MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF MA0791.1 POU4F3 letter-probability matrix: alength= 4 w= 16 nsites= 3926 E= 0 0.423586 0.161742 0.220835 0.193836 0.057822 0.063564 0.060000 0.818614 0.147559 0.051722 0.653160 0.147559 0.469937 0.506667 0.006038 0.017358 0.939551 0.012090 0.010363 0.037997 0.023155 0.005065 0.006030 0.965750 0.623283 0.025825 0.027260 0.323632 0.774370 0.030167 0.031414 0.164049 0.096115 0.022420 0.036848 0.844617 0.107231 0.014775 0.043430 0.834565 0.573225 0.120377 0.145895 0.160503 0.981213 0.005408 0.007116 0.006262 0.046892 0.078522 0.039814 0.834771 0.131353 0.111415 0.528799 0.228434 0.485646 0.216653 0.142109 0.155591 0.238963 0.195281 0.403878 0.161878 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0791.1 MOTIF MA1115.1 POU5F1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 13114 E= 0 0.379899 0.098368 0.152204 0.369529 0.274745 0.212368 0.145493 0.367394 0.967897 0.009303 0.017462 0.005338 0.006329 0.009913 0.005109 0.978649 0.054674 0.014641 0.882339 0.048345 0.040644 0.786183 0.041787 0.131386 0.896447 0.010066 0.008998 0.084490 0.805246 0.052616 0.078237 0.063901 0.936404 0.020589 0.019597 0.023410 0.194906 0.160439 0.157923 0.486732 0.265060 0.186823 0.270779 0.277337 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1115.1 MOTIF MA0792.1 POU5F1B letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 13431 E= 0 0.098727 0.132380 0.060159 0.708734 0.982252 0.002167 0.006914 0.008668 0.016667 0.035478 0.020078 0.927778 0.027463 0.008017 0.811855 0.152665 0.026466 0.632996 0.085982 0.254555 0.653762 0.005293 0.006746 0.334198 0.833903 0.012615 0.074989 0.078493 0.963072 0.006576 0.009814 0.020538 0.126082 0.043429 0.060655 0.769834 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0792.1 MOTIF MA0628.1 POU6F1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 1000 E= 0 0.507000 0.193000 0.211000 0.089000 0.151000 0.351000 0.145000 0.353000 0.032000 0.010000 0.008000 0.950000 0.904096 0.069930 0.007992 0.017982 0.938000 0.034000 0.014000 0.014000 0.014000 0.014000 0.034000 0.938000 0.017982 0.007992 0.069930 0.904096 0.950000 0.008000 0.010000 0.032000 0.353000 0.145000 0.351000 0.151000 0.089000 0.211000 0.193000 0.507000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0628.1 MOTIF MA1549.1 POU6F1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 6414 E= 0 0.429685 0.064858 0.300904 0.204553 0.023907 0.039796 0.001458 0.934840 0.936615 0.026143 0.037243 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.044405 0.955595 0.010019 0.030806 0.867205 0.091969 0.926734 0.013873 0.000000 0.059393 0.033287 0.090215 0.679847 0.196650 0.200264 0.311262 0.340002 0.148472 0.245907 0.193045 0.239202 0.321846 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1549.1 MOTIF MA0793.1 POU6F2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 3297 E= 0 0.560510 0.097361 0.176524 0.165605 0.166939 0.276128 0.494739 0.062193 0.059571 0.821785 0.054586 0.064058 0.021127 0.018028 0.032113 0.928732 0.347725 0.614061 0.014586 0.023629 0.971706 0.022104 0.000000 0.006189 0.000000 0.001212 0.000000 0.998788 0.000000 0.003582 0.012239 0.984179 0.969991 0.007944 0.006472 0.015593 0.384592 0.165605 0.062178 0.387625 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0793.1 MOTIF MA1148.1 PPARA::RXRA letter-probability matrix: alength= 4 w= 18 nsites= 1000 E= 0 0.548000 0.140000 0.108000 0.204000 0.430569 0.072927 0.059940 0.436563 0.247000 0.211000 0.332000 0.210000 0.060939 0.093906 0.237762 0.607393 0.492492 0.095095 0.370370 0.042042 0.067932 0.018981 0.842158 0.070929 0.080000 0.015000 0.856000 0.049000 0.042000 0.157000 0.245000 0.556000 0.131000 0.445000 0.201000 0.223000 0.887000 0.016000 0.067000 0.030000 0.669000 0.024000 0.208000 0.099000 0.807000 0.025000 0.143000 0.025000 0.111000 0.016000 0.862000 0.011000 0.018000 0.014000 0.784000 0.184000 0.017017 0.049049 0.115115 0.818819 0.090000 0.598000 0.146000 0.166000 0.689690 0.037037 0.230230 0.043043 0.222000 0.237000 0.243000 0.298000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1148.1 MOTIF MA1550.1 PPARD letter-probability matrix: alength= 4 w= 16 nsites= 13180 E= 0 0.363961 0.219196 0.180425 0.236419 0.310892 0.091181 0.529976 0.067951 0.478524 0.005672 0.514822 0.000983 0.007608 0.001507 0.984331 0.006554 0.008798 0.000698 0.843039 0.147465 0.001565 0.002086 0.030922 0.965427 0.003164 0.802545 0.064030 0.130261 0.988609 0.000000 0.011391 0.000000 0.905981 0.002459 0.062631 0.028929 0.921051 0.000508 0.078441 0.000000 0.002646 0.000907 0.993045 0.003402 0.002055 0.000071 0.868046 0.129828 0.000000 0.002918 0.030376 0.966707 0.008048 0.834150 0.045836 0.111966 0.876648 0.002779 0.116939 0.003634 0.288771 0.286722 0.153794 0.270713 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1550.1 MOTIF MA0066.1 PPARG letter-probability matrix: alength= 4 w= 20 nsites= 28 E= 0 0.107143 0.285714 0.500000 0.107143 0.107143 0.000000 0.000000 0.892857 0.678571 0.000000 0.321429 0.000000 0.000000 0.035714 0.964286 0.000000 0.035714 0.000000 0.928571 0.035714 0.000000 0.035714 0.142857 0.821429 0.071429 0.821429 0.107143 0.000000 0.928571 0.035714 0.000000 0.035714 0.178571 0.535714 0.142857 0.142857 0.178571 0.250000 0.357143 0.214286 0.142857 0.071429 0.642857 0.142857 0.035714 0.000000 0.071429 0.892857 0.071429 0.178571 0.714286 0.035714 0.785714 0.178571 0.000000 0.035714 0.035714 0.964286 0.000000 0.000000 0.000000 0.892857 0.000000 0.107143 0.107143 0.428571 0.000000 0.464286 0.785714 0.178571 0.000000 0.035714 0.178571 0.428571 0.214286 0.178571 0.250000 0.000000 0.035714 0.714286 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0066.1 MOTIF MA0065.1 PPARG::RXRA letter-probability matrix: alength= 4 w= 20 nsites= 41 E= 0 0.243902 0.292683 0.170732 0.292683 0.170732 0.317073 0.195122 0.317073 0.463415 0.097561 0.146341 0.292683 0.317073 0.024390 0.658537 0.000000 0.414634 0.000000 0.585366 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.951220 0.048780 0.000000 0.048780 0.000000 0.951220 0.048780 0.902439 0.048780 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.951220 0.000000 0.048780 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.951220 0.048780 0.000000 0.048780 0.000000 0.951220 0.048780 0.878049 0.024390 0.048780 0.926829 0.024390 0.048780 0.000000 0.243902 0.292683 0.097561 0.365854 0.317073 0.365854 0.219512 0.097561 0.170732 0.243902 0.292683 0.292683 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0065.1