MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF MA1895.1 Lhx3/4 letter-probability matrix: alength= 4 w= 20 nsites= 1001 E= 0 0.288711 0.183816 0.225774 0.301698 0.288000 0.189000 0.229000 0.294000 0.273000 0.197000 0.235000 0.295000 0.259740 0.210789 0.236763 0.292707 0.267000 0.202000 0.229000 0.302000 0.322000 0.185000 0.242000 0.251000 0.380380 0.163163 0.212212 0.244244 0.075000 0.069000 0.077000 0.779000 0.050050 0.051051 0.036036 0.862863 0.862000 0.037000 0.061000 0.040000 0.910000 0.023000 0.028000 0.039000 0.048000 0.029000 0.026000 0.897000 0.066000 0.073000 0.052000 0.809000 0.364000 0.160000 0.245000 0.231000 0.303000 0.221000 0.243000 0.233000 0.272272 0.224224 0.216216 0.287287 0.270000 0.222000 0.205000 0.303000 0.285000 0.218000 0.204000 0.293000 0.290709 0.215784 0.206793 0.286713 0.299000 0.214000 0.201000 0.286000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1895.1 MOTIF MA0704.1 Lhx4 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 2895 E= 0 0.145769 0.282211 0.170984 0.401036 0.053913 0.226584 0.000000 0.719503 0.744856 0.110082 0.079475 0.065586 0.949197 0.000000 0.000000 0.050803 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.131215 0.016770 0.852015 0.855286 0.011518 0.093325 0.039870 0.453886 0.155095 0.296028 0.094991 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0704.1 MOTIF MA0705.1 Lhx8 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 5093 E= 0 0.092676 0.508148 0.181622 0.217554 0.000000 0.281603 0.000000 0.718397 0.735626 0.023115 0.241260 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.286796 0.012116 0.701088 0.725253 0.000000 0.274747 0.000000 0.268264 0.227023 0.423409 0.081304 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0705.1 MOTIF MA0194.1 Lim1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 7 nsites= 18 E= 0 0.000000 0.111111 0.000000 0.888889 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.944444 0.000000 0.055556 0.000000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0194.1 MOTIF MA0195.1 Lim3 letter-probability matrix: alength= 4 w= 7 nsites= 20 E= 0 0.150000 0.350000 0.100000 0.400000 0.200000 0.000000 0.000000 0.800000 0.800000 0.000000 0.150000 0.050000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.100000 0.200000 0.700000 0.800000 0.000000 0.200000 0.000000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0195.1 MOTIF MA1896.1 Lmx-b letter-probability matrix: alength= 4 w= 20 nsites= 999 E= 0 0.287287 0.221221 0.223223 0.268268 0.285000 0.228000 0.219000 0.268000 0.272000 0.233000 0.225000 0.270000 0.264000 0.226000 0.227000 0.283000 0.278278 0.196196 0.180180 0.345345 0.415000 0.181000 0.173000 0.231000 0.439560 0.160839 0.183816 0.215784 0.099900 0.101898 0.123876 0.674326 0.033000 0.032000 0.014000 0.921000 0.914086 0.026973 0.024975 0.033966 0.936937 0.018018 0.020020 0.025025 0.035964 0.021978 0.020979 0.921079 0.066066 0.038038 0.043043 0.852853 0.572000 0.082000 0.182000 0.164000 0.328000 0.246000 0.216000 0.210000 0.257000 0.224000 0.219000 0.300000 0.248000 0.207000 0.204000 0.341000 0.261000 0.219000 0.205000 0.315000 0.260000 0.223000 0.222000 0.295000 0.260000 0.227000 0.230000 0.283000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1896.1 MOTIF UN0253.1 Lyl1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 16 nsites= 4606 E= 0 0.345853 0.201259 0.269648 0.183239 0.310248 0.271168 0.274859 0.143726 0.819800 0.034954 0.088363 0.056882 0.059922 0.788971 0.119409 0.031698 0.922710 0.049501 0.020191 0.007599 0.005862 0.006513 0.980026 0.007599 0.011724 0.007382 0.970039 0.010855 0.977421 0.010638 0.005428 0.006513 0.893617 0.013678 0.017152 0.075554 0.132002 0.047112 0.805254 0.015632 0.079679 0.178680 0.087277 0.654364 0.248806 0.132870 0.501954 0.116370 0.215154 0.157403 0.471776 0.155667 0.324577 0.209509 0.252497 0.213417 0.237516 0.195614 0.285931 0.280938 0.264872 0.207338 0.319800 0.207990 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/UN0253.1 MOTIF MA1459.1 M1BP letter-probability matrix: alength= 4 w= 18 nsites= 1461 E= 0 0.254620 0.285421 0.299795 0.160164 0.308693 0.301848 0.296372 0.093087 0.234086 0.221081 0.141684 0.403149 0.464066 0.236824 0.212183 0.086927 0.036961 0.566051 0.036961 0.360027 0.024641 0.003422 0.966461 0.005476 0.004107 0.002053 0.978097 0.015743 0.001369 0.112936 0.041752 0.843943 0.047228 0.939083 0.003422 0.010267 0.945927 0.019849 0.011636 0.022587 0.000684 0.947296 0.002738 0.049281 0.895277 0.010267 0.012320 0.082136 0.000684 0.953457 0.001369 0.044490 0.039699 0.088980 0.008214 0.863107 0.199179 0.049281 0.642710 0.108830 0.260096 0.329227 0.204654 0.206023 0.249829 0.268309 0.193018 0.288843 0.251882 0.313484 0.208761 0.225873 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1459.1 MOTIF MA0326.1 MAC1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 1740 E= 0 0.062069 0.000000 0.000000 0.937931 0.050597 0.000000 0.124503 0.824901 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.067095 0.000000 0.932905 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.555041 0.000000 0.379490 0.065469 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0326.1 MOTIF MA1520.1 MAF letter-probability matrix: alength= 4 w= 15 nsites= 2993 E= 0 0.323421 0.172402 0.196124 0.308052 0.067044 0.162417 0.016053 0.754485 0.026050 0.014653 0.956692 0.002605 0.104809 0.816873 0.015261 0.063058 0.120044 0.066448 0.031720 0.781788 0.080571 0.047170 0.698368 0.173891 0.752706 0.095198 0.032195 0.119900 0.112533 0.371329 0.416109 0.100029 0.141557 0.023816 0.108108 0.726519 0.158511 0.722540 0.040604 0.078345 0.789130 0.027989 0.085326 0.097554 0.063213 0.014925 0.825578 0.096283 0.015316 0.945756 0.017869 0.021059 0.736003 0.022521 0.175790 0.065687 0.326428 0.192115 0.162379 0.319078 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1520.1