MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF MA1010.1 PHYPADRAFT_64121 letter-probability matrix: alength= 4 w= 13 nsites= 1000 E= 0 0.264000 0.273000 0.180000 0.283000 0.041000 0.041000 0.041000 0.877000 0.020000 0.020000 0.853000 0.107000 0.107000 0.020000 0.125000 0.748000 0.019980 0.940060 0.019980 0.019980 0.000000 0.087087 0.912913 0.000000 0.087087 0.000000 0.912913 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.608000 0.070000 0.158000 0.164000 0.288000 0.209000 0.209000 0.294000 0.309309 0.230230 0.230230 0.230230 0.309309 0.230230 0.230230 0.230230 0.309309 0.230230 0.230230 0.230230 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1010.1 MOTIF MA1011.1 PHYPADRAFT_72483 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 1000 E= 0 0.264000 0.238000 0.308000 0.190000 0.210000 0.181000 0.272000 0.337000 0.069069 0.849850 0.017017 0.064064 0.806807 0.000000 0.106106 0.087087 0.054945 0.799201 0.000000 0.145854 0.145854 0.000000 0.799201 0.054945 0.087087 0.106106 0.000000 0.806807 0.064064 0.017017 0.849850 0.069069 0.337000 0.272000 0.181000 0.210000 0.190000 0.308000 0.238000 0.264000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1011.1 MOTIF MA0559.1 PI letter-probability matrix: alength= 4 w= 14 nsites= 558 E= 0 0.279570 0.600358 0.086022 0.034050 0.102151 0.706093 0.078853 0.112903 0.639785 0.141577 0.120072 0.098566 0.802867 0.021505 0.148746 0.026882 0.987455 0.001792 0.007168 0.003584 0.892473 0.000000 0.021505 0.086022 0.539427 0.014337 0.437276 0.008961 0.559140 0.025090 0.123656 0.292115 0.413978 0.000000 0.586022 0.000000 0.012545 0.010753 0.976703 0.000000 0.799283 0.096774 0.012545 0.091398 0.887097 0.012545 0.043011 0.057348 0.817204 0.046595 0.107527 0.028674 0.458781 0.103943 0.356631 0.080645 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0559.1 MOTIF MA0552.1 PIF1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 14 nsites= 114 E= 0 0.324561 0.105263 0.324561 0.245614 0.219298 0.000000 0.464912 0.315789 0.307018 0.245614 0.254386 0.192982 0.464912 0.070175 0.350877 0.114035 0.236842 0.236842 0.280702 0.245614 0.078947 0.149123 0.640351 0.131579 0.333333 0.122807 0.122807 0.421053 0.000000 0.903509 0.096491 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.991228 0.008772 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.017544 0.000000 0.982456 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.192982 0.201754 0.447368 0.157895 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0552.1 MOTIF MA0560.1 PIF3 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 527 E= 0 0.398482 0.049336 0.280835 0.271347 0.110057 0.248577 0.421252 0.220114 0.036053 0.757116 0.178368 0.028463 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.776091 0.000000 0.223909 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.491461 0.062619 0.259962 0.185958 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0560.1 MOTIF MA0561.1 PIF4 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 335 E= 0 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.146269 0.000000 0.853731 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.295522 0.546269 0.158209 0.191045 0.614925 0.194030 0.000000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0561.1 MOTIF MA0562.1 PIF5 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 286 E= 0 0.000000 0.272727 0.000000 0.727273 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.318182 0.000000 0.681818 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.332168 0.562937 0.104895 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0562.1 MOTIF MA0682.2 PITX1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 15811 E= 0 0.183290 0.385744 0.150655 0.280311 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.089801 0.910199 0.013222 0.973740 0.000000 0.013037 0.006028 0.933599 0.011879 0.048493 0.222961 0.398253 0.178141 0.200646 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0682.2 MOTIF UN0575.1 PITX1::HES7 letter-probability matrix: alength= 4 w= 15 nsites= 155 E= 0 0.561290 0.122581 0.316129 0.000000 0.037975 0.962025 0.000000 0.000000 0.582375 0.007663 0.141762 0.268199 0.024691 0.938272 0.000000 0.037037 0.054545 0.024242 0.921212 0.000000 0.014286 0.090476 0.171429 0.723810 0.000000 0.063953 0.883721 0.052326 0.143791 0.117647 0.444444 0.294118 0.228758 0.281046 0.405229 0.084967 0.078704 0.046296 0.703704 0.171296 0.059880 0.000000 0.910180 0.029940 0.910180 0.000000 0.000000 0.089820 0.082840 0.017751 0.000000 0.899408 0.068966 0.017241 0.040230 0.873563 0.974359 0.000000 0.000000 0.025641 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/UN0575.1 MOTIF UN0576.1 PITX1::TBX21 letter-probability matrix: alength= 4 w= 16 nsites= 448 E= 0 0.761161 0.008929 0.200893 0.029018 0.123711 0.030928 0.705155 0.140206 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.011673 0.142023 0.068093 0.778210 0.009569 0.000000 0.971292 0.019139 0.170370 0.313580 0.032099 0.483951 0.064583 0.079167 0.712500 0.143750 0.879819 0.000000 0.113379 0.006803 0.731755 0.025641 0.165680 0.076923 0.412993 0.062645 0.491879 0.032483 0.123318 0.004484 0.858744 0.013453 0.047393 0.000000 0.950237 0.002370 0.931765 0.000000 0.054118 0.014118 0.016667 0.000000 0.040476 0.942857 0.056338 0.009390 0.000000 0.934272 0.953162 0.000000 0.018735 0.028103 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/UN0576.1