MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF MA1880.1 Hey letter-probability matrix: alength= 4 w= 22 nsites= 1000 E= 0 0.230000 0.300000 0.262000 0.208000 0.242242 0.284284 0.262262 0.211211 0.246000 0.278000 0.262000 0.214000 0.230769 0.266733 0.282717 0.219780 0.210210 0.270270 0.276276 0.243243 0.158158 0.203203 0.475475 0.163163 0.303303 0.176176 0.385385 0.135135 0.027000 0.921000 0.026000 0.026000 0.870130 0.021978 0.085914 0.021978 0.015000 0.931000 0.017000 0.037000 0.035000 0.024000 0.922000 0.019000 0.019019 0.085085 0.016016 0.879880 0.032967 0.027972 0.910090 0.028971 0.094000 0.554000 0.119000 0.233000 0.125000 0.642000 0.132000 0.101000 0.264000 0.268000 0.257000 0.211000 0.219000 0.294000 0.245000 0.242000 0.212000 0.265000 0.278000 0.245000 0.204795 0.270729 0.269730 0.254745 0.208000 0.270000 0.299000 0.223000 0.213000 0.280000 0.279000 0.228000 0.213000 0.279000 0.277000 0.231000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1880.1 MOTIF MA0739.1 Hic1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 9 nsites= 12392 E= 0 0.511378 0.058021 0.376856 0.053744 0.005361 0.036493 0.006313 0.951833 0.074639 0.046197 0.864786 0.014378 0.004473 0.984702 0.010825 0.000000 0.007861 0.983295 0.002769 0.006075 0.795268 0.176481 0.000265 0.027986 0.557827 0.180431 0.205960 0.055783 0.079510 0.717349 0.106165 0.096976 0.146257 0.438045 0.171148 0.244549 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0739.1 MOTIF MA1881.1 Hmbox1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 20 nsites= 1000 E= 0 0.260000 0.225000 0.265000 0.250000 0.268268 0.227227 0.251251 0.253253 0.261000 0.231000 0.245000 0.263000 0.265000 0.220000 0.237000 0.278000 0.280000 0.195000 0.204000 0.321000 0.393000 0.163000 0.195000 0.249000 0.407000 0.151000 0.167000 0.275000 0.097000 0.086000 0.090000 0.727000 0.040040 0.030030 0.014014 0.915916 0.891000 0.027000 0.030000 0.052000 0.929000 0.017000 0.024000 0.030000 0.048000 0.023000 0.025000 0.904000 0.076000 0.042000 0.041000 0.841000 0.523524 0.089089 0.190190 0.197197 0.331000 0.211000 0.225000 0.233000 0.280000 0.205000 0.221000 0.294000 0.241000 0.216000 0.207000 0.336000 0.247752 0.226773 0.220779 0.304695 0.245000 0.232000 0.234000 0.289000 0.245000 0.239000 0.245000 0.271000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1881.1 MOTIF UN0675.1 Hmga1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 25806 E= 0 0.315624 0.119740 0.132295 0.432341 0.327869 0.071301 0.111873 0.488956 0.180966 0.081144 0.401108 0.336782 0.970743 0.002751 0.007285 0.019220 0.031776 0.015229 0.016314 0.936681 0.040068 0.007750 0.011741 0.940440 0.026932 0.007518 0.005348 0.960203 0.025227 0.010230 0.009184 0.955359 0.029838 0.015849 0.011393 0.942920 0.946795 0.018329 0.013873 0.021003 0.375107 0.090987 0.094474 0.439433 0.358793 0.098543 0.099318 0.443347 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/UN0675.1 MOTIF MA0192.1 Hmx letter-probability matrix: alength= 4 w= 7 nsites= 20 E= 0 0.050000 0.150000 0.000000 0.800000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.050000 0.000000 0.000000 0.950000 0.000000 0.150000 0.000000 0.850000 0.200000 0.000000 0.800000 0.000000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0192.1 MOTIF MA0896.1 Hmx1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 17 nsites= 100 E= 0 0.340000 0.290000 0.240000 0.130000 0.170000 0.430000 0.270000 0.130000 0.360000 0.290000 0.260000 0.090000 0.690000 0.060000 0.160000 0.090000 0.130000 0.080000 0.720000 0.070000 0.010000 0.950000 0.000000 0.040000 0.870000 0.000000 0.120000 0.010000 0.880000 0.110000 0.000000 0.010000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.019802 0.059406 0.000000 0.920792 0.959596 0.000000 0.010101 0.030303 0.888889 0.010101 0.040404 0.060606 0.250000 0.150000 0.170000 0.430000 0.141414 0.222222 0.505051 0.131313 0.383838 0.292929 0.282828 0.040404 0.326733 0.128713 0.237624 0.306931 0.180000 0.200000 0.220000 0.400000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0896.1 MOTIF MA0897.1 Hmx2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 17 nsites= 100 E= 0 0.500000 0.200000 0.230000 0.070000 0.190000 0.440000 0.230000 0.140000 0.550000 0.190000 0.170000 0.090000 0.762376 0.059406 0.118812 0.059406 0.170000 0.150000 0.570000 0.110000 0.010101 0.979798 0.000000 0.010101 0.850000 0.000000 0.150000 0.000000 0.850000 0.130000 0.010000 0.010000 0.010000 0.000000 0.000000 0.990000 0.019802 0.059406 0.000000 0.920792 0.939394 0.000000 0.010101 0.050505 0.890000 0.010000 0.020000 0.080000 0.360000 0.190000 0.110000 0.340000 0.247525 0.207921 0.405941 0.138614 0.410000 0.270000 0.270000 0.050000 0.470000 0.100000 0.250000 0.180000 0.090909 0.070707 0.090909 0.747475 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0897.1 MOTIF MA0898.1 Hmx3 letter-probability matrix: alength= 4 w= 17 nsites= 100 E= 0 0.490000 0.210000 0.210000 0.090000 0.121212 0.494949 0.252525 0.131313 0.480000 0.230000 0.190000 0.100000 0.760000 0.070000 0.110000 0.060000 0.151515 0.101010 0.595960 0.151515 0.020000 0.940000 0.000000 0.040000 0.831683 0.000000 0.158416 0.009901 0.870000 0.120000 0.000000 0.010000 0.010000 0.000000 0.000000 0.990000 0.010101 0.040404 0.000000 0.949495 0.929293 0.000000 0.020202 0.050505 0.878788 0.020202 0.030303 0.070707 0.386139 0.148515 0.118812 0.346535 0.260000 0.180000 0.380000 0.180000 0.470000 0.210000 0.260000 0.060000 0.520000 0.110000 0.180000 0.190000 0.130000 0.100000 0.130000 0.640000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0898.1 MOTIF MA1882.1 Hnf1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 20 nsites= 1000 E= 0 0.452000 0.095000 0.103000 0.350000 0.322000 0.115000 0.122000 0.441000 0.290000 0.149000 0.166000 0.395000 0.307000 0.192000 0.204000 0.297000 0.273000 0.203000 0.186000 0.338000 0.371628 0.213786 0.187812 0.226773 0.386000 0.200000 0.239000 0.175000 0.102000 0.170000 0.121000 0.607000 0.029000 0.032000 0.008000 0.931000 0.946000 0.016000 0.022000 0.016000 0.942000 0.013000 0.027000 0.018000 0.024024 0.035035 0.024024 0.916917 0.038000 0.029000 0.055000 0.878000 0.540000 0.068000 0.254000 0.138000 0.288288 0.253253 0.262262 0.196196 0.260000 0.241000 0.204000 0.295000 0.307000 0.197000 0.186000 0.310000 0.307000 0.177000 0.158000 0.358000 0.320000 0.144000 0.136000 0.400000 0.420000 0.117000 0.117000 0.346000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1882.1 MOTIF MA1991.1 Hnf1A letter-probability matrix: alength= 4 w= 14 nsites= 1249 E= 0 0.188151 0.253002 0.255404 0.303443 0.141713 0.278623 0.309047 0.270616 0.082466 0.595677 0.163331 0.158527 0.014412 0.904724 0.031225 0.049640 0.015212 0.024019 0.005604 0.955164 0.012810 0.040833 0.048038 0.898319 0.012810 0.008807 0.009608 0.968775 0.024019 0.094476 0.827062 0.054444 0.900721 0.028022 0.012810 0.058447 0.084067 0.016813 0.024820 0.874299 0.068054 0.551641 0.301841 0.078463 0.124900 0.168135 0.079263 0.627702 0.144115 0.285028 0.279424 0.291433 0.200961 0.244195 0.281025 0.273819 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1991.1