MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF MA0713.1 PHOX2A letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 15335 E= 0 0.141115 0.080861 0.032410 0.745615 0.805268 0.015846 0.108388 0.070498 0.996601 0.000000 0.002963 0.000436 0.076307 0.247857 0.035240 0.640596 0.044458 0.369025 0.160022 0.426494 0.093461 0.339184 0.059690 0.507665 0.789423 0.049503 0.130903 0.030171 0.946994 0.016482 0.025592 0.010933 0.000000 0.000874 0.000175 0.998952 0.084525 0.057939 0.006032 0.851504 0.808857 0.016200 0.057725 0.117218 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0713.1 MOTIF MA0681.2 PHOX2B letter-probability matrix: alength= 4 w= 16 nsites= 53236 E= 0 0.348073 0.137144 0.153505 0.361278 0.365223 0.132166 0.126681 0.375930 0.194305 0.051619 0.047750 0.706327 0.802014 0.036348 0.042997 0.118642 0.962488 0.009317 0.009542 0.018653 0.032722 0.011552 0.008772 0.946953 0.046040 0.687862 0.035183 0.230915 0.809114 0.035596 0.011045 0.144244 0.911977 0.027294 0.026636 0.034093 0.951893 0.008472 0.014295 0.025340 0.017300 0.006180 0.006988 0.969532 0.077072 0.036122 0.023142 0.863664 0.805263 0.036366 0.040480 0.117890 0.302202 0.092212 0.104610 0.500977 0.382561 0.155534 0.143324 0.318581 0.348730 0.139173 0.131471 0.380626 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0681.2 MOTIF MA0987.1 PHYPADRAFT_140773 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 1000 E= 0 0.243000 0.266000 0.253000 0.238000 0.302302 0.215215 0.260260 0.222222 0.395604 0.110889 0.172827 0.320679 0.887113 0.042957 0.009990 0.059940 0.892000 0.046000 0.001000 0.061000 0.715000 0.205000 0.028000 0.052000 0.072000 0.022000 0.839000 0.067000 0.182000 0.258000 0.229000 0.331000 0.271000 0.193000 0.271000 0.265000 0.280280 0.218218 0.272272 0.229229 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0987.1 MOTIF MA0988.1 PHYPADRAFT_143875 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 1000 E= 0 0.250000 0.272000 0.222000 0.256000 0.208000 0.231000 0.392000 0.169000 0.106000 0.844000 0.012000 0.038000 0.923924 0.000000 0.010010 0.066066 0.021978 0.939061 0.000000 0.038961 0.038961 0.000000 0.939061 0.021978 0.066066 0.010010 0.000000 0.923924 0.038000 0.012000 0.844000 0.106000 0.169000 0.392000 0.231000 0.208000 0.256000 0.222000 0.272000 0.250000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0988.1 MOTIF MA0989.1 PHYPADRAFT_153324 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 1000 E= 0 0.253000 0.264000 0.261000 0.222000 0.334000 0.193000 0.255000 0.218000 0.481518 0.070929 0.117882 0.329670 0.860140 0.061938 0.012987 0.064935 0.926000 0.036000 0.000000 0.038000 0.672000 0.147000 0.052000 0.129000 0.070929 0.026973 0.897103 0.004995 0.139000 0.288000 0.195000 0.378000 0.285000 0.158000 0.297000 0.260000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0989.1 MOTIF MA1007.1 PHYPADRAFT_173530 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 1001 E= 0 0.071928 0.000999 0.285714 0.641359 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.050050 0.000000 0.000000 0.949950 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.150150 0.000000 0.849850 0.084000 0.001000 0.665000 0.250000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1007.1 MOTIF MA1008.1 PHYPADRAFT_182268 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 1000 E= 0 0.292000 0.180000 0.180000 0.348000 0.144000 0.079000 0.288000 0.489000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.076000 0.000000 0.924000 0.070070 0.070070 0.789790 0.070070 0.292000 0.246000 0.291000 0.171000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1008.1 MOTIF MA1023.1 PHYPADRAFT_28324 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 1001 E= 0 0.071928 0.071928 0.285714 0.570430 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.217217 0.000000 0.782783 0.117882 0.000999 0.704296 0.176823 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1023.1 MOTIF MA1022.1 PHYPADRAFT_38837 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 1000 E= 0 0.251000 0.264000 0.257000 0.228000 0.343000 0.186000 0.254000 0.217000 0.463000 0.085000 0.129000 0.323000 0.827173 0.067932 0.023976 0.080919 0.855000 0.062000 0.001000 0.082000 0.644000 0.216000 0.054000 0.086000 0.061000 0.027000 0.860000 0.052000 0.150000 0.269000 0.207000 0.374000 0.259259 0.174174 0.307307 0.259259 0.283283 0.262262 0.227227 0.227227 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1022.1 MOTIF MA1021.1 PHYPADRAFT_48267 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 1000 E= 0 0.154000 0.461000 0.154000 0.231000 0.000999 0.997003 0.000999 0.000999 0.997003 0.000999 0.000999 0.000999 0.000999 0.997003 0.000999 0.000999 0.052947 0.000999 0.945055 0.000999 0.000999 0.000999 0.000999 0.997003 0.000999 0.000999 0.997003 0.000999 0.143000 0.642000 0.072000 0.143000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1021.1