MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF UN0129.1 HSFY2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 17 nsites= 24564 E= 0 0.350350 0.077064 0.397329 0.175256 0.178519 0.027706 0.100034 0.693742 0.013161 0.011560 0.015973 0.959306 0.065915 0.874257 0.059686 0.000142 0.000681 0.031083 0.929997 0.038239 0.990125 0.000766 0.002902 0.006207 0.856784 0.008162 0.024276 0.110778 0.252483 0.393991 0.061391 0.292135 0.074299 0.420266 0.424500 0.080935 0.287331 0.055854 0.390531 0.266284 0.111467 0.023458 0.008888 0.856187 0.006453 0.002420 0.000403 0.990724 0.038558 0.931301 0.029838 0.000303 0.000427 0.060412 0.873946 0.065215 0.958745 0.016705 0.010890 0.013661 0.697682 0.103300 0.026017 0.173000 0.176241 0.397549 0.077189 0.349021 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/UN0129.1 MOTIF MA0551.1 HY5 letter-probability matrix: alength= 4 w= 16 nsites= 320 E= 0 0.321875 0.187500 0.212500 0.278125 0.337500 0.175000 0.193750 0.293750 0.162500 0.171875 0.093750 0.571875 0.028125 0.025000 0.871875 0.075000 0.468750 0.515625 0.003125 0.012500 0.000000 0.990625 0.003125 0.006250 0.968750 0.003125 0.028125 0.000000 0.009375 0.971875 0.015625 0.003125 0.003125 0.015625 0.971875 0.009375 0.000000 0.028125 0.003125 0.968750 0.006250 0.003125 0.990625 0.000000 0.012500 0.003125 0.515625 0.468750 0.075000 0.871875 0.025000 0.028125 0.571875 0.093750 0.171875 0.162500 0.293750 0.193750 0.175000 0.337500 0.278125 0.212500 0.187500 0.321875 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0551.1 MOTIF MA1425.1 HYH letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 999 E= 0 0.201201 0.201201 0.396396 0.201201 0.373119 0.152457 0.321966 0.152457 0.283567 0.072144 0.072144 0.572144 0.023046 0.350701 0.524048 0.102204 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.048144 0.154463 0.749248 0.048144 0.203407 0.097194 0.392786 0.306613 0.177533 0.467402 0.177533 0.177533 0.321321 0.226226 0.226226 0.226226 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1425.1 MOTIF UN0674.1 Hand1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 13 nsites= 1062 E= 0 0.306968 0.220339 0.198682 0.274011 0.245763 0.278719 0.202448 0.273070 0.166667 0.120527 0.139360 0.573446 0.079096 0.800377 0.095104 0.025424 0.007533 0.975518 0.011299 0.005650 0.956685 0.015066 0.009416 0.018832 0.007533 0.022599 0.956685 0.013183 0.854991 0.031073 0.097928 0.016008 0.026365 0.899247 0.043315 0.031073 0.037665 0.905838 0.043315 0.013183 0.144068 0.221281 0.057439 0.577213 0.154426 0.338983 0.326742 0.179849 0.218456 0.279661 0.272128 0.229755 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/UN0674.1 MOTIF MA0092.1 Hand1::Tcf3 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 29 E= 0 0.137931 0.275862 0.344828 0.241379 0.344828 0.000000 0.517241 0.137931 0.068966 0.068966 0.034483 0.827586 0.000000 0.965517 0.000000 0.034483 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.103448 0.862069 0.034483 0.310345 0.482759 0.034483 0.172414 0.551724 0.000000 0.103448 0.344828 0.172414 0.137931 0.137931 0.551724 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0092.1 MOTIF MA1877.1 Hes-b letter-probability matrix: alength= 4 w= 22 nsites= 999 E= 0 0.209209 0.326326 0.262262 0.202202 0.218000 0.238000 0.347000 0.197000 0.224000 0.275000 0.253000 0.248000 0.232000 0.214000 0.320000 0.234000 0.239000 0.249000 0.270000 0.242000 0.249000 0.232000 0.288000 0.231000 0.239000 0.213000 0.233000 0.315000 0.097097 0.117117 0.697698 0.088088 0.146000 0.114000 0.645000 0.095000 0.046000 0.856000 0.048000 0.050000 0.759000 0.026000 0.180000 0.035000 0.041041 0.863864 0.044044 0.051051 0.046046 0.022022 0.907908 0.024024 0.043000 0.177000 0.040000 0.740000 0.036000 0.030000 0.897000 0.037000 0.168000 0.351000 0.204000 0.277000 0.180000 0.372000 0.246000 0.202000 0.280000 0.223000 0.237000 0.260000 0.241000 0.234000 0.283000 0.242000 0.238000 0.237000 0.275000 0.250000 0.234234 0.287287 0.245245 0.233233 0.236236 0.222222 0.300300 0.241241 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1877.1 MOTIF MA1878.1 Hes-c letter-probability matrix: alength= 4 w= 22 nsites= 999 E= 0 0.206206 0.367367 0.218218 0.208208 0.245245 0.206206 0.364364 0.184184 0.206000 0.305000 0.203000 0.286000 0.217782 0.194805 0.383616 0.203796 0.233000 0.279000 0.221000 0.267000 0.240240 0.267267 0.257257 0.235235 0.268000 0.212000 0.231000 0.289000 0.120000 0.183000 0.560000 0.137000 0.165000 0.059000 0.629000 0.147000 0.045000 0.870000 0.034000 0.051000 0.245000 0.018000 0.697000 0.040000 0.023000 0.844000 0.024000 0.109000 0.042000 0.015000 0.924000 0.019000 0.035000 0.107000 0.024000 0.834000 0.026000 0.020000 0.920000 0.034000 0.150150 0.323323 0.229229 0.297297 0.177000 0.317000 0.292000 0.214000 0.250000 0.218000 0.259000 0.273000 0.218000 0.258000 0.273000 0.251000 0.253000 0.206000 0.305000 0.236000 0.191000 0.373000 0.214000 0.222000 0.273000 0.189000 0.321000 0.217000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1878.1 MOTIF MA1099.1 Hes1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 1000 E= 0 0.187000 0.258000 0.377000 0.178000 0.209000 0.299000 0.396000 0.096000 0.040000 0.875000 0.014000 0.071000 0.743744 0.033033 0.141141 0.082082 0.029000 0.833000 0.056000 0.082000 0.164835 0.040959 0.768232 0.025974 0.115884 0.469530 0.066933 0.347652 0.058000 0.113000 0.661000 0.168000 0.226000 0.302000 0.151000 0.321000 0.217217 0.384384 0.198198 0.200200 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1099.1 MOTIF MA0616.1 Hes2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 13 nsites= 999 E= 0 0.214214 0.214214 0.214214 0.357357 0.341341 0.197197 0.197197 0.264264 0.341341 0.197197 0.197197 0.264264 0.245000 0.333000 0.245000 0.177000 0.083000 0.152000 0.682000 0.083000 0.603000 0.000000 0.397000 0.000000 0.282000 0.718000 0.000000 0.000000 0.930000 0.000000 0.070000 0.000000 0.174000 0.754000 0.036000 0.036000 0.123000 0.053000 0.771000 0.053000 0.053000 0.053000 0.053000 0.841000 0.143000 0.073000 0.711000 0.073000 0.238000 0.428000 0.167000 0.167000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0616.1 MOTIF MA1879.1 Hex letter-probability matrix: alength= 4 w= 20 nsites= 1001 E= 0 0.331668 0.145854 0.160839 0.361638 0.336000 0.152000 0.187000 0.325000 0.329000 0.168000 0.219000 0.284000 0.266000 0.213000 0.230000 0.291000 0.233000 0.251000 0.168000 0.348000 0.354000 0.167000 0.192000 0.287000 0.509000 0.115000 0.153000 0.223000 0.078078 0.055055 0.075075 0.791792 0.027000 0.071000 0.028000 0.874000 0.896000 0.014000 0.053000 0.037000 0.936000 0.016000 0.018000 0.030000 0.039000 0.013000 0.019000 0.929000 0.137137 0.046046 0.046046 0.770771 0.422422 0.094094 0.350350 0.133133 0.291000 0.256000 0.234000 0.219000 0.227000 0.229000 0.165000 0.379000 0.268268 0.209209 0.179179 0.343343 0.322000 0.173000 0.191000 0.314000 0.313313 0.169169 0.183183 0.334334 0.303303 0.174174 0.151151 0.371371 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1879.1