MEME version 4 ALPHABET= ACGT strands: + - Background letter frequencies A 0.25 C 0.25 G 0.25 T 0.25 MOTIF UN0559.1 HOXB13::ELK1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 16 nsites= 174 E= 0 0.448276 0.040230 0.396552 0.114943 0.144330 0.541237 0.216495 0.097938 0.348993 0.630872 0.000000 0.020134 0.051613 0.000000 0.948387 0.000000 0.045455 0.000000 0.954545 0.000000 0.986577 0.000000 0.000000 0.013423 0.794595 0.027027 0.075676 0.102703 0.073446 0.169492 0.757062 0.000000 0.012931 0.353448 0.000000 0.633621 0.246575 0.404110 0.109589 0.239726 0.590604 0.000000 0.288591 0.120805 0.127907 0.000000 0.017442 0.854651 0.696682 0.028436 0.075829 0.199052 0.924528 0.006289 0.050314 0.018868 0.854651 0.046512 0.063953 0.034884 0.472603 0.260274 0.075342 0.191781 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/UN0559.1 MOTIF MA0902.1 HOXB2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 10 nsites= 6678 E= 0 0.282570 0.225367 0.267296 0.224768 0.214254 0.286570 0.326995 0.172181 0.129120 0.249475 0.046414 0.574991 0.575861 0.302261 0.095057 0.026821 0.912058 0.025536 0.051482 0.010924 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.058104 0.093522 0.006554 0.841820 0.919972 0.024518 0.004683 0.050826 0.324599 0.195987 0.313071 0.166342 0.239707 0.321306 0.236712 0.202276 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0902.1 MOTIF MA0902.2 HOXB2 letter-probability matrix: alength= 4 w= 8 nsites= 6826 E= 0 0.118224 0.298564 0.428509 0.154703 0.007415 0.412038 0.000000 0.580547 0.662687 0.317997 0.019317 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.215558 0.784442 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 0.186493 0.297539 0.429681 0.086288 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA0902.2 MOTIF MA1957.1 HOXB2::ELK1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 14 nsites= 1563 E= 0 0.471529 0.060141 0.385157 0.083173 0.078000 0.679333 0.212667 0.030000 0.038109 0.944248 0.004234 0.013409 0.005917 0.000000 0.989645 0.004438 0.000000 0.000000 0.994796 0.005204 0.997019 0.000000 0.000000 0.002981 0.926593 0.000000 0.012465 0.060942 0.033970 0.016985 0.946921 0.002123 0.007190 0.103922 0.014379 0.874510 0.317807 0.471108 0.114976 0.096108 0.557153 0.029432 0.358658 0.054757 0.025992 0.032832 0.025992 0.915185 0.048219 0.192877 0.025753 0.733151 0.751263 0.035935 0.090399 0.122403 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/MA1957.1 MOTIF UN0560.1 HOXB2::ELK1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 15 nsites= 534 E= 0 0.050562 0.050562 0.024345 0.874532 0.693908 0.043091 0.233284 0.029718 0.841441 0.066667 0.037838 0.054054 0.031509 0.126036 0.067993 0.774461 0.061889 0.179153 0.285016 0.473941 0.634855 0.031120 0.334025 0.000000 0.025783 0.860037 0.095764 0.018416 0.038618 0.949187 0.002033 0.010163 0.002128 0.000000 0.993617 0.004255 0.006383 0.000000 0.993617 0.000000 0.979036 0.006289 0.010482 0.004193 0.889524 0.022857 0.015238 0.072381 0.106280 0.115942 0.752013 0.025765 0.000000 0.170576 0.076759 0.752665 0.287554 0.103004 0.405579 0.203863 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/UN0560.1 MOTIF UN0561.1 HOXB2::PAX1 letter-probability matrix: alength= 4 w= 17 nsites= 4076 E= 0 0.130275 0.390088 0.198234 0.281403 0.079980 0.578508 0.289990 0.051521 0.001935 0.001451 0.985732 0.010883 0.035154 0.009609 0.000000 0.955238 0.002610 0.967023 0.002610 0.027758 0.994389 0.005611 0.000000 0.000000 0.003183 0.926574 0.001364 0.068879 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.004160 0.808906 0.186934 0.000000 0.263067 0.282699 0.044172 0.410061 0.006432 0.321293 0.000000 0.672274 0.010146 0.898985 0.090648 0.000221 0.819461 0.000201 0.180338 0.000000 0.023569 0.119628 0.049515 0.807289 0.000714 0.029041 0.000000 0.970245 0.397694 0.002208 0.286801 0.313297 0.444417 0.352883 0.202209 0.000491 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/UN0561.1 MOTIF UN0562.1 HOXB2::PAX5 letter-probability matrix: alength= 4 w= 17 nsites= 886 E= 0 0.227991 0.381490 0.186230 0.204289 0.116384 0.531073 0.209040 0.143503 0.002022 0.007078 0.895854 0.095046 0.166396 0.103084 0.011364 0.719156 0.012573 0.856867 0.009671 0.120890 0.966194 0.003272 0.018539 0.011996 0.012311 0.839015 0.000000 0.148674 0.077963 0.001040 0.920998 0.000000 0.009182 0.739566 0.246244 0.005008 0.332957 0.248307 0.144470 0.274266 0.033860 0.407449 0.002257 0.556433 0.042060 0.760515 0.158798 0.038627 0.812099 0.002750 0.183318 0.001833 0.057983 0.154885 0.083400 0.703733 0.015697 0.164358 0.001847 0.818098 0.583278 0.008558 0.307439 0.100724 0.346501 0.355530 0.291196 0.006772 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/UN0562.1 MOTIF UN0563.1 HOXB2::PAX9 letter-probability matrix: alength= 4 w= 16 nsites= 2880 E= 0 0.070833 0.624306 0.255556 0.049306 0.000000 0.000000 0.991002 0.008998 0.040839 0.025018 0.002208 0.931935 0.000000 0.971988 0.000000 0.028012 0.992166 0.004309 0.002742 0.000783 0.001107 0.935031 0.003322 0.060539 0.000000 0.000000 0.998030 0.001970 0.000000 0.809265 0.188498 0.002236 0.257402 0.365180 0.093170 0.284248 0.004299 0.269705 0.000000 0.725996 0.007160 0.863621 0.127514 0.001705 0.850285 0.000000 0.149715 0.000000 0.034282 0.106214 0.084175 0.775329 0.000000 0.037614 0.000000 0.962386 0.405683 0.000395 0.243094 0.350829 0.405917 0.326233 0.267850 0.000000 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/UN0563.1 MOTIF UN0564.1 HOXB2::TBX21 letter-probability matrix: alength= 4 w= 13 nsites= 3745 E= 0 0.259012 0.109479 0.386382 0.245127 0.655003 0.042687 0.217635 0.084675 0.123692 0.130442 0.631792 0.114074 0.017682 0.060932 0.894624 0.026762 0.022609 0.115080 0.015826 0.846484 0.012211 0.009613 0.972720 0.005456 0.120994 0.253205 0.057425 0.568376 0.188969 0.026801 0.057098 0.727131 0.789707 0.002953 0.192997 0.014343 0.982935 0.004726 0.009976 0.002363 0.020792 0.090024 0.061048 0.828135 0.061313 0.082132 0.520476 0.336079 0.297798 0.096756 0.425068 0.180379 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/UN0564.1 MOTIF UN0565.1 HOXB2::TBX3 letter-probability matrix: alength= 4 w= 12 nsites= 1611 E= 0 0.579764 0.053383 0.268777 0.098076 0.100954 0.120032 0.742448 0.036566 0.000000 0.014463 0.964876 0.020661 0.000000 0.117702 0.002825 0.879473 0.002137 0.000000 0.997863 0.000000 0.039877 0.209356 0.034509 0.716258 0.100649 0.067370 0.073864 0.758117 0.768092 0.004112 0.217928 0.009868 0.964876 0.013430 0.011364 0.010331 0.007647 0.099405 0.099405 0.793543 0.048983 0.088725 0.550832 0.311460 0.259101 0.122056 0.418630 0.200214 URL http://jaspar.genereg.net/matrix/UN0565.1