MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF MA1051.1 RAP2-3 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 1001 E= 0 0.118881 0.231768 0.542458 0.106893 0.147147 0.761762 0.033033 0.058058 0.007000 0.006000 0.982000 0.005000 0.006000 0.746000 0.244000 0.004000 0.016000 0.977000 0.004000 0.003000 0.006000 0.003000 0.976000 0.015000 0.109000 0.780000 0.026000 0.085000 0.257000 0.664000 0.006000 0.073000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1051.1 MOTIF MA1795.1 RAP2-4 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 999 E= 0 0.180753 0.553982 0.128655 0.136610 0.584085 0.000181 0.415735 0.000000 0.000969 0.933312 0.065283 0.000435 0.001168 0.968011 0.000091 0.030730 0.093485 0.006806 0.786662 0.113047 0.496772 0.241805 0.080490 0.180934 0.098723 0.822470 0.000369 0.078438 0.270589 0.550376 0.052489 0.126546 0.468198 0.141019 0.160596 0.230187 0.268544 0.245430 0.189239 0.296787 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1795.1 MOTIF MA1221.1 RAP2-6 letter-probability matrix: alength= 4 w= 15 nsites= 597 E= 0 0.172529 0.232831 0.030151 0.564489 0.107203 0.036851 0.546064 0.309883 0.313233 0.018425 0.638191 0.030151 0.001675 0.961474 0.000000 0.036851 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.001675 0.025126 0.973199 0.000000 0.013400 0.949749 0.000000 0.036851 0.000000 0.005025 0.969849 0.025126 0.025126 0.100503 0.855946 0.018425 0.329983 0.519263 0.023451 0.127303 0.112228 0.015075 0.760469 0.112228 0.244556 0.078727 0.591290 0.085427 0.335008 0.289782 0.082077 0.293132 0.190955 0.053601 0.564489 0.190955 0.179229 0.103853 0.579564 0.137353 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1221.1 MOTIF MA1796.1 RAP2-7 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 1000 E= 0 0.000831 0.000831 0.250000 0.748339 0.614264 0.154141 0.230828 0.000767 0.000712 0.784188 0.214387 0.000712 0.000712 0.000712 0.855413 0.143162 0.690951 0.000767 0.307515 0.000767 0.000767 0.000767 0.921012 0.077454 0.000767 0.000767 0.997699 0.000767 0.272645 0.000906 0.182065 0.544384 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1796.1 MOTIF MA1251.1 RAP2-9 letter-probability matrix: alength= 4 w= 19 nsites= 593 E= 0 0.242833 0.330523 0.158516 0.268128 0.293423 0.197302 0.210793 0.298482 0.242833 0.254637 0.178752 0.323777 0.244519 0.306914 0.156830 0.291737 0.310287 0.214165 0.231029 0.244519 0.247892 0.286678 0.168634 0.296796 0.291737 0.315346 0.138280 0.254637 0.332209 0.111298 0.247892 0.308600 0.074199 0.436762 0.145025 0.344013 0.010118 0.981450 0.005059 0.003373 0.927487 0.000000 0.070826 0.001686 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.954469 0.015177 0.000000 0.030354 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.667791 0.273187 0.023609 0.035413 0.468803 0.168634 0.010118 0.352445 0.286678 0.225970 0.121417 0.365936 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1251.1 MOTIF MA0729.1 RARA letter-probability matrix: alength= 4 w= 18 nsites= 768 E= 0 0.325521 0.001302 0.667969 0.005208 0.933702 0.001842 0.064457 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.001305 0.000000 0.973890 0.024804 0.000000 0.008850 0.001770 0.989381 0.002721 0.961905 0.035374 0.000000 0.992481 0.000000 0.007519 0.000000 0.734637 0.000000 0.039106 0.226257 0.929329 0.000000 0.005300 0.065371 0.983051 0.009416 0.007533 0.000000 0.000000 0.000000 0.998684 0.001316 0.000000 0.000000 0.881871 0.118129 0.005464 0.000000 0.000000 0.994536 0.000000 0.997171 0.000000 0.002829 0.998152 0.000000 0.001848 0.000000 0.685751 0.045802 0.038168 0.230280 0.003584 0.000000 0.408602 0.587814 0.000000 0.207957 0.408680 0.383363 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0729.1 MOTIF MA0730.1 RARA letter-probability matrix: alength= 4 w= 17 nsites= 1426 E= 0 0.763675 0.016830 0.219495 0.000000 0.000000 0.000000 0.998658 0.001342 0.000000 0.001312 0.952100 0.046588 0.005098 0.009346 0.014444 0.971113 0.004950 0.980198 0.004455 0.010396 0.979577 0.011268 0.007746 0.001408 0.220836 0.291269 0.061629 0.426266 0.146694 0.297521 0.402204 0.153581 0.099123 0.456507 0.105866 0.338503 0.641161 0.077836 0.130607 0.150396 0.731795 0.012257 0.250901 0.005047 0.797450 0.011331 0.190510 0.000708 0.001369 0.000000 0.995893 0.002738 0.000674 0.004720 0.971005 0.023601 0.006879 0.009458 0.011178 0.972485 0.002025 0.973671 0.013165 0.011139 0.975066 0.001969 0.016404 0.006562 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0730.1 MOTIF MA0159.1 RARA::RXRA letter-probability matrix: alength= 4 w= 17 nsites= 23 E= 0 0.521739 0.000000 0.478261 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.043478 0.000000 0.565217 0.391304 0.000000 0.000000 0.043478 0.956522 0.000000 0.782609 0.130435 0.086957 0.956522 0.000000 0.043478 0.000000 0.173913 0.304348 0.217391 0.304348 0.217391 0.347826 0.391304 0.043478 0.217391 0.173913 0.478261 0.130435 0.565217 0.043478 0.304348 0.086957 0.217391 0.260870 0.521739 0.000000 0.739130 0.130435 0.130435 0.000000 0.043478 0.043478 0.869565 0.043478 0.000000 0.043478 0.695652 0.260870 0.086957 0.043478 0.130435 0.739130 0.043478 0.739130 0.130435 0.086957 0.913043 0.000000 0.043478 0.043478 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0159.1 MOTIF MA1149.1 RARA::RXRG letter-probability matrix: alength= 4 w= 18 nsites= 1000 E= 0 0.345000 0.113000 0.413000 0.129000 0.496000 0.038000 0.460000 0.006000 0.013000 0.003000 0.954000 0.030000 0.011000 0.003000 0.828000 0.158000 0.005000 0.015000 0.071000 0.909000 0.018000 0.831000 0.058000 0.093000 0.874000 0.005000 0.111000 0.010000 0.272272 0.239239 0.154154 0.334334 0.215215 0.249249 0.320320 0.215215 0.211000 0.212000 0.272000 0.305000 0.343656 0.198801 0.230769 0.226773 0.348348 0.133133 0.397397 0.121121 0.495000 0.090000 0.390000 0.025000 0.026000 0.004000 0.927000 0.043000 0.011988 0.004995 0.814186 0.168831 0.060060 0.112112 0.226226 0.601602 0.072927 0.695305 0.096903 0.134865 0.701299 0.052947 0.205794 0.039960 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1149.1 MOTIF MA1552.1 RARB letter-probability matrix: alength= 4 w= 14 nsites= 472 E= 0 0.459746 0.063559 0.358051 0.118644 0.698259 0.087041 0.214700 0.000000 0.005736 0.032505 0.902486 0.059273 0.017794 0.007117 0.839858 0.135231 0.034483 0.105090 0.085386 0.775041 0.010000 0.944000 0.014000 0.032000 0.677895 0.000000 0.315789 0.006316 0.006250 0.010417 0.000000 0.983333 0.032000 0.016000 0.944000 0.008000 0.892250 0.049149 0.034026 0.024575 0.136937 0.850450 0.000000 0.012613 0.023622 0.929134 0.015748 0.031496 0.018975 0.191651 0.085389 0.703985 0.133475 0.271186 0.116525 0.478814 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1552.1