 0.170588 0.000000 0.011765 0.099631 0.000000 0.900369 0.000000 0.129278 0.000000 0.870722 0.000000 0.489362 0.207447 0.186170 0.117021 0.773006 0.000000 0.116564 0.110429 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0370.1 MOTIF UN0274.1 RO3G_06280 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 998 E= 0 0.230461 0.216433 0.212425 0.340681 0.134134 0.677678 0.040040 0.148148 0.009027 0.019057 0.966901 0.005015 0.003003 0.995996 0.000000 0.001001 0.001002 0.998998 0.000000 0.000000 0.790581 0.055110 0.084168 0.070140 0.006006 0.955956 0.007007 0.031031 0.223447 0.420842 0.090180 0.265531 0.247495 0.311623 0.230461 0.210421 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/UN0274.1 MOTIF MA0071.1 RORA letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 25 E= 0 0.600000 0.040000 0.080000 0.280000 0.360000 0.040000 0.000000 0.600000 0.240000 0.480000 0.160000 0.120000 0.440000 0.080000 0.200000 0.280000 0.840000 0.000000 0.160000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0071.1 MOTIF MA0072.1 RORA letter-probability matrix: alength= 4 w= 14 nsites= 36 E= 0 0.250000 0.222222 0.222222 0.305556 0.472222 0.055556 0.194444 0.277778 0.416667 0.000000 0.083333 0.500000 0.972222 0.027778 0.000000 0.000000 0.638889 0.000000 0.000000 0.361111 0.055556 0.333333 0.361111 0.250000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.777778 0.000000 0.222222 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.416667 0.166667 0.277778 0.138889 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0072.1 MOTIF MA1150.1 RORB letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 1000 E= 0 0.785000 0.014000 0.029000 0.172000 0.525475 0.025974 0.023976 0.424575 0.233233 0.162162 0.201201 0.403403 0.053000 0.165000 0.235000 0.547000 0.602000 0.014000 0.358000 0.026000 0.016000 0.025000 0.907000 0.052000 0.032000 0.013000 0.928000 0.027000 0.028000 0.146000 0.050000 0.776000 0.047000 0.781000 0.017000 0.155000 0.896000 0.015000 0.063000 0.026000 0.205000 0.326000 0.145000 0.324000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1150.1 MOTIF MA1151.1 RORC letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 1000 E= 0 0.306000 0.179000 0.260000 0.255000 0.329000 0.114000 0.141000 0.416000 0.855000 0.014000 0.011000 0.120000 0.527000 0.010000 0.032000 0.431000 0.225000 0.249000 0.277000 0.249000 0.043043 0.087087 0.116116 0.753754 0.622378 0.023976 0.342657 0.010989 0.005000 0.002000 0.919000 0.074000 0.036036 0.003003 0.952953 0.008008 0.059000 0.112000 0.168000 0.661000 0.006000 0.822000 0.019000 0.153000 0.785000 0.012000 0.161000 0.042000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1151.1 MOTIF MA0371.1 ROX1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 8 E= 0 0.000000 0.500000 0.000000 0.500000 0.000000 0.750000 0.000000 0.250000 0.250000 0.500000 0.000000 0.250000 0.875000 0.125000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.125000 0.875000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.625000 0.125000 0.250000 0.125000 0.000000 0.125000 0.750000 0.000000 0.625000 0.250000 0.125000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0371.1