MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF MA0119.1 NFIC::TLX1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 14 nsites= 16 E= 0 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.875000 0.062500 0.000000 0.062500 0.125000 0.500000 0.312500 0.062500 0.125000 0.500000 0.250000 0.125000 0.437500 0.062500 0.312500 0.187500 0.250000 0.187500 0.125000 0.437500 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.875000 0.000000 0.062500 0.062500 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0119.1 MOTIF MA0025.1 NFIL3 letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 23 E= 0 0.043478 0.000000 0.000000 0.956522 0.000000 0.000000 0.086957 0.913043 0.956522 0.000000 0.000000 0.043478 0.000000 0.347826 0.000000 0.652174 0.086957 0.000000 0.913043 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.956522 0.000000 0.043478 0.000000 0.000000 0.478261 0.173913 0.347826 0.304348 0.217391 0.304348 0.173913 0.217391 0.217391 0.130435 0.434783 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0025.1 MOTIF MA0025.2 NFIL3 letter-probability matrix: alength= 4 w= 13 nsites= 22996 E= 0 0.276918 0.169769 0.244173 0.309141 0.393155 0.169421 0.315751 0.121673 0.037833 0.029614 0.022526 0.910028 0.020351 0.009045 0.074535 0.896069 0.928553 0.009567 0.043051 0.018829 0.028657 0.065707 0.021395 0.884241 0.063489 0.020308 0.889676 0.026526 0.059054 0.522004 0.019743 0.399200 0.950078 0.023613 0.007436 0.018873 0.952818 0.010915 0.015655 0.020612 0.095364 0.215646 0.117455 0.571534 0.333580 0.244825 0.180553 0.241042 0.291007 0.214342 0.194903 0.299748 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0025.2 MOTIF MA0671.1 NFIX letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 32864 E= 0 0.241936 0.268074 0.265488 0.224501 0.238315 0.186648 0.330301 0.244736 0.188773 0.162262 0.098931 0.550034 0.003695 0.005207 0.920019 0.071079 0.000083 0.909026 0.090089 0.000802 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.928781 0.063023 0.005087 0.003109 0.666518 0.027501 0.257327 0.048654 0.251065 0.275043 0.277964 0.195929 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0671.1 MOTIF MA1528.1 NFIX letter-probability matrix: alength= 4 w= 17 nsites= 17347 E= 0 0.183432 0.247132 0.382775 0.186661 0.155217 0.134041 0.116395 0.594346 0.006322 0.011498 0.118766 0.863415 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.094054 0.896898 0.000000 0.009049 0.409547 0.108959 0.293439 0.188055 0.180157 0.341289 0.221723 0.256832 0.176467 0.274934 0.345382 0.203217 0.197325 0.145789 0.457831 0.199055 0.077620 0.100692 0.062298 0.759391 0.000000 0.000000 0.974221 0.025779 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.885949 0.094795 0.003218 0.016038 0.364823 0.094819 0.394867 0.145491 0.164774 0.305794 0.330931 0.198501 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1528.1 MOTIF MA0105.1 NFKB1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 38 E= 0 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.026316 0.000000 0.973684 0.000000 0.657895 0.000000 0.342105 0.000000 0.500000 0.342105 0.026316 0.131579 0.184211 0.026316 0.078947 0.710526 0.026316 0.052632 0.052632 0.868421 0.052632 0.447368 0.000000 0.500000 0.052632 0.921053 0.000000 0.026316 0.000000 0.947368 0.000000 0.052632 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0105.1 MOTIF MA0105.2 NFKB1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 18 E= 0 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.111111 0.000000 0.888889 0.000000 0.611111 0.055556 0.333333 0.000000 0.277778 0.000000 0.111111 0.611111 0.000000 0.277778 0.111111 0.611111 0.000000 0.722222 0.000000 0.277778 0.000000 0.944444 0.000000 0.055556 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.055556 0.833333 0.055556 0.055556 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0105.2 MOTIF MA0105.3 NFKB1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 5112 E= 0 0.111502 0.062402 0.524648 0.301448 0.010759 0.000000 0.989241 0.000000 0.023670 0.000000 0.958920 0.017410 0.614437 0.043818 0.319836 0.021909 0.435837 0.235524 0.158842 0.169797 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.010759 0.016432 0.972809 0.000000 0.298513 0.000000 0.701487 0.000000 0.950313 0.000000 0.049687 0.000000 0.983177 0.000000 0.016823 0.309077 0.468505 0.052621 0.169797 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0105.3 MOTIF MA0105.4 NFKB1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 13 nsites= 12262 E= 0 0.688387 0.164166 0.080737 0.066710 0.000472 0.000000 0.999266 0.000262 0.000000 0.000156 0.999739 0.000104 0.000205 0.000000 0.983478 0.016317 0.011614 0.000152 0.986864 0.001369 0.929534 0.004801 0.063574 0.002091 0.507574 0.001305 0.002319 0.488802 0.001391 0.082865 0.007332 0.908413 0.001748 0.984473 0.000411 0.013368 0.049517 0.950085 0.000100 0.000299 0.000417 0.999271 0.000104 0.000208 0.000621 0.998343 0.000207 0.000828 0.080679 0.084742 0.219426 0.615153 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0105.4 MOTIF MA0778.1 NFKB2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 13 nsites= 11783 E= 0 0.427820 0.208436 0.195706 0.168039 0.006124 0.005881 0.987752 0.000243 0.000062 0.000062 0.999688 0.000187 0.000481 0.000301 0.965250 0.033969 0.158606 0.000655 0.781954 0.058785 0.772421 0.090054 0.078901 0.058623 0.460091 0.005327 0.004528 0.530054 0.080227 0.095411 0.073661 0.750701 0.061968 0.800858 0.001382 0.135792 0.019732 0.976800 0.000077 0.003391 0.000157 0.999607 0.000079 0.000157 0.000619 0.997369 0.000232 0.001780 0.117299 0.255339 0.167614 0.459748 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0778.1