MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF MA0620.1 Mitf letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 999 E= 0 0.274274 0.193193 0.312312 0.220220 0.398000 0.081000 0.462000 0.059000 0.077000 0.095000 0.100000 0.728000 0.006993 0.988012 0.002997 0.001998 0.882000 0.052000 0.016000 0.050000 0.008000 0.725000 0.073000 0.194000 0.156000 0.033000 0.798000 0.013000 0.238238 0.191191 0.109109 0.461461 0.028000 0.028000 0.884000 0.060000 0.245000 0.215000 0.341000 0.199000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0620.1 MOTIF MA1899.1 Mitf letter-probability matrix: alength= 4 w= 20 nsites= 1001 E= 0 0.242757 0.254745 0.279720 0.222777 0.218000 0.280000 0.276000 0.226000 0.274000 0.255000 0.256000 0.215000 0.255255 0.265265 0.239239 0.240240 0.330669 0.183816 0.343656 0.141858 0.146146 0.190190 0.204204 0.459459 0.056943 0.844156 0.058941 0.039960 0.864136 0.032967 0.060939 0.041958 0.006993 0.894106 0.017982 0.080919 0.077077 0.026026 0.886887 0.010010 0.023000 0.021000 0.025000 0.931000 0.008008 0.028028 0.954955 0.009009 0.755756 0.105105 0.078078 0.061061 0.104000 0.416000 0.150000 0.330000 0.240000 0.266000 0.250000 0.244000 0.224000 0.270000 0.246000 0.260000 0.219780 0.285714 0.276723 0.217782 0.237000 0.285000 0.243000 0.235000 0.194000 0.355000 0.233000 0.218000 0.233000 0.279000 0.278000 0.210000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1899.1 MOTIF MA0622.1 Mlxip letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 1000 E= 0 0.053000 0.263000 0.421000 0.263000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.188000 0.063000 0.250000 0.499000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0622.1 MOTIF MA1900.1 Mnx letter-probability matrix: alength= 4 w= 20 nsites= 1000 E= 0 0.290000 0.135000 0.134000 0.441000 0.290000 0.170000 0.173000 0.367000 0.346000 0.160000 0.214000 0.280000 0.293293 0.202202 0.225225 0.279279 0.261738 0.206793 0.167832 0.363636 0.353000 0.191000 0.187000 0.269000 0.404595 0.142857 0.197802 0.254745 0.117000 0.099000 0.108000 0.676000 0.033966 0.041958 0.011988 0.912088 0.938000 0.013000 0.030000 0.019000 0.926000 0.017000 0.023000 0.034000 0.052947 0.026973 0.024975 0.895105 0.058000 0.056000 0.073000 0.813000 0.490000 0.087000 0.255000 0.168000 0.283000 0.235000 0.240000 0.242000 0.255000 0.228000 0.178000 0.339000 0.307000 0.190000 0.193000 0.310000 0.367000 0.154000 0.166000 0.313000 0.269730 0.160839 0.161838 0.407592 0.275000 0.164000 0.141000 0.420000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1900.1 MOTIF MA1524.2 Msgn1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 16 nsites= 542 E= 0 0.326568 0.177122 0.335793 0.160517 0.254613 0.169742 0.400369 0.175277 0.383764 0.073801 0.383764 0.158672 0.356089 0.038745 0.597786 0.007380 0.669742 0.236162 0.084871 0.009225 0.000000 0.994465 0.003690 0.001845 0.990775 0.005535 0.000000 0.003690 0.848708 0.014760 0.095941 0.040590 0.990775 0.007380 0.000000 0.001845 0.033210 0.011070 0.005535 0.950185 0.001845 0.003690 0.979705 0.014760 0.009225 0.014760 0.944649 0.031365 0.068266 0.258303 0.092251 0.581181 0.191882 0.208487 0.378229 0.221402 0.276753 0.215867 0.280443 0.226937 0.225092 0.291513 0.230627 0.252768 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1524.2 MOTIF MA1901.1 Msx letter-probability matrix: alength= 4 w= 20 nsites= 1000 E= 0 0.320000 0.158000 0.196000 0.326000 0.303303 0.165165 0.218218 0.313313 0.258000 0.188000 0.242000 0.312000 0.248000 0.206000 0.242000 0.304000 0.273000 0.221000 0.259000 0.247000 0.294294 0.214214 0.272272 0.219219 0.222000 0.211000 0.261000 0.306000 0.044000 0.045000 0.018000 0.893000 0.898102 0.010989 0.039960 0.050949 0.967968 0.006006 0.010010 0.016016 0.016983 0.009990 0.021978 0.951049 0.027027 0.029029 0.028028 0.915916 0.257000 0.045000 0.602000 0.096000 0.223000 0.264000 0.300000 0.213000 0.213786 0.236763 0.250749 0.298701 0.227000 0.247000 0.243000 0.283000 0.280000 0.217000 0.222000 0.281000 0.312312 0.198198 0.203203 0.286286 0.308000 0.180000 0.181000 0.331000 0.328328 0.163163 0.169169 0.339339 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1901.1 MOTIF MA0709.1 Msx3 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 8380 E= 0 0.164797 0.387470 0.297852 0.149881 0.035776 0.664832 0.003325 0.296067 0.944651 0.018036 0.026716 0.010596 0.984492 0.010456 0.004464 0.000587 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.013717 0.024374 0.011903 0.950006 0.958810 0.006751 0.010069 0.024371 0.320845 0.207255 0.309629 0.162272 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0709.1 MOTIF MA0100.1 Myb letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 51 E= 0 0.156863 0.078431 0.666667 0.098039 0.431373 0.019608 0.490196 0.058824 0.039216 0.941176 0.019608 0.000000 0.313725 0.333333 0.313725 0.039216 0.019608 0.000000 0.980392 0.000000 0.039216 0.019608 0.000000 0.941176 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.117647 0.000000 0.862745 0.019608 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0100.1 MOTIF MA0100.2 Myb letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 979 E= 0 0.090909 0.382022 0.194076 0.332993 0.231869 0.461696 0.000000 0.306435 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.929520 0.000000 0.070480 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.054137 0.000000 0.000000 0.945863 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.153218 0.424923 0.009193 0.412666 0.030644 0.969356 0.000000 0.000000 0.740552 0.008172 0.000000 0.251277 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0100.2 MOTIF MA0147.1 Myc letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 227 E= 0 0.295154 0.422907 0.158590 0.123348 0.149780 0.233480 0.572687 0.044053 0.035242 0.964758 0.000000 0.000000 0.955947 0.017621 0.022026 0.004405 0.000000 0.933921 0.013216 0.052863 0.083700 0.008811 0.898678 0.008811 0.039648 0.193833 0.000000 0.766520 0.000000 0.008811 0.951542 0.039648 0.000000 0.074890 0.806167 0.118943 0.198238 0.471366 0.105727 0.224670 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0147.1