MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF MA0590.1 LFY letter-probability matrix: alength= 4 w= 19 nsites= 384 E= 0 0.083333 0.270833 0.127604 0.518229 0.707447 0.034574 0.045213 0.212766 0.119658 0.160256 0.025641 0.694444 0.035398 0.012389 0.315044 0.637168 0.335106 0.000000 0.654255 0.010638 0.705882 0.133127 0.006192 0.154799 0.026178 0.952880 0.000000 0.020942 0.000000 0.949602 0.000000 0.050398 0.248021 0.005277 0.720317 0.026385 0.083732 0.416268 0.416268 0.083732 0.026385 0.720317 0.005277 0.248021 0.050398 0.000000 0.949602 0.000000 0.020942 0.000000 0.952880 0.026178 0.154799 0.006192 0.133127 0.705882 0.010638 0.654255 0.000000 0.335106 0.637168 0.315044 0.012389 0.035398 0.694444 0.025641 0.160256 0.119658 0.212766 0.045213 0.034574 0.707447 0.518229 0.127604 0.270833 0.083333 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0590.1 MOTIF MA1518.1 LHX1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 14954 E= 0 0.179484 0.275378 0.350007 0.195132 0.057602 0.560243 0.034719 0.347436 0.576240 0.187970 0.155485 0.080305 0.944543 0.017054 0.002463 0.035940 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.044814 0.220327 0.126180 0.608678 0.822960 0.027241 0.033955 0.115844 0.202153 0.336833 0.261335 0.199679 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1518.1 MOTIF MA0700.1 LHX2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 48415 E= 0 0.331282 0.218507 0.321099 0.129113 0.056188 0.721772 0.095605 0.126435 0.009746 0.243780 0.001032 0.745443 0.873696 0.109900 0.005197 0.011207 0.998700 0.000000 0.001300 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.004921 0.021281 0.053850 0.919948 0.847973 0.000403 0.142517 0.009108 0.397472 0.140759 0.316404 0.145365 0.158071 0.350160 0.247113 0.244656 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0700.1 MOTIF MA0700.2 LHX2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 6333 E= 0 0.374862 0.156008 0.199116 0.270014 0.357492 0.149850 0.197695 0.294963 0.141797 0.538765 0.165009 0.154429 0.006948 0.886152 0.005842 0.101058 0.914259 0.011211 0.008211 0.066319 0.950892 0.015948 0.012159 0.021001 0.020369 0.009158 0.010106 0.960366 0.010580 0.000790 0.000790 0.987841 0.990842 0.002053 0.000947 0.006158 0.342176 0.154113 0.231012 0.272699 0.305384 0.212064 0.163430 0.319122 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0700.2 MOTIF MA1519.1 LHX5 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 8750 E= 0 0.045029 0.390857 0.425257 0.138857 0.000000 0.293055 0.000000 0.706945 0.974485 0.025515 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.019688 0.003828 0.976483 0.978088 0.000000 0.021912 0.000000 0.384960 0.220697 0.207674 0.186669 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1519.1 MOTIF MA0658.1 LHX6 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 4438 E= 0 0.418432 0.173276 0.348806 0.059486 0.091888 0.523710 0.137398 0.247004 0.000000 0.053613 0.005933 0.940453 0.884945 0.017946 0.097109 0.000000 0.996855 0.003145 0.000000 0.000000 0.000000 0.021534 0.003296 0.975170 0.000000 0.144202 0.020331 0.835467 0.947683 0.000000 0.051890 0.000427 0.316629 0.120919 0.525626 0.036826 0.123507 0.372774 0.164075 0.339644 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0658.1 MOTIF MA0701.1 LHX9 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 1500 E= 0 0.188667 0.379333 0.199333 0.232667 0.076970 0.479680 0.000000 0.443350 0.740741 0.143210 0.045926 0.070123 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.035465 0.065435 0.149850 0.749251 0.875657 0.016346 0.065966 0.042032 0.372248 0.147432 0.352902 0.127418 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0701.1 MOTIF MA0701.2 LHX9 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 8740 E= 0 0.044622 0.695080 0.120824 0.139474 0.000000 0.344470 0.000000 0.655530 0.920455 0.076515 0.000000 0.003030 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.027222 0.972778 0.952194 0.000000 0.047806 0.000000 0.372120 0.166722 0.320276 0.140882 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0701.2 MOTIF MA1185.1 LHY letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 599 E= 0 0.854758 0.001669 0.051753 0.091820 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.996661 0.003339 0.000000 0.000000 0.000000 0.013356 0.008347 0.978297 0.005008 0.000000 0.005008 0.989983 0.085142 0.010017 0.000000 0.904841 0.287145 0.076795 0.056761 0.579299 0.188648 0.240401 0.195326 0.375626 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1185.1 MOTIF MA0619.1 LIN54 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 999 E= 0 0.411411 0.091091 0.212212 0.285285 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.212000 0.000000 0.788000 0.438000 0.000000 0.562000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.104000 0.211000 0.000000 0.685000 0.242757 0.248751 0.158841 0.349650 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0619.1