MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF MA0903.1 HOXB3 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 12899 E= 0 0.348864 0.195829 0.244283 0.211024 0.198015 0.321368 0.310513 0.170104 0.114383 0.326556 0.039614 0.519446 0.539906 0.353748 0.058057 0.048289 0.900391 0.038043 0.044674 0.016892 0.000000 0.011495 0.000000 0.988505 0.031102 0.059172 0.000000 0.909726 0.949014 0.008755 0.000000 0.042231 0.352120 0.164276 0.366850 0.116753 0.248004 0.309714 0.231103 0.211179 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0903.1 MOTIF MA1499.1 HOXB4 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 11478 E= 0 0.407998 0.119969 0.383081 0.088953 0.000000 0.188053 0.000000 0.811947 0.398789 0.601211 0.000000 0.000000 0.971643 0.000000 0.028357 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.028981 0.971019 0.993979 0.000000 0.006021 0.000000 0.370211 0.118633 0.394291 0.116865 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1499.1 MOTIF MA0904.2 HOXB5 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 3068 E= 0 0.124185 0.365059 0.414928 0.095828 0.000000 0.149001 0.000000 0.850999 0.748414 0.251586 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.001442 0.006250 0.255048 0.737260 0.844671 0.000000 0.155329 0.000000 0.082464 0.397327 0.373533 0.146675 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0904.2 MOTIF MA1500.1 HOXB6 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 9944 E= 0 0.136464 0.248190 0.240849 0.374497 0.000000 0.102869 0.000000 0.897131 0.836418 0.087397 0.000000 0.076185 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.059279 0.098844 0.841876 0.034563 0.079417 0.354974 0.531046 0.505168 0.000000 0.494832 0.000000 0.087701 0.617845 0.126412 0.168042 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1500.1 MOTIF MA1501.1 HOXB7 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 828 E= 0 0.227053 0.173913 0.458937 0.140097 0.000000 0.000000 0.904918 0.095082 0.000000 0.289984 0.041195 0.668821 0.788571 0.211429 0.000000 0.000000 0.966161 0.033839 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.036088 0.963912 0.086813 0.003297 0.000000 0.909890 0.845761 0.000000 0.154239 0.000000 0.391304 0.199275 0.323671 0.085749 0.159420 0.427536 0.301932 0.111111 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1501.1 MOTIF MA1502.1 HOXB8 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 4474 E= 0 0.116674 0.119803 0.621144 0.142378 0.000000 0.572195 0.000000 0.427805 0.563689 0.425098 0.011213 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.053585 0.000000 0.102264 0.844151 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.262405 0.380867 0.185516 0.171211 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1502.1 MOTIF MA1503.1 HOXB9 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 2746 E= 0 0.226511 0.101966 0.670794 0.000728 0.000000 0.022812 0.000000 0.977188 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.258427 0.002408 0.739165 0.000000 0.000000 0.000000 0.000543 0.999457 0.794308 0.005175 0.001294 0.199224 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.968964 0.022094 0.000000 0.008943 0.652266 0.104462 0.071176 0.172096 0.226384 0.248643 0.141694 0.383279 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1503.1 MOTIF MA0905.1 HOXC10 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 5765 E= 0 0.259324 0.181093 0.556982 0.002602 0.007467 0.070362 0.000000 0.922171 0.085366 0.870190 0.003252 0.041192 0.448716 0.001021 0.546181 0.004082 0.008338 0.000000 0.000000 0.991662 0.672152 0.001552 0.001242 0.325054 0.966877 0.000903 0.001506 0.030714 0.901966 0.021348 0.024157 0.052528 0.598732 0.102741 0.099198 0.199329 0.307597 0.211395 0.141034 0.339975 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0905.1 MOTIF UN0566.1 HOXC10::TBX21 letter-probability matrix: alength= 4 w= 14 nsites= 809 E= 0 0.030902 0.096415 0.024722 0.847960 0.522029 0.392523 0.028037 0.057410 0.531915 0.014628 0.380319 0.073138 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.775141 0.015819 0.200000 0.009040 0.147129 0.820574 0.020335 0.011962 0.130631 0.448198 0.096847 0.324324 0.014269 0.161712 0.008323 0.815696 0.341398 0.580645 0.077957 0.000000 0.860728 0.000000 0.086575 0.052698 0.011004 0.006878 0.038514 0.943604 0.717613 0.002911 0.000000 0.279476 0.962132 0.000000 0.000000 0.037868 0.834550 0.074209 0.001217 0.090024 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/UN0566.1 MOTIF MA0651.1 HOXC11 letter-probability matrix: alength= 4 w= 11 nsites= 2459 E= 0 0.277755 0.105734 0.451403 0.165108 0.261372 0.120382 0.618246 0.000000 0.014838 0.016009 0.008590 0.960562 0.021698 0.936429 0.004568 0.037305 0.187851 0.000000 0.812149 0.000000 0.004854 0.000000 0.000000 0.995146 0.716178 0.002409 0.010036 0.271377 0.983213 0.000000 0.000000 0.016787 0.967742 0.016916 0.006688 0.008655 0.623416 0.109225 0.070705 0.196655 0.287398 0.255285 0.156098 0.301220 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0651.1