MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF UN0567.1 HOXD12::ELK3 letter-probability matrix: alength= 4 w= 17 nsites= 1067 E= 0 0.238988 0.158388 0.262418 0.340206 0.067690 0.046755 0.140265 0.745290 0.100559 0.027135 0.019952 0.852354 0.264042 0.027215 0.090330 0.618413 0.951872 0.026738 0.008021 0.013369 0.043588 0.393965 0.062028 0.500419 0.105904 0.112465 0.405811 0.375820 0.701031 0.002812 0.281162 0.014995 0.006678 0.891486 0.101836 0.000000 0.066667 0.857831 0.075502 0.000000 0.023915 0.015058 0.945970 0.015058 0.008197 0.007286 0.972678 0.011840 0.974453 0.000000 0.000912 0.024635 0.746853 0.013986 0.000000 0.239161 0.181384 0.129674 0.668258 0.020684 0.109653 0.223055 0.125586 0.541706 0.276217 0.159176 0.262172 0.302434 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/UN0567.1 MOTIF UN0568.1 HOXD12::ETV1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 16 nsites= 7981 E= 0 0.498058 0.061646 0.290816 0.149480 0.130529 0.574192 0.277425 0.017855 0.032543 0.957421 0.009732 0.000304 0.002526 0.002526 0.994158 0.000790 0.000634 0.000000 0.997781 0.001585 0.996676 0.001266 0.001741 0.000317 0.916182 0.014552 0.000000 0.069267 0.025669 0.000000 0.973558 0.000773 0.002520 0.003308 0.002520 0.991652 0.063056 0.721569 0.000794 0.214581 0.278573 0.003408 0.715292 0.002727 0.000792 0.000000 0.001426 0.997781 0.837791 0.009182 0.001331 0.151697 0.991340 0.000787 0.001102 0.006771 0.937323 0.039750 0.002084 0.020843 0.350540 0.138342 0.215375 0.295743 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/UN0568.1 MOTIF UN0569.1 HOXD12::ETV4 letter-probability matrix: alength= 4 w= 16 nsites= 40681 E= 0 0.533099 0.124948 0.202109 0.139844 0.091839 0.691466 0.207975 0.008721 0.031012 0.967210 0.001455 0.000323 0.001001 0.000767 0.997732 0.000500 0.001267 0.000500 0.997233 0.001000 0.997898 0.001101 0.000500 0.000500 0.935067 0.022009 0.000469 0.042455 0.039581 0.001570 0.958592 0.000256 0.001027 0.002088 0.005568 0.991316 0.018778 0.762058 0.000178 0.218986 0.076722 0.001169 0.920110 0.002000 0.000267 0.001034 0.001034 0.997665 0.735197 0.003835 0.000000 0.260969 0.997798 0.000000 0.000267 0.001935 0.960162 0.016661 0.000963 0.022214 0.534336 0.263290 0.061752 0.140622 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/UN0569.1 MOTIF MA0909.1 HOXD13 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 1087 E= 0 0.045998 0.632935 0.270469 0.050598 0.017045 0.572443 0.005682 0.404830 0.609389 0.307352 0.000000 0.083260 0.924731 0.000000 0.036290 0.038978 0.000000 0.001451 0.000000 0.998549 0.862155 0.000000 0.000000 0.137845 0.989928 0.004317 0.000000 0.005755 0.998549 0.001451 0.000000 0.000000 0.806565 0.087925 0.039859 0.065651 0.353198 0.300872 0.106105 0.239826 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0909.1 MOTIF MA0909.2 HOXD13 letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 368 E= 0 0.122283 0.494565 0.350543 0.032609 0.085302 0.482940 0.431759 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.724409 0.275591 0.000000 0.000000 0.986595 0.000000 0.013405 0.000000 0.016043 0.000000 0.000000 0.983957 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.968421 0.000000 0.031579 0.000000 0.834467 0.165533 0.000000 0.000000 0.584127 0.395238 0.020635 0.000000 0.163043 0.823370 0.008152 0.005435 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0909.2 MOTIF MA0912.2 HOXD3 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 15665 E= 0 0.017619 0.741462 0.052793 0.188126 0.000000 0.006414 0.000000 0.993586 0.951516 0.048484 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.234184 0.765816 0.868854 0.000000 0.131146 0.000000 0.049032 0.617154 0.218857 0.114957 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0912.2 MOTIF MA1507.1 HOXD4 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 3405 E= 0 0.348311 0.207048 0.339207 0.105433 0.000000 0.258008 0.000000 0.741992 0.452996 0.547004 0.000000 0.000000 0.950852 0.000000 0.049148 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.946096 0.000000 0.053904 0.000000 0.323642 0.154185 0.336858 0.185316 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1507.1 MOTIF MA0910.2 HOXD8 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 3628 E= 0 0.148015 0.111632 0.630375 0.109978 0.000000 0.592287 0.000000 0.407713 0.543101 0.449865 0.007034 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.041261 0.000000 0.117524 0.841215 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.259851 0.463764 0.151832 0.124552 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0910.2 MOTIF MA0913.2 HOXD9 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 19190 E= 0 0.067744 0.045440 0.852684 0.034132 0.000000 0.595733 0.002560 0.401707 0.614965 0.324827 0.025368 0.034839 0.960721 0.013269 0.025775 0.000235 0.012969 0.000000 0.000000 0.987031 0.750046 0.000367 0.000000 0.249587 0.992539 0.000000 0.000000 0.007461 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.744619 0.100205 0.055336 0.099841 0.253560 0.354703 0.132555 0.259182 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0913.2 MOTIF MA1387.1 HRS1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 15 nsites= 596 E= 0 0.392617 0.142617 0.216443 0.248322 0.211409 0.110738 0.486577 0.191275 0.436242 0.117450 0.154362 0.291946 0.657718 0.080537 0.075503 0.186242 0.169463 0.119128 0.057047 0.654362 0.221477 0.506711 0.162752 0.109060 0.241611 0.169463 0.419463 0.169463 0.709732 0.053691 0.102349 0.134228 0.919463 0.000000 0.033557 0.046980 0.000000 0.000000 0.679530 0.320470 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.041946 0.036913 0.006711 0.914430 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.072148 0.419463 0.046980 0.461409 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1387.1