MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF UN0303.1 Phyra42912 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 998 E= 0 0.248497 0.105210 0.547094 0.099198 0.195391 0.717435 0.008016 0.079158 0.087174 0.337675 0.498998 0.076152 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.994995 0.000000 0.001001 0.004004 0.004008 0.002004 0.003006 0.990982 0.004008 0.981964 0.003006 0.011022 0.228686 0.400201 0.121364 0.249749 0.115230 0.452906 0.116232 0.315631 0.223447 0.305611 0.165331 0.305611 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/UN0303.1 MOTIF UN0304.1 Phyra84400 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 998 E= 0 0.145291 0.528056 0.107214 0.219439 0.172345 0.109218 0.653307 0.065130 0.179539 0.557673 0.038114 0.224674 0.041082 0.924850 0.013026 0.021042 0.127127 0.027027 0.510511 0.335335 0.049147 0.232698 0.059178 0.658977 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.020060 0.002006 0.901705 0.076229 0.039078 0.053106 0.835671 0.072144 0.683367 0.189379 0.076152 0.051102 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/UN0304.1 MOTIF MA0682.1 Pitx1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 3115 E= 0 0.192616 0.270305 0.108507 0.428571 0.049076 0.006968 0.000000 0.943956 0.882720 0.043909 0.059490 0.013881 0.994574 0.000000 0.000000 0.005426 0.018858 0.015894 0.125808 0.839440 0.061411 0.861964 0.011618 0.065007 0.040695 0.773201 0.034243 0.151861 0.228177 0.409178 0.137997 0.224647 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0682.1 MOTIF UN0465.1 Pknox letter-probability matrix: alength= 4 w= 20 nsites= 1000 E= 0 0.275000 0.239000 0.261000 0.225000 0.276000 0.235000 0.281000 0.208000 0.281718 0.253746 0.246753 0.217782 0.262262 0.268268 0.232232 0.237237 0.293000 0.223000 0.278000 0.206000 0.268000 0.221000 0.257000 0.254000 0.227227 0.256256 0.245245 0.271271 0.047000 0.037000 0.035000 0.881000 0.008000 0.016000 0.969000 0.007000 0.827828 0.015015 0.034034 0.123123 0.008000 0.974000 0.004000 0.014000 0.916084 0.005994 0.043956 0.033966 0.083916 0.121878 0.676324 0.117882 0.231000 0.294000 0.267000 0.208000 0.154000 0.281000 0.176000 0.389000 0.227227 0.180180 0.344344 0.248248 0.183000 0.230000 0.254000 0.333000 0.209000 0.349000 0.211000 0.231000 0.279720 0.275724 0.210789 0.233766 0.272727 0.253746 0.247752 0.225774 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/UN0465.1 MOTIF MA1615.1 Plagl1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 13 nsites= 14153 E= 0 0.196425 0.319014 0.300996 0.183565 0.204056 0.310959 0.284745 0.200240 0.151063 0.516428 0.213806 0.118703 0.135590 0.103936 0.094538 0.665937 0.013919 0.017170 0.960574 0.008337 0.085706 0.025154 0.866318 0.022822 0.013213 0.018795 0.955063 0.012930 0.012718 0.023741 0.953508 0.010033 0.055253 0.899951 0.022115 0.022681 0.012789 0.929273 0.029817 0.028121 0.852399 0.048470 0.072917 0.026214 0.147884 0.326291 0.342825 0.183000 0.241221 0.255352 0.322688 0.180739 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1615.1 MOTIF MA0627.1 Pou2f3 letter-probability matrix: alength= 4 w= 16 nsites= 100 E= 0 0.160000 0.200000 0.200000 0.440000 0.240000 0.220000 0.150000 0.390000 0.190000 0.130000 0.400000 0.280000 0.090000 0.120000 0.040000 0.750000 0.990000 0.000000 0.000000 0.010000 0.000000 0.010101 0.000000 0.989899 0.000000 0.000000 0.940000 0.060000 0.000000 0.919192 0.000000 0.080808 0.740000 0.000000 0.000000 0.260000 0.910000 0.000000 0.010000 0.080000 0.990000 0.000000 0.000000 0.010000 0.020000 0.000000 0.020000 0.960000 0.150000 0.160000 0.290000 0.400000 0.460000 0.240000 0.110000 0.190000 0.292929 0.161616 0.353535 0.191919 0.414141 0.242424 0.181818 0.161616 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0627.1 MOTIF UN0466.1 Pou4 letter-probability matrix: alength= 4 w= 20 nsites= 1000 E= 0 0.304000 0.248000 0.207000 0.241000 0.238000 0.219000 0.193000 0.350000 0.293000 0.242000 0.214000 0.251000 0.373626 0.226773 0.182817 0.216783 0.271000 0.209000 0.157000 0.363000 0.248248 0.181181 0.189189 0.381381 0.345000 0.285000 0.114000 0.256000 0.878122 0.037962 0.030969 0.052947 0.031000 0.016000 0.009000 0.944000 0.685686 0.053053 0.093093 0.168168 0.881000 0.054000 0.020000 0.045000 0.843157 0.019980 0.022977 0.113886 0.045000 0.026000 0.016000 0.913000 0.386613 0.145854 0.183816 0.283716 0.498501 0.152847 0.113886 0.234765 0.260739 0.158841 0.163836 0.416583 0.242757 0.182817 0.204795 0.369630 0.307000 0.251000 0.191000 0.251000 0.467000 0.181000 0.169000 0.183000 0.237000 0.220000 0.217000 0.326000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/UN0466.1 MOTIF MA0142.1 Pou5f1::Sox2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 15 nsites= 1364 E= 0 0.046188 0.620235 0.048387 0.285191 0.423865 0.042460 0.020498 0.513177 0.008047 0.036576 0.026335 0.929042 0.034332 0.008766 0.057706 0.899196 0.086194 0.265157 0.602630 0.046019 0.303141 0.013148 0.021183 0.662527 0.150475 0.266618 0.135866 0.447042 0.902118 0.021914 0.017531 0.058437 0.012418 0.003652 0.010957 0.972973 0.007305 0.011687 0.905040 0.075968 0.010234 0.752193 0.094298 0.143275 0.769231 0.011722 0.021978 0.197070 0.651248 0.049927 0.231278 0.067548 0.881705 0.024247 0.055107 0.038942 0.145481 0.087436 0.152094 0.614989 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0142.1 MOTIF MA0065.2 Pparg::Rxra letter-probability matrix: alength= 4 w= 15 nsites= 857 E= 0 0.109685 0.369895 0.373396 0.147025 0.117716 0.193473 0.148019 0.540793 0.453488 0.026744 0.427907 0.091860 0.116144 0.003484 0.779326 0.101045 0.161253 0.017401 0.781903 0.039443 0.168213 0.149652 0.458237 0.223898 0.082271 0.633835 0.207416 0.076477 0.949015 0.024334 0.017381 0.009270 0.604867 0.055620 0.312862 0.026651 0.825231 0.005787 0.158565 0.010417 0.095017 0.002317 0.888760 0.013905 0.047509 0.010429 0.803013 0.139050 0.025492 0.114716 0.304751 0.555041 0.062645 0.643852 0.167053 0.126450 0.784223 0.067285 0.054524 0.093968 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0065.2 MOTIF MA0200.1 Pph13 letter-probability matrix: alength= 4 w= 7 nsites= 21 E= 0 0.285714 0.380952 0.142857 0.190476 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.047619 0.000000 0.952381 0.619048 0.047619 0.285714 0.047619 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0200.1