MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF MA0048.1 NHLH1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 54 E= 0 0.240741 0.240741 0.314815 0.203704 0.240741 0.722222 0.037037 0.000000 0.055556 0.092593 0.685185 0.166667 0.018519 0.981481 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.018519 0.018519 0.962963 0.000000 0.018519 0.925926 0.055556 0.000000 0.018519 0.018519 0.000000 0.962963 0.000000 0.000000 0.981481 0.018519 0.055556 0.685185 0.148148 0.111111 0.037037 0.000000 0.685185 0.277778 0.092593 0.314815 0.222222 0.370370 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0048.1 MOTIF MA0048.2 NHLH1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 3246 E= 0 0.242760 0.667283 0.055761 0.034196 0.156377 0.060719 0.734735 0.048168 0.001383 0.998617 0.000000 0.000000 0.998157 0.001382 0.000461 0.000000 0.000000 0.116621 0.839210 0.044169 0.040235 0.907795 0.051970 0.000000 0.000000 0.001840 0.001840 0.996320 0.000920 0.001841 0.996779 0.000460 0.101579 0.743308 0.035003 0.120110 0.065546 0.156629 0.460949 0.316876 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0048.2 MOTIF MA1529.1 NHLH2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 18 nsites= 21364 E= 0 0.226268 0.124274 0.455533 0.193924 0.168227 0.086571 0.542408 0.202793 0.143780 0.040932 0.709097 0.106192 0.230341 0.287446 0.229732 0.252481 0.256125 0.706299 0.030673 0.006903 0.090535 0.088479 0.720704 0.100282 0.000094 0.999579 0.000094 0.000234 0.998738 0.000000 0.001215 0.000047 0.000254 0.104129 0.850985 0.044633 0.022768 0.878963 0.098270 0.000000 0.000000 0.000655 0.000140 0.999205 0.000000 0.000094 0.999906 0.000000 0.030383 0.903635 0.012057 0.053926 0.009489 0.009218 0.947856 0.033437 0.050568 0.307807 0.064918 0.576706 0.145783 0.710370 0.045794 0.098053 0.258127 0.543634 0.063764 0.134475 0.168555 0.527570 0.105973 0.197903 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1529.1 MOTIF MA0344.1 NHP10 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 100 E= 0 0.200000 0.100000 0.600000 0.100000 0.078431 0.764706 0.078431 0.078431 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.666667 0.078431 0.176471 0.078431 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0344.1 MOTIF MA1793.1 NID1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 999 E= 0 0.194581 0.387940 0.244900 0.172578 0.116234 0.224888 0.028951 0.629927 0.131798 0.102644 0.092877 0.672681 0.961631 0.003891 0.014420 0.020058 0.017926 0.036099 0.014973 0.931002 0.023071 0.933172 0.015008 0.028749 0.043207 0.636520 0.069132 0.251141 0.412024 0.101604 0.281767 0.204605 0.245250 0.233289 0.221912 0.299549 0.368215 0.162173 0.158962 0.310650 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1793.1 MOTIF MA0196.1 NK7.1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 7 nsites= 35 E= 0 0.142857 0.142857 0.028571 0.685714 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.942857 0.000000 0.057143 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.114286 0.000000 0.142857 0.742857 0.171429 0.000000 0.200000 0.628571 0.371429 0.000000 0.628571 0.000000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0196.1 MOTIF MA1645.1 NKX2-2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 14 nsites= 26023 E= 0 0.267187 0.267417 0.188449 0.276947 0.363678 0.216654 0.186527 0.233140 0.280329 0.213580 0.243208 0.262883 0.093686 0.777466 0.088114 0.040733 0.023748 0.935365 0.006763 0.034124 0.912577 0.017792 0.009876 0.059755 0.018368 0.948891 0.016140 0.016601 0.018829 0.017369 0.011336 0.952465 0.015256 0.924490 0.032202 0.028052 0.819506 0.106521 0.022288 0.051685 0.768666 0.080852 0.087077 0.063405 0.265496 0.254659 0.291627 0.188218 0.306652 0.228336 0.213427 0.251585 0.284863 0.240979 0.232487 0.241671 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1645.1 MOTIF MA0672.1 NKX2-3 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 9278 E= 0 0.384997 0.235180 0.214378 0.165445 0.127023 0.581985 0.282211 0.008782 0.004022 0.982007 0.000000 0.013971 0.962248 0.010164 0.001659 0.025928 0.000862 0.999138 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.001936 0.998064 0.000000 0.091906 0.000000 0.908094 0.383038 0.131051 0.454931 0.030979 0.641499 0.063403 0.126599 0.168499 0.341668 0.296831 0.300496 0.061005 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0672.1 MOTIF MA2003.1 NKX2-4 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 2116 E= 0 0.181947 0.560019 0.229206 0.028828 0.010487 0.887640 0.005243 0.096629 0.771484 0.082682 0.011068 0.134766 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.020644 0.000826 0.978530 0.031344 0.246534 0.007836 0.714286 0.163526 0.366756 0.430686 0.039031 0.816678 0.038594 0.039283 0.105445 0.351736 0.299792 0.268032 0.080439 0.302378 0.368630 0.189128 0.139864 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA2003.1 MOTIF MA0063.2 NKX2-5 letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 5444 E= 0 0.316495 0.188097 0.309882 0.185525 0.280309 0.302351 0.242101 0.175239 0.017634 0.918810 0.004409 0.059148 0.963630 0.008817 0.013960 0.013593 0.026451 0.936444 0.009001 0.028104 0.024798 0.015062 0.011205 0.948935 0.040779 0.793350 0.011389 0.154482 0.885195 0.022043 0.039860 0.052902 0.905768 0.030309 0.018001 0.045922 0.272777 0.258266 0.271492 0.197465 0.335599 0.229794 0.199118 0.235489 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0063.2