MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF MA1354.1 AT4G12670 letter-probability matrix: alength= 4 w= 29 nsites= 42 E= 0 0.000000 0.833333 0.000000 0.166667 0.071429 0.071429 0.000000 0.857143 0.976190 0.000000 0.000000 0.023810 0.976190 0.000000 0.000000 0.023810 0.928571 0.023810 0.023810 0.023810 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.095238 0.833333 0.023810 0.047619 0.000000 0.976190 0.000000 0.023810 0.023810 0.000000 0.023810 0.952381 0.904762 0.000000 0.023810 0.071429 0.952381 0.000000 0.047619 0.000000 0.928571 0.000000 0.071429 0.000000 0.023810 0.857143 0.000000 0.119048 0.000000 0.928571 0.047619 0.023810 0.142857 0.761905 0.023810 0.071429 0.023810 0.023810 0.000000 0.952381 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.809524 0.047619 0.023810 0.119048 0.857143 0.023810 0.047619 0.071429 0.047619 0.833333 0.047619 0.071429 0.166667 0.666667 0.000000 0.166667 0.000000 0.928571 0.000000 0.071429 0.190476 0.000000 0.000000 0.809524 0.904762 0.071429 0.000000 0.023810 0.952381 0.000000 0.000000 0.047619 0.952381 0.000000 0.023810 0.023810 0.119048 0.833333 0.000000 0.047619 0.000000 0.928571 0.023810 0.047619 0.000000 0.761905 0.095238 0.142857 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1354.1 MOTIF MA1736.1 AT5G04390 letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 1000 E= 0 0.175292 0.404007 0.083472 0.337229 0.400668 0.213689 0.058431 0.327212 0.382304 0.293823 0.118531 0.205342 0.145242 0.440735 0.120200 0.293823 0.270451 0.131886 0.088481 0.509182 0.270451 0.170284 0.000000 0.559265 0.000000 0.984975 0.000000 0.015025 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.963272 0.036728 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.288815 0.277129 0.180301 0.253756 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1736.1 MOTIF MA2031.1 AT5G04760 letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 4175 E= 0 0.394251 0.158323 0.160958 0.286467 0.207665 0.239281 0.154491 0.398563 0.002635 0.996647 0.000719 0.000000 0.055329 0.023952 0.022515 0.898204 0.042156 0.008623 0.006946 0.942275 0.970778 0.018922 0.009341 0.000958 0.028263 0.013174 0.030419 0.928144 0.016048 0.980599 0.002395 0.000958 0.137246 0.508024 0.057964 0.296766 0.314731 0.169820 0.177006 0.338443 0.305629 0.219880 0.125509 0.348982 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA2031.1 MOTIF MA1737.1 AT5G05090 letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 999 E= 0 0.325083 0.224972 0.224972 0.224972 0.248785 0.260211 0.048443 0.442561 0.825532 0.024528 0.024528 0.125413 0.000222 0.000222 0.999335 0.000222 0.999335 0.000222 0.000222 0.000222 0.000222 0.000222 0.000222 0.999335 0.287819 0.317618 0.000222 0.394341 0.000222 0.776894 0.000222 0.222663 0.025249 0.025249 0.723019 0.226482 0.299003 0.201779 0.297439 0.201779 0.322918 0.225694 0.225694 0.225694 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1737.1 MOTIF MA2040.1 AT5G05550 letter-probability matrix: alength= 4 w= 13 nsites= 2298 E= 0 0.367711 0.121845 0.201480 0.308964 0.209748 0.169713 0.142298 0.478242 0.017842 0.810705 0.018712 0.152742 0.069626 0.005657 0.142733 0.781984 0.010444 0.976501 0.006527 0.006527 0.003046 0.993473 0.000000 0.003481 0.005657 0.000000 0.992602 0.001741 0.045692 0.051784 0.877720 0.024804 0.025674 0.886858 0.004352 0.083116 0.055701 0.029591 0.886423 0.028285 0.593124 0.090513 0.186249 0.130113 0.259791 0.278938 0.164056 0.297215 0.307659 0.125762 0.346388 0.220191 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA2040.1 MOTIF MA1196.1 AT5G05790 letter-probability matrix: alength= 4 w= 15 nsites= 587 E= 0 0.543441 0.134583 0.100511 0.221465 0.502555 0.003407 0.056218 0.437819 0.027257 0.579216 0.068143 0.325383 0.236797 0.592845 0.114140 0.056218 0.000000 0.037479 0.000000 0.962521 0.011925 0.190801 0.025554 0.771721 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.226576 0.279387 0.025554 0.468484 0.202726 0.119250 0.097104 0.580920 0.223169 0.340716 0.197615 0.238501 0.597956 0.000000 0.044293 0.357751 0.156729 0.202726 0.063032 0.577513 0.255537 0.436116 0.069847 0.238501 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1196.1 MOTIF UN0357.1 AT5G23930 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 2074 E= 0 0.109932 0.498071 0.141273 0.250723 0.257956 0.637898 0.043877 0.060270 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.289296 0.020733 0.547252 0.142719 0.092093 0.499518 0.120058 0.288332 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/UN0357.1 MOTIF MA1365.1 AT5G47660 letter-probability matrix: alength= 4 w= 15 nsites= 244 E= 0 0.303279 0.073770 0.053279 0.569672 0.311475 0.122951 0.135246 0.430328 0.262295 0.299180 0.057377 0.381148 0.266393 0.258197 0.102459 0.372951 0.278689 0.086066 0.188525 0.446721 0.081967 0.032787 0.102459 0.782787 0.180328 0.004098 0.000000 0.815574 0.024590 0.061475 0.040984 0.872951 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.290984 0.032787 0.000000 0.676230 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.049180 0.581967 0.040984 0.327869 0.094262 0.098361 0.692623 0.114754 0.049180 0.340164 0.024590 0.586066 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1365.1 MOTIF MA1365.2 AT5G47660 letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 5429 E= 0 0.450912 0.099466 0.201879 0.247744 0.270031 0.211641 0.148830 0.369497 0.101124 0.013999 0.854485 0.030392 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.002579 0.000000 0.997421 0.976607 0.005526 0.006999 0.010868 0.964450 0.001474 0.009210 0.024866 0.906244 0.004237 0.019156 0.070363 0.882299 0.000184 0.006263 0.111254 0.411310 0.116228 0.126174 0.346288 0.370971 0.151409 0.125069 0.352551 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1365.2 MOTIF MA1195.1 AT5G56840 letter-probability matrix: alength= 4 w= 15 nsites= 600 E= 0 0.558333 0.075000 0.095000 0.271667 0.628333 0.033333 0.120000 0.218333 0.078333 0.540000 0.061667 0.320000 0.190000 0.596667 0.098333 0.115000 0.018333 0.040000 0.003333 0.938333 0.021667 0.031667 0.011667 0.935000 0.990000 0.005000 0.000000 0.005000 0.000000 0.003333 0.001667 0.995000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.010000 0.801667 0.000000 0.188333 0.720000 0.010000 0.078333 0.191667 0.373333 0.143333 0.050000 0.433333 0.555000 0.006667 0.016667 0.421667 0.423333 0.113333 0.041667 0.421667 0.328333 0.245000 0.146667 0.280000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1195.1