MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF UN0460.1 Osr1-2-b letter-probability matrix: alength= 4 w= 20 nsites= 1000 E= 0 0.241000 0.240000 0.326000 0.193000 0.143856 0.220779 0.389610 0.245754 0.233000 0.370000 0.218000 0.179000 0.200000 0.249000 0.159000 0.392000 0.390609 0.199800 0.163836 0.245754 0.213000 0.389000 0.242000 0.156000 0.145000 0.573000 0.062000 0.220000 0.292000 0.009000 0.689000 0.010000 0.007000 0.020000 0.960000 0.013000 0.064000 0.018000 0.029000 0.889000 0.935936 0.004004 0.050050 0.010010 0.008000 0.005000 0.984000 0.003000 0.007007 0.889890 0.025025 0.078078 0.357357 0.211211 0.177177 0.254254 0.297000 0.202000 0.328000 0.173000 0.214214 0.274274 0.244244 0.267267 0.257742 0.269730 0.215784 0.256743 0.239000 0.234000 0.340000 0.187000 0.202000 0.243000 0.398000 0.157000 0.190000 0.151000 0.355000 0.304000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/UN0460.1 MOTIF MA1907.1 Otp letter-probability matrix: alength= 4 w= 20 nsites= 1000 E= 0 0.460000 0.104000 0.110000 0.326000 0.375000 0.117000 0.139000 0.369000 0.290000 0.140000 0.140000 0.430000 0.264000 0.125000 0.130000 0.481000 0.409000 0.120000 0.135000 0.336000 0.553554 0.132132 0.135135 0.179179 0.415415 0.122122 0.153153 0.309309 0.093000 0.131000 0.059000 0.717000 0.073926 0.042957 0.016983 0.866134 0.950000 0.015000 0.022000 0.013000 0.959000 0.009000 0.016000 0.016000 0.079000 0.019000 0.019000 0.883000 0.039000 0.032000 0.034000 0.895000 0.578000 0.062000 0.139000 0.221000 0.501000 0.117000 0.203000 0.179000 0.396396 0.178178 0.142142 0.283283 0.244000 0.152000 0.133000 0.471000 0.262000 0.138000 0.106000 0.494000 0.472000 0.106000 0.090000 0.332000 0.434000 0.108000 0.142000 0.316000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1907.1 MOTIF MA1908.1 Otx letter-probability matrix: alength= 4 w= 22 nsites= 1000 E= 0 0.304000 0.200000 0.216000 0.280000 0.305000 0.224000 0.202000 0.269000 0.277277 0.237237 0.210210 0.275275 0.258000 0.267000 0.231000 0.244000 0.258258 0.246246 0.272272 0.223223 0.258000 0.252000 0.276000 0.214000 0.295704 0.265734 0.231768 0.206793 0.169000 0.162000 0.096000 0.573000 0.086000 0.024000 0.015000 0.875000 0.915000 0.013000 0.032000 0.040000 0.933000 0.014000 0.025000 0.028000 0.040000 0.035000 0.089000 0.836000 0.064935 0.813187 0.060939 0.060939 0.055000 0.769000 0.077000 0.099000 0.123000 0.200000 0.548000 0.129000 0.263000 0.293000 0.219000 0.225000 0.256743 0.230769 0.191808 0.320679 0.259740 0.228771 0.184815 0.326673 0.320679 0.211788 0.182817 0.284715 0.312000 0.226000 0.191000 0.271000 0.303000 0.244000 0.193000 0.260000 0.288000 0.251000 0.192000 0.269000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1908.1 MOTIF MA1030.1 P0510F09.23 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 1000 E= 0 0.416000 0.113000 0.060000 0.411000 0.535000 0.024000 0.369000 0.072000 0.416000 0.562000 0.007000 0.015000 0.026000 0.962000 0.001000 0.011000 0.041000 0.928000 0.027000 0.004000 0.010000 0.001000 0.000000 0.989000 0.831169 0.031968 0.082917 0.053946 0.373000 0.132000 0.389000 0.106000 0.266000 0.258000 0.226000 0.250000 0.241000 0.256000 0.220000 0.283000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1030.1 MOTIF MA1961.1 PATZ1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 1000 E= 0 0.124582 0.331940 0.445652 0.097826 0.124582 0.288462 0.542642 0.044314 0.067726 0.228261 0.679766 0.024247 0.194816 0.077759 0.726589 0.000836 0.000836 0.000836 0.997492 0.000836 0.000836 0.000836 0.997492 0.000836 0.355351 0.489130 0.000836 0.154682 0.000836 0.000836 0.997492 0.000836 0.000836 0.040970 0.957358 0.000836 0.000836 0.034281 0.964047 0.000836 0.054348 0.000836 0.943980 0.000836 0.051003 0.392140 0.522575 0.034281 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1961.1 MOTIF MA0779.1 PAX1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 17 nsites= 5221 E= 0 0.060142 0.604673 0.272553 0.062632 0.000561 0.000000 0.984667 0.014772 0.049682 0.016985 0.000000 0.933333 0.000604 0.903602 0.000201 0.095593 0.943257 0.056215 0.000528 0.000000 0.000389 0.873007 0.000000 0.126604 0.000565 0.000377 0.998494 0.000565 0.000000 0.812396 0.187604 0.000000 0.572647 0.020941 0.011117 0.395295 0.002327 0.089890 0.000423 0.907360 0.000154 0.273162 0.718345 0.008338 0.857040 0.000479 0.142481 0.000000 0.186131 0.367969 0.277841 0.168060 0.015093 0.124822 0.006527 0.853559 0.140819 0.001825 0.711395 0.145961 0.281535 0.496222 0.222244 0.000000 0.385896 0.311870 0.113885 0.188349 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0779.1 MOTIF MA0067.2 PAX2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 17 nsites= 3575 E= 0 0.001399 0.265175 0.351329 0.382098 0.018336 0.701697 0.003558 0.276409 0.765957 0.013093 0.209220 0.011729 0.271888 0.238042 0.356364 0.133706 0.013414 0.247468 0.007939 0.731180 0.067564 0.449651 0.475537 0.007248 0.631214 0.000000 0.361289 0.007498 0.647137 0.019174 0.028762 0.304927 0.001110 0.201776 0.790452 0.006661 0.001919 0.979989 0.006031 0.012061 0.097832 0.002223 0.895775 0.004169 0.015360 0.021288 0.101859 0.861493 0.200391 0.000837 0.797377 0.001395 0.892411 0.006490 0.041937 0.059161 0.021117 0.955627 0.007752 0.015504 0.035220 0.153459 0.745912 0.065409 0.380993 0.112082 0.380780 0.126145 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0067.2 MOTIF MA0780.1 PAX3 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 10576 E= 0 0.188540 0.022977 0.037254 0.751229 0.980380 0.003949 0.011846 0.003825 0.993870 0.003002 0.001501 0.001626 0.001115 0.012512 0.002106 0.984267 0.001496 0.656815 0.007732 0.333957 0.335500 0.006000 0.657625 0.000875 0.986344 0.002731 0.007076 0.003849 0.000000 0.001756 0.001756 0.996488 0.007124 0.011914 0.005158 0.975804 0.841988 0.024693 0.020877 0.112442 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0780.1 MOTIF MA1546.1 PAX3 letter-probability matrix: alength= 4 w= 16 nsites= 1345 E= 0 0.150929 0.382900 0.160595 0.305576 0.069008 0.542206 0.285890 0.102896 0.000679 0.001358 0.912424 0.085540 0.112422 0.049068 0.003727 0.834783 0.005491 0.820012 0.014033 0.160464 0.983175 0.001463 0.013899 0.001463 0.008333 0.861538 0.001282 0.128846 0.106906 0.000664 0.892430 0.000000 0.002217 0.617886 0.375462 0.004435 0.146577 0.308036 0.094494 0.450893 0.380669 0.169517 0.102602 0.347212 0.694574 0.078553 0.182429 0.044444 0.034223 0.029432 0.016427 0.919918 0.051330 0.085343 0.032158 0.831169 0.775534 0.038084 0.062320 0.124062 0.289963 0.242379 0.269888 0.197770 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1546.1 MOTIF MA0068.2 PAX4 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 522 E= 0 0.070881 0.637931 0.090038 0.201149 0.107209 0.055453 0.221811 0.615527 0.985207 0.005917 0.000000 0.008876 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.014793 0.985207 0.048387 0.029570 0.026882 0.895161 0.748315 0.200000 0.024719 0.026966 0.243112 0.150729 0.539708 0.066451 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0068.2