MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF MA0362.1 RDS2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 7 nsites= 99 E= 0 0.343434 0.393939 0.181818 0.080808 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.120000 0.010000 0.860000 0.010000 0.168317 0.069307 0.693069 0.069307 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0362.1 MOTIF MA0363.1 REB1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 100 E= 0 0.300000 0.100000 0.500000 0.100000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.600000 0.400000 0.150000 0.150000 0.550000 0.150000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0363.1 MOTIF MA0363.2 REB1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 15 nsites= 691 E= 0 0.306802 0.164978 0.157742 0.370478 0.230101 0.241679 0.211288 0.316932 0.124457 0.256151 0.163531 0.455861 0.406657 0.114327 0.406657 0.072359 0.011577 0.028944 0.007236 0.952243 0.040521 0.040521 0.010130 0.908828 0.982634 0.001447 0.004342 0.011577 0.002894 0.989870 0.002894 0.004342 0.005789 0.985528 0.007236 0.001447 0.004342 0.985528 0.004342 0.005789 0.015919 0.007236 0.836469 0.140376 0.150507 0.192475 0.545586 0.111433 0.428365 0.353111 0.083936 0.134588 0.192475 0.257598 0.170767 0.379161 0.269175 0.166425 0.212735 0.351664 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0363.2 MOTIF MA1415.1 REF6 letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 3687 E= 0 0.537836 0.056686 0.310279 0.095199 0.714402 0.037158 0.156496 0.091945 0.937890 0.007323 0.006509 0.048278 0.952265 0.009222 0.032004 0.006509 0.000271 0.992948 0.000271 0.006509 0.982370 0.006781 0.008137 0.002712 0.001627 0.005696 0.983184 0.009493 0.958232 0.005696 0.028478 0.007594 0.012205 0.002712 0.971250 0.013832 0.203960 0.288310 0.239761 0.267969 0.609981 0.128289 0.119609 0.142121 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1415.1 MOTIF MA0364.1 REI1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 7 nsites= 100 E= 0 0.000000 0.950000 0.000000 0.050000 0.050000 0.950000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.950000 0.050000 0.560000 0.080000 0.230000 0.130000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0364.1 MOTIF MA0101.1 REL letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 17 E= 0 0.000000 0.294118 0.470588 0.235294 0.000000 0.058824 0.882353 0.058824 0.058824 0.000000 0.882353 0.058824 0.294118 0.058824 0.529412 0.117647 0.352941 0.294118 0.176471 0.176471 0.294118 0.058824 0.058824 0.588235 0.058824 0.000000 0.000000 0.941176 0.117647 0.000000 0.000000 0.882353 0.000000 0.882353 0.000000 0.117647 0.058824 0.941176 0.000000 0.000000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0101.1 MOTIF MA0107.1 RELA letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 18 E= 0 0.000000 0.222222 0.611111 0.166667 0.000000 0.000000 0.944444 0.055556 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.611111 0.000000 0.388889 0.000000 0.555556 0.166667 0.222222 0.055556 0.111111 0.000000 0.000000 0.888889 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.111111 0.000000 0.888889 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0107.1 MOTIF MA1117.1 RELB letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 3290 E= 0 0.241945 0.125836 0.478723 0.153495 0.374164 0.170517 0.241337 0.213982 0.861094 0.038602 0.047720 0.052584 0.063830 0.032523 0.048328 0.855319 0.027356 0.031307 0.016109 0.925228 0.043769 0.889970 0.012158 0.054103 0.027964 0.941641 0.008511 0.021884 0.044377 0.915805 0.017629 0.022188 0.024012 0.922492 0.032523 0.020973 0.241945 0.190881 0.299088 0.268085 0.216109 0.279939 0.302736 0.201216 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1117.1 MOTIF UN0407.1 REM1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 999 E= 0 0.329018 0.121170 0.121170 0.428641 0.000147 0.094667 0.801824 0.103362 0.409389 0.000147 0.190509 0.399955 0.000147 0.000147 0.000147 0.999560 0.000147 0.000147 0.999560 0.000147 0.000147 0.000147 0.000147 0.999560 0.999560 0.000147 0.000147 0.000147 0.000147 0.000147 0.999560 0.000147 0.417639 0.324408 0.128977 0.128977 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/UN0407.1 MOTIF UN0408.1 REM21 letter-probability matrix: alength= 4 w= 15 nsites= 1000 E= 0 0.306122 0.326531 0.102041 0.265306 0.210884 0.210884 0.142857 0.435374 0.217687 0.278912 0.163265 0.340136 0.224490 0.204082 0.190476 0.380952 0.170068 0.176871 0.258503 0.394558 0.224490 0.360544 0.122449 0.292517 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.993197 0.006803 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.380952 0.129252 0.176871 0.312925 0.197279 0.238095 0.149660 0.414966 0.190476 0.401361 0.163265 0.244898 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/UN0408.1