MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF MA1114.1 PBX3 letter-probability matrix: alength= 4 w= 17 nsites= 7021 E= 0 0.227176 0.243697 0.312206 0.216921 0.215069 0.245549 0.275459 0.263923 0.188007 0.263353 0.274605 0.274035 0.084888 0.032047 0.071642 0.811423 0.032474 0.032332 0.912406 0.022789 0.915254 0.017804 0.030480 0.036462 0.047714 0.112235 0.702037 0.138015 0.035180 0.028344 0.040593 0.895884 0.020795 0.034468 0.932916 0.011822 0.877938 0.015382 0.086028 0.020652 0.021364 0.929212 0.029768 0.019655 0.867540 0.018373 0.060533 0.053554 0.052557 0.058681 0.810568 0.078194 0.125908 0.196126 0.580687 0.097280 0.178180 0.378009 0.226606 0.217206 0.266201 0.230594 0.294545 0.208660 0.212933 0.256516 0.315767 0.214784 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1114.1 MOTIF MA0352.1 PDR1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 99 E= 0 0.080808 0.282828 0.151515 0.484848 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.130000 0.000000 0.870000 0.000000 0.020000 0.880000 0.080000 0.020000 0.080000 0.020000 0.880000 0.020000 0.101010 0.030303 0.838384 0.030303 0.620000 0.080000 0.220000 0.080000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0352.1 MOTIF MA0352.2 PDR1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 14 nsites= 144 E= 0 0.201389 0.326389 0.250000 0.222222 0.201389 0.222222 0.256944 0.319444 0.125000 0.111111 0.041667 0.722222 0.013889 0.062500 0.000000 0.923611 0.006944 0.972222 0.000000 0.020833 0.048611 0.902778 0.020833 0.027778 0.500000 0.006944 0.486111 0.006944 0.000000 0.916667 0.000000 0.083333 0.013889 0.006944 0.958333 0.020833 0.006944 0.006944 0.986111 0.000000 0.916667 0.006944 0.048611 0.027778 0.729167 0.055556 0.131944 0.083333 0.291667 0.263889 0.256944 0.187500 0.312500 0.201389 0.291667 0.194444 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0352.2 MOTIF MA0353.1 PDR3 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 203 E= 0 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0353.1 MOTIF MA0354.1 PDR8 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 99 E= 0 0.383838 0.151515 0.383838 0.080808 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.079208 0.079208 0.841584 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.130000 0.060000 0.060000 0.750000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0354.1 MOTIF MA0132.2 PDX1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 7129 E= 0 0.208024 0.309440 0.342404 0.140132 0.039342 0.332660 0.000000 0.627998 0.654538 0.309888 0.025024 0.010551 0.993728 0.006272 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.305891 0.170547 0.404067 0.119495 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0132.2 MOTIF MA0127.1 PEND letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 42 E= 0 0.714286 0.047619 0.190476 0.047619 0.142857 0.452381 0.166667 0.238095 0.023810 0.000000 0.047619 0.928571 0.095238 0.000000 0.095238 0.809524 0.071429 0.785714 0.047619 0.095238 0.000000 0.047619 0.047619 0.904762 0.047619 0.000000 0.023810 0.928571 0.761905 0.166667 0.047619 0.023810 0.095238 0.071429 0.000000 0.833333 0.047619 0.119048 0.333333 0.500000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0127.1 MOTIF UN0100.1 PGTG_04827 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 998 E= 0 0.395792 0.320641 0.183367 0.100200 0.101202 0.648297 0.057114 0.193387 0.000000 0.916834 0.000000 0.083166 0.000000 0.998998 0.000000 0.001002 0.000000 0.989980 0.000000 0.010020 0.001002 0.020040 0.000000 0.978958 0.105210 0.096192 0.563126 0.235471 0.137275 0.137275 0.382766 0.342685 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/UN0100.1 MOTIF MA0355.1 PHD1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 100 E= 0 0.360000 0.270000 0.190000 0.180000 0.090909 0.434343 0.393939 0.080808 0.373737 0.444444 0.151515 0.030303 0.000000 0.101010 0.000000 0.898990 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.990000 0.000000 0.010000 0.910000 0.010000 0.070000 0.010000 0.080000 0.220000 0.360000 0.340000 0.220000 0.420000 0.220000 0.140000 0.320000 0.280000 0.210000 0.190000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0355.1 MOTIF MA0457.1 PHDP letter-probability matrix: alength= 4 w= 7 nsites= 17 E= 0 0.235294 0.352941 0.000000 0.411765 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.941176 0.000000 0.000000 0.058824 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.058824 0.000000 0.058824 0.882353 0.470588 0.058824 0.235294 0.235294 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0457.1