MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF MA0727.1 NR3C2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 17 nsites= 48045 E= 0 0.174961 0.139203 0.420293 0.265543 0.351855 0.005290 0.630334 0.012522 0.001020 0.000143 0.997762 0.001074 0.446970 0.035124 0.169626 0.348281 0.998770 0.000499 0.000432 0.000299 0.000000 0.999900 0.000100 0.000000 0.962604 0.000804 0.030244 0.006347 0.162354 0.403796 0.069476 0.364374 0.424144 0.113908 0.201230 0.260718 0.534291 0.045060 0.326868 0.093781 0.008934 0.022191 0.000490 0.968385 0.000000 0.000153 0.999847 0.000000 0.000090 0.000516 0.000067 0.999326 0.335924 0.179448 0.032791 0.451837 0.000374 0.997476 0.000210 0.001939 0.012925 0.592716 0.013433 0.380926 0.210842 0.404234 0.180635 0.204289 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0727.1 MOTIF MA1112.1 NR4A1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 8381 E= 0 0.293998 0.207851 0.213459 0.284692 0.677843 0.052500 0.148550 0.121107 0.979000 0.001432 0.008591 0.010977 0.972080 0.019449 0.001790 0.006682 0.002625 0.022551 0.955614 0.019210 0.004057 0.002028 0.992006 0.001909 0.002028 0.003341 0.002506 0.992125 0.005369 0.992602 0.000000 0.002028 0.763274 0.049875 0.102732 0.084119 0.240902 0.278606 0.240067 0.240425 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1112.1 MOTIF MA1112.2 NR4A1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 15927 E= 0 0.218748 0.206128 0.261129 0.313995 0.280216 0.223708 0.212218 0.283858 0.898663 0.014818 0.051673 0.034846 0.958624 0.007346 0.020908 0.013122 0.984743 0.003893 0.008037 0.003328 0.026810 0.005776 0.780687 0.186727 0.018836 0.010423 0.939537 0.031205 0.022917 0.051736 0.085264 0.840083 0.004395 0.938595 0.009481 0.047529 0.949708 0.009481 0.020657 0.020154 0.279776 0.250330 0.255855 0.214039 0.328938 0.211590 0.244051 0.215420 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1112.2 MOTIF MA0160.1 NR4A2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 13 E= 0 0.615385 0.076923 0.230769 0.076923 0.928571 0.000000 0.071429 0.000000 0.000000 0.000000 0.928571 0.071429 0.214286 0.000000 0.785714 0.000000 0.142857 0.142857 0.000000 0.714286 0.000000 0.928571 0.000000 0.071429 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.230769 0.615385 0.153846 0.000000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0160.1 MOTIF MA0160.2 NR4A2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 623 E= 0 0.163724 0.216693 0.284109 0.335474 0.230924 0.162651 0.186747 0.419679 0.806950 0.000000 0.108108 0.084942 0.916667 0.000000 0.004386 0.078947 0.972093 0.023256 0.004651 0.000000 0.000000 0.000000 0.765550 0.234450 0.000000 0.000000 0.990521 0.009479 0.023256 0.085271 0.081395 0.810078 0.000000 0.933036 0.004464 0.062500 0.826087 0.015810 0.158103 0.000000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0160.2 MOTIF MA1147.1 NR4A2::RXRA letter-probability matrix: alength= 4 w= 15 nsites= 1001 E= 0 0.287712 0.211788 0.370629 0.129870 0.498498 0.124124 0.348348 0.029029 0.019980 0.010989 0.923077 0.045954 0.050949 0.006993 0.803197 0.138861 0.046046 0.134134 0.128128 0.691692 0.007000 0.824000 0.031000 0.138000 0.592000 0.038000 0.343000 0.027000 0.248248 0.060060 0.087087 0.604605 0.002000 0.069000 0.005000 0.924000 0.070000 0.082000 0.836000 0.012000 0.926000 0.054000 0.017000 0.003000 0.157000 0.830000 0.002000 0.011000 0.039960 0.936064 0.003996 0.019980 0.005000 0.535000 0.023000 0.437000 0.103896 0.472527 0.179820 0.243756 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1147.1 MOTIF MA1540.1 NR5A1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 4119 E= 0 0.186210 0.240592 0.307842 0.265356 0.152886 0.285184 0.152211 0.409720 0.016624 0.814961 0.141698 0.026717 0.933999 0.000000 0.065094 0.000907 0.909854 0.028281 0.030270 0.031595 0.000000 0.000000 0.979543 0.020457 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.127292 0.270513 0.050997 0.551198 0.013842 0.814317 0.043109 0.128732 0.650450 0.038225 0.265993 0.045332 0.206168 0.321272 0.199126 0.273434 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1540.1 MOTIF MA1540.2 NR5A1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 17 nsites= 4697 E= 0 0.317650 0.215244 0.264424 0.202683 0.240579 0.220141 0.253566 0.285714 0.276985 0.150522 0.400255 0.172238 0.626996 0.084735 0.134767 0.153502 0.150735 0.118799 0.601448 0.129019 0.080051 0.159038 0.155205 0.605706 0.034064 0.120077 0.027677 0.818182 0.015329 0.918884 0.040238 0.025548 0.912710 0.041090 0.026613 0.019587 0.923994 0.018310 0.034064 0.023632 0.022568 0.009581 0.949755 0.018097 0.018522 0.011284 0.945284 0.024910 0.082819 0.205237 0.036406 0.675538 0.014264 0.909304 0.023845 0.052587 0.894401 0.030658 0.032787 0.042155 0.188418 0.242282 0.338940 0.230360 0.209283 0.374069 0.208857 0.207792 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1540.2 MOTIF MA1541.1 NR6A1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 17 nsites= 897 E= 0 0.190635 0.219621 0.348941 0.240803 0.129310 0.239858 0.176471 0.454361 0.082999 0.599732 0.228916 0.088353 0.938220 0.004188 0.046073 0.011518 0.807207 0.081982 0.064865 0.045946 0.013265 0.009184 0.914286 0.063265 0.020496 0.012945 0.477886 0.488673 0.001003 0.074223 0.026078 0.898696 0.007202 0.921811 0.029835 0.041152 0.982456 0.000000 0.002193 0.015351 0.820513 0.087912 0.032051 0.059524 0.021127 0.015091 0.901408 0.062374 0.030950 0.011740 0.559232 0.398079 0.059594 0.121153 0.232482 0.586771 0.030046 0.690293 0.083975 0.195686 0.680851 0.015198 0.272796 0.031155 0.314732 0.197545 0.231027 0.256696 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1541.1 MOTIF MA0506.1 NRF1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 4624 E= 0 0.130190 0.081099 0.788711 0.000000 0.134732 0.865268 0.000000 0.000000 0.042388 0.040874 0.916739 0.000000 0.000000 0.868512 0.101211 0.030277 0.327422 0.402682 0.202206 0.067690 0.000000 0.087154 0.114187 0.798659 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.938149 0.000000 0.061851 0.000000 0.075476 0.924524 0.000000 0.016003 0.983997 0.000000 0.000000 0.485510 0.173875 0.340614 0.000000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0506.1