MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF MA1211.1 ATHB-X letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 595 E= 0 0.173109 0.321008 0.176471 0.329412 0.000000 0.626891 0.000000 0.373109 0.981513 0.018487 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.075630 0.517647 0.008403 0.398319 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.045378 0.013445 0.021849 0.919328 0.368067 0.025210 0.393277 0.213445 0.191597 0.122689 0.363025 0.322689 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1211.1 MOTIF MA1738.1 ATMYB31 letter-probability matrix: alength= 4 w= 15 nsites= 1000 E= 0 0.173986 0.505068 0.043919 0.277027 0.768581 0.113176 0.020270 0.097973 0.559121 0.285473 0.023649 0.131757 0.000000 0.753379 0.010135 0.236486 0.165541 0.244932 0.030405 0.559122 0.486486 0.302365 0.076014 0.135135 0.106419 0.807432 0.000000 0.086149 0.027027 0.765203 0.000000 0.207770 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.736487 0.258446 0.003378 0.001689 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.199324 0.373311 0.028716 0.398649 0.760135 0.045608 0.160473 0.033784 0.288851 0.527027 0.018581 0.165541 0.263514 0.439189 0.000000 0.297297 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1738.1 MOTIF MA1467.1 ATOH1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 2005 E= 0 0.682294 0.085287 0.232419 0.000000 0.736304 0.130752 0.132944 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.947368 0.000000 0.000000 0.052632 0.000000 0.000000 0.883150 0.116850 0.129771 0.870229 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.067982 0.216374 0.025585 0.690058 0.000000 0.688824 0.000000 0.311176 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1467.1 MOTIF MA1468.1 ATOH7 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 1013 E= 0 0.702863 0.095755 0.140178 0.061204 0.424157 0.296348 0.216292 0.063202 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.816514 0.000000 0.116972 0.066514 0.016816 0.118834 0.066143 0.798206 0.734021 0.185567 0.080412 0.000000 0.000000 0.032808 0.032808 0.934383 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.007022 0.217697 0.366573 0.408708 0.023256 0.547196 0.002736 0.426813 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1468.1 MOTIF UN0436.1 ATbp letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 5446 E= 0 0.358428 0.163974 0.238524 0.239075 0.312890 0.151120 0.191149 0.344840 0.043335 0.018729 0.930959 0.006978 0.018546 0.001285 0.024605 0.955564 0.883217 0.055270 0.026258 0.035255 0.820419 0.091260 0.027727 0.060595 0.905802 0.026625 0.023320 0.044253 0.003122 0.833456 0.024054 0.139368 0.869445 0.031583 0.039111 0.059860 0.271025 0.220345 0.220529 0.288101 0.362651 0.175358 0.198311 0.263680 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/UN0436.1 MOTIF MA0277.1 AZF1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 102 E= 0 0.617647 0.127451 0.127451 0.127451 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.871287 0.128713 0.000000 0.000000 0.750000 0.000000 0.250000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.780000 0.160000 0.030000 0.030000 0.818182 0.060606 0.060606 0.060606 0.617647 0.127451 0.127451 0.127451 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0277.1 MOTIF MA0165.1 Abd-B letter-probability matrix: alength= 4 w= 7 nsites= 21 E= 0 0.047619 0.000000 0.000000 0.952381 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.238095 0.000000 0.000000 0.761905 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.142857 0.000000 0.857143 0.142857 0.000000 0.523810 0.333333 0.619048 0.000000 0.238095 0.142857 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0165.1 MOTIF MA0006.1 Ahr::Arnt letter-probability matrix: alength= 4 w= 6 nsites= 24 E= 0 0.125000 0.333333 0.083333 0.458333 0.000000 0.000000 0.958333 0.041667 0.000000 0.958333 0.000000 0.041667 0.000000 0.000000 0.958333 0.041667 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0006.1 MOTIF MA0854.1 Alx1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 17 nsites= 100 E= 0 0.190000 0.440000 0.170000 0.200000 0.070000 0.210000 0.650000 0.070000 0.380000 0.330000 0.140000 0.150000 0.430000 0.090000 0.310000 0.170000 0.050000 0.400000 0.020000 0.530000 0.010000 0.070000 0.000000 0.920000 0.989899 0.000000 0.010101 0.000000 0.980000 0.000000 0.010000 0.010000 0.010000 0.010000 0.000000 0.980000 0.000000 0.010101 0.000000 0.989899 0.920000 0.000000 0.070000 0.010000 0.530000 0.020000 0.400000 0.050000 0.150000 0.210000 0.110000 0.530000 0.230000 0.320000 0.160000 0.290000 0.393939 0.313131 0.121212 0.171717 0.240000 0.290000 0.230000 0.240000 0.150000 0.400000 0.140000 0.310000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0854.1 MOTIF MA0853.1 Alx4 letter-probability matrix: alength= 4 w= 17 nsites= 101 E= 0 0.158416 0.584158 0.148515 0.108911 0.100000 0.240000 0.560000 0.100000 0.190000 0.440000 0.160000 0.210000 0.400000 0.150000 0.290000 0.160000 0.020202 0.343434 0.010101 0.626263 0.009901 0.079208 0.000000 0.910891 0.980198 0.009901 0.009901 0.000000 0.980000 0.000000 0.010000 0.010000 0.010000 0.010000 0.000000 0.980000 0.000000 0.009901 0.009901 0.980198 0.910891 0.000000 0.079208 0.009901 0.626263 0.010101 0.343434 0.020202 0.170000 0.230000 0.180000 0.420000 0.290000 0.280000 0.130000 0.300000 0.360000 0.230000 0.190000 0.220000 0.230000 0.290000 0.250000 0.230000 0.120000 0.430000 0.210000 0.240000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0853.1