MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF MA0508.1 PRDM1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 15 nsites= 4603 E= 0 0.386487 0.102325 0.225288 0.285900 0.358245 0.064740 0.506409 0.070606 0.683902 0.074951 0.149468 0.091679 0.757332 0.095373 0.096024 0.051271 0.906583 0.000000 0.093417 0.000000 0.091679 0.000000 0.877254 0.031067 0.158158 0.023897 0.202042 0.615903 0.045840 0.000000 0.954160 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.903976 0.000000 0.093417 0.002607 0.976972 0.000000 0.008473 0.014556 0.034543 0.030849 0.909407 0.025201 0.025418 0.099500 0.112970 0.762112 0.229633 0.108190 0.486422 0.175755 0.443624 0.169020 0.211384 0.175972 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0508.1 MOTIF MA0508.2 PRDM1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 3785 E= 0 0.181242 0.151387 0.146631 0.520740 0.174901 0.561427 0.081902 0.181770 0.996301 0.000528 0.002906 0.000264 0.000793 0.997622 0.000264 0.001321 0.001849 0.000528 0.006605 0.991017 0.003699 0.000528 0.001585 0.994188 0.006077 0.001321 0.000528 0.992074 0.001585 0.997886 0.000528 0.000000 0.464993 0.184148 0.045443 0.305416 0.127081 0.641480 0.074505 0.156935 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0508.2 MOTIF MA0508.3 PRDM1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 55481 E= 0 0.157928 0.320614 0.119645 0.401813 0.309169 0.221481 0.158036 0.311314 0.021611 0.950812 0.012635 0.014942 0.023125 0.008417 0.014888 0.953570 0.039311 0.024261 0.018222 0.918206 0.032678 0.008796 0.010112 0.948415 0.024819 0.963663 0.003731 0.007786 0.063968 0.019394 0.025054 0.891585 0.030821 0.952056 0.005227 0.011896 0.189651 0.244534 0.073863 0.491952 0.182477 0.315748 0.141688 0.360087 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0508.3 MOTIF MA1647.1 PRDM4 letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 7255 E= 0 0.272915 0.160303 0.351895 0.214886 0.281323 0.139490 0.286561 0.292626 0.038732 0.896485 0.043556 0.021227 0.118539 0.039421 0.078015 0.764025 0.040386 0.015162 0.939076 0.005376 0.020262 0.018884 0.011303 0.949552 0.023294 0.055824 0.054170 0.866713 0.026878 0.019021 0.015300 0.938801 0.066299 0.875672 0.017781 0.040248 0.290972 0.200689 0.100069 0.408270 0.355617 0.211165 0.185252 0.247967 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1647.1 MOTIF MA1723.1 PRDM9 letter-probability matrix: alength= 4 w= 24 nsites= 999 E= 0 0.335526 0.037281 0.458333 0.168860 0.151316 0.028509 0.712719 0.107456 0.247807 0.010965 0.335526 0.405702 0.037281 0.002193 0.905702 0.054825 0.054825 0.002193 0.940789 0.002193 0.133772 0.168860 0.484649 0.212719 0.300439 0.379386 0.212719 0.107456 0.774123 0.010965 0.203947 0.010965 0.160088 0.203947 0.528509 0.107456 0.125000 0.010965 0.853070 0.010965 0.028509 0.002193 0.932018 0.037281 0.449561 0.089912 0.344298 0.116228 0.002193 0.002193 0.993421 0.002193 0.019737 0.002193 0.975877 0.002193 0.353070 0.291667 0.203947 0.151316 0.396930 0.177632 0.274123 0.151316 0.370614 0.002193 0.440789 0.186404 0.265351 0.423246 0.107456 0.203947 0.782895 0.002193 0.168860 0.046053 0.317982 0.081140 0.572368 0.028509 0.335526 0.300439 0.256579 0.107456 0.598684 0.116228 0.230263 0.054825 0.353070 0.160088 0.405702 0.081140 0.256579 0.125000 0.475877 0.142544 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1723.1 MOTIF MA0715.1 PROP1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 660 E= 0 0.095455 0.018182 0.015152 0.871212 0.981229 0.000000 0.000000 0.018771 0.996534 0.000000 0.003466 0.000000 0.060921 0.057949 0.026746 0.854383 0.044872 0.334936 0.032051 0.588141 0.317708 0.098958 0.135417 0.447917 0.890093 0.058824 0.000000 0.051084 0.912698 0.004762 0.073016 0.009524 0.003466 0.000000 0.000000 0.996534 0.021242 0.029412 0.009804 0.939542 0.902669 0.000000 0.023548 0.073783 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0715.1 MOTIF MA0794.1 PROX1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 3367 E= 0 0.051678 0.446391 0.161271 0.340659 0.955448 0.004824 0.026674 0.013053 0.828494 0.056348 0.011811 0.103346 0.018362 0.000000 0.981347 0.000291 0.969200 0.006045 0.024180 0.000576 0.009027 0.980489 0.000000 0.010483 0.004073 0.000543 0.914200 0.081184 0.003249 0.499705 0.002363 0.494684 0.000882 0.990294 0.003529 0.005294 0.001142 0.000857 0.036551 0.961451 0.004730 0.047579 0.010851 0.936839 0.633502 0.164241 0.180279 0.021978 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0794.1 MOTIF MA0716.1 PRRX1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 23898 E= 0 0.172901 0.379237 0.181563 0.266298 0.086634 0.406046 0.040926 0.466394 0.866744 0.039462 0.064416 0.029379 0.963162 0.020273 0.008142 0.008424 0.000000 0.000126 0.000000 0.999874 0.044402 0.080866 0.035269 0.839463 0.922450 0.024859 0.005250 0.047441 0.397439 0.178634 0.266382 0.157545 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0716.1 MOTIF MA0075.3 PRRX2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 11044 E= 0 0.070445 0.608475 0.146052 0.175027 0.017499 0.288009 0.018789 0.675703 0.995261 0.004295 0.000444 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.943820 0.000140 0.056039 0.000000 0.340973 0.189165 0.277125 0.192737 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0075.3 MOTIF MA0358.1 PUT3 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 99 E= 0 0.090909 0.727273 0.090909 0.090909 0.020000 0.900000 0.020000 0.060000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.514851 0.148515 0.188119 0.148515 0.455446 0.128713 0.168317 0.247525 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0358.1